58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0531 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0531  hypothetical protein  100 
 
 
338 aa  701    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0202558  normal  0.0548232 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0443  hypothetical protein  85.8 
 
 
366 aa  619  1e-176  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0370  hypothetical protein  43.96 
 
 
335 aa  236  3e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0441  hypothetical protein  44.44 
 
 
333 aa  230  2e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118426 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3390  hypothetical protein  40.56 
 
 
356 aa  230  3e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3632  hypothetical protein  39.31 
 
 
347 aa  226  6e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.960299  hitchhiker  0.000777335 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4018  hypothetical protein  37.35 
 
 
331 aa  194  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107588  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1133  hypothetical protein  32.19 
 
 
358 aa  157  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0289108 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1132  hypothetical protein  50 
 
 
300 aa  136  6.0000000000000005e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0290503 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2500  hypothetical protein  28.53 
 
 
339 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718285  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3631  hypothetical protein  28.49 
 
 
336 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.910562  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0305  hypothetical protein  24.1 
 
 
317 aa  88.2  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2527  hypothetical protein  36.09 
 
 
340 aa  87.4  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7309  hypothetical protein  26.2 
 
 
324 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0804  hypothetical protein  26.49 
 
 
349 aa  81.3  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.633218 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2434  hypothetical protein  26.41 
 
 
324 aa  79.7  0.00000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.259817  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00220  metalloendopeptidase-like membrane protein  37.21 
 
 
554 aa  76.3  0.0000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7968  hypothetical protein  36.89 
 
 
303 aa  73.2  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.844249  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2082  hypothetical protein  34.43 
 
 
364 aa  72.8  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0263451  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06630  metalloendopeptidase-like membrane protein  35.38 
 
 
547 aa  71.6  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.630482  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0930  hypothetical protein  26.59 
 
 
357 aa  70.9  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0294  hypothetical protein  24.73 
 
 
322 aa  67  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2764  hypothetical protein  26.39 
 
 
294 aa  64.3  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3878  LGFP repeat protein  37.19 
 
 
407 aa  62.8  0.000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0449633 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  30.11 
 
 
337 aa  58.2  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1943  hypothetical protein  24.41 
 
 
289 aa  55.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.762706  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2244  peptidase M23B  29.28 
 
 
1048 aa  53.9  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2934  hypothetical protein  32.38 
 
 
251 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.121978 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2904  hypothetical protein  32.38 
 
 
251 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2948  hypothetical protein  32.38 
 
 
251 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.717952  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5544  hypothetical protein  33.33 
 
 
437 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.0727339 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5946  hypothetical protein  33.33 
 
 
437 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20698  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3457  hypothetical protein  33.33 
 
 
220 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.102904  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0032  group B streptococcal surface immunogenic protein  29.81 
 
 
434 aa  50.8  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.85122  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2804  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  28.46 
 
 
364 aa  48.9  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0769202  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1152  Peptidase M15A  43.75 
 
 
1050 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000448461 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  27.22 
 
 
342 aa  48.5  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3215  hypothetical protein  33.33 
 
 
216 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  30.57 
 
 
348 aa  47.4  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2368  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  33.72 
 
 
288 aa  47.8  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.238108  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1508  NLP/P60 protein  23.16 
 
 
348 aa  46.2  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11745  hypothetical protein  33.33 
 
 
256 aa  45.4  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.409869 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3579  NLP/P60 protein  26.79 
 
 
323 aa  45.8  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1369  hypothetical protein  30.19 
 
 
251 aa  44.3  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0505  hypothetical protein  30.34 
 
 
364 aa  44.3  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5762  hypothetical protein  25.81 
 
 
322 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1194  hypothetical protein  31.11 
 
 
320 aa  43.9  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2686  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  25.15 
 
 
330 aa  43.9  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377535  normal  0.257604 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10325  hypothetical protein  30.77 
 
 
220 aa  43.9  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4940  Transglycosylase domain protein  30.85 
 
 
682 aa  43.5  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27870  hypothetical protein  30.95 
 
 
227 aa  43.5  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.86582  normal  0.0220968 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2529  hypothetical protein  52.63 
 
 
787 aa  43.1  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5355  hypothetical protein  34.21 
 
 
365 aa  43.1  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5444  hypothetical protein  34.21 
 
 
365 aa  43.1  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.421103 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5734  hypothetical protein  34.21 
 
 
365 aa  43.1  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.765847 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0423  hypothetical protein  33.33 
 
 
201 aa  42.7  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0414  hypothetical protein  33.33 
 
 
201 aa  42.7  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0402  hypothetical protein  33.33 
 
 
199 aa  42.7  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0472134  normal  0.221882 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>