64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0804 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0804  hypothetical protein  100 
 
 		 349 aa  706    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.633218 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0930  hypothetical protein  56.32 
 
 		 357 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2500  hypothetical protein  39.25 
 
 		 339 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718285  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3631  hypothetical protein  35.65 
 
 		 336 aa  189  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.910562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0305  hypothetical protein  35.48 
 
 		 317 aa  178  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2434  hypothetical protein  40.5 
 
 		 324 aa  170  4e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.259817  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2764  hypothetical protein  33.09 
 
 		 294 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7968  hypothetical protein  31.36 
 
 		 303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.844249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7309  hypothetical protein  32.34 
 
 		 324 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0294  hypothetical protein  33.88 
 
 		 322 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2527  hypothetical protein  32.87 
 
 		 340 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2082  hypothetical protein  36.46 
 
 		 364 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0263451  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4018  hypothetical protein  27.6 
 
 		 331 aa  110  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2244  peptidase M23B  46.34 
 
 		 1048 aa  98.6  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1133  hypothetical protein  27.3 
 
 		 358 aa  95.1  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0289108 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0443  hypothetical protein  26.72 
 
 		 366 aa  94.4  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0370  hypothetical protein  26.02 
 
 		 335 aa  93.2  5e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0441  hypothetical protein  38.71 
 
 		 333 aa  85.9  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118426 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3390  hypothetical protein  28.49 
 
 		 356 aa  85.1  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0531  hypothetical protein  25.89 
 
 		 338 aa  83.2  0.000000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0202558  normal  0.0548232 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00220  metalloendopeptidase-like membrane protein  38.38 
 
 		 554 aa  82.4  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3632  hypothetical protein  24.58 
 
 		 347 aa  82  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.960299  hitchhiker  0.000777335 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06630  metalloendopeptidase-like membrane protein  35.88 
 
 		 547 aa  81.6  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.630482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1943  hypothetical protein  44.94 
 
 		 289 aa  79.3  0.00000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.762706  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1132  hypothetical protein  23.72 
 
 		 300 aa  76.3  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0290503 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  31.61 
 
 		 340 aa  75.9  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27870  hypothetical protein  38.14 
 
 		 227 aa  72.4  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.86582  normal  0.0220968 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3215  hypothetical protein  39.84 
 
 		 216 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3457  hypothetical protein  41.67 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.102904  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0032  group B streptococcal surface immunogenic protein  34.09 
 
 		 434 aa  64.3  0.000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.85122  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0540  hypothetical protein  34.44 
 
 		 366 aa  62.4  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5946  hypothetical protein  39.76 
 
 		 437 aa  59.3  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5544  hypothetical protein  39.76 
 
 		 437 aa  59.3  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.0727339 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1194  hypothetical protein  34.59 
 
 		 320 aa  59.3  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4940  Transglycosylase domain protein  34.04 
 
 		 682 aa  59.3  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2375  surface antigen  38.55 
 
 		 291 aa  58.5  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409403  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2368  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  39.51 
 
 		 288 aa  58.5  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.238108  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2934  hypothetical protein  41.98 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.121978 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2948  hypothetical protein  41.98 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.717952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2904  hypothetical protein  41.98 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11745  hypothetical protein  41.98 
 
 		 256 aa  57  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.409869 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2804  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.33 
 
 		 364 aa  54.7  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0769202  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  25.67 
 
 		 342 aa  55.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  24.42 
 
 		 321 aa  52.8  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1369  hypothetical protein  30.95 
 
 		 251 aa  52  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3481  Lytic transglycosylase catalytic  34.19 
 
 		 767 aa  50.4  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0132558  hitchhiker  0.0026224 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1508  NLP/P60 protein  22.81 
 
 		 348 aa  50.1  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  28.06 
 
 		 334 aa  49.7  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  31.58 
 
 		 333 aa  49.3  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  28.26 
 
 		 331 aa  48.1  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5762  hypothetical protein  37.76 
 
 		 322 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3579  NLP/P60 protein  28.57 
 
 		 323 aa  46.2  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5924  hypothetical protein  28.68 
 
 		 370 aa  46.2  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3958  NLP/P60 protein  27.97 
 
 		 323 aa  45.8  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.068937  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1417  hypothetical protein  29.66 
 
 		 262 aa  44.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.140101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  22.94 
 
 		 306 aa  44.3  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5734  hypothetical protein  29.69 
 
 		 365 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.765847 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5444  hypothetical protein  29.69 
 
 		 365 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.421103 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5947  hypothetical protein  30.43 
 
 		 171 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.264862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5545  hypothetical protein  30.43 
 
 		 171 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.092464 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5355  hypothetical protein  29.69 
 
 		 365 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  26.67 
 
 		 345 aa  43.9  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0505  hypothetical protein  30 
 
 		 364 aa  43.5  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6766  NLP/P60 protein  25.42 
 
 		 350 aa  43.1  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>