59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7309 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7309  hypothetical protein  100 
 
 
324 aa  669    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3631  hypothetical protein  43.92 
 
 
336 aa  275  9e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.910562  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2527  hypothetical protein  49.14 
 
 
340 aa  246  3e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7968  hypothetical protein  33.77 
 
 
303 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.844249  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2500  hypothetical protein  34.85 
 
 
339 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718285  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2764  hypothetical protein  33.33 
 
 
294 aa  150  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2434  hypothetical protein  33.13 
 
 
324 aa  149  5e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.259817  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0305  hypothetical protein  31.93 
 
 
317 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0804  hypothetical protein  32.28 
 
 
349 aa  132  9e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.633218 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2082  hypothetical protein  48.09 
 
 
364 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0263451  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0294  hypothetical protein  33.66 
 
 
322 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0930  hypothetical protein  31.06 
 
 
357 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1133  hypothetical protein  28.44 
 
 
358 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0289108 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4018  hypothetical protein  28.17 
 
 
331 aa  91.3  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107588  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27870  hypothetical protein  49.37 
 
 
227 aa  89.4  8e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.86582  normal  0.0220968 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0441  hypothetical protein  38.13 
 
 
333 aa  88.6  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118426 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0443  hypothetical protein  27.64 
 
 
366 aa  87.8  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0370  hypothetical protein  36.69 
 
 
335 aa  85.9  8e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2244  peptidase M23B  47.37 
 
 
1048 aa  81.3  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0032  group B streptococcal surface immunogenic protein  37.37 
 
 
434 aa  79.7  0.00000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.85122  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0531  hypothetical protein  25.76 
 
 
338 aa  80.1  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0202558  normal  0.0548232 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1132  hypothetical protein  26.27 
 
 
300 aa  79.7  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0290503 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3390  hypothetical protein  26.27 
 
 
356 aa  79  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3481  Lytic transglycosylase catalytic  34.59 
 
 
767 aa  77.4  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0132558  hitchhiker  0.0026224 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5544  hypothetical protein  39.34 
 
 
437 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.0727339 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5946  hypothetical protein  39.34 
 
 
437 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20698  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3632  hypothetical protein  36.11 
 
 
347 aa  72  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.960299  hitchhiker  0.000777335 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1943  hypothetical protein  33.33 
 
 
289 aa  70.9  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.762706  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4940  Transglycosylase domain protein  37.27 
 
 
682 aa  70.5  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2375  surface antigen  43.33 
 
 
291 aa  69.7  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409403  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2368  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  43.48 
 
 
288 aa  68.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.238108  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00220  metalloendopeptidase-like membrane protein  38.64 
 
 
554 aa  68.2  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06630  metalloendopeptidase-like membrane protein  38.89 
 
 
547 aa  65.9  0.0000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.630482  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5947  hypothetical protein  35.92 
 
 
171 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.264862  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5545  hypothetical protein  35.92 
 
 
171 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.092464 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2904  hypothetical protein  37.1 
 
 
251 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2948  hypothetical protein  37.1 
 
 
251 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.717952  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2934  hypothetical protein  37.1 
 
 
251 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.121978 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3215  hypothetical protein  36.59 
 
 
216 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3457  hypothetical protein  40.38 
 
 
220 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.102904  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0540  hypothetical protein  30.63 
 
 
366 aa  60.1  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5762  hypothetical protein  39.34 
 
 
322 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0505  hypothetical protein  36.63 
 
 
364 aa  57  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5924  hypothetical protein  34.65 
 
 
370 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  36.27 
 
 
342 aa  56.2  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2686  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  29.73 
 
 
330 aa  55.8  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377535  normal  0.257604 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0402  hypothetical protein  36.79 
 
 
199 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0472134  normal  0.221882 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0414  hypothetical protein  36.79 
 
 
201 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0423  hypothetical protein  36.79 
 
 
201 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5444  hypothetical protein  35.85 
 
 
365 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.421103 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5355  hypothetical protein  35.85 
 
 
365 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5734  hypothetical protein  35.85 
 
 
365 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.765847 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11745  hypothetical protein  33.33 
 
 
256 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.409869 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10325  hypothetical protein  31.67 
 
 
220 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  26.63 
 
 
319 aa  49.3  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  25.27 
 
 
321 aa  47.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1672  hypothetical protein  30.83 
 
 
234 aa  47  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.658702  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5081  hypothetical protein  31.4 
 
 
232 aa  47  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2976  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  28.07 
 
 
523 aa  42.4  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>