47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_27870 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_27870  hypothetical protein  100 
 
 		 227 aa  452  1.0000000000000001e-126  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.86582  normal  0.0220968 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2244  peptidase M23B  36.88 
 
 		 1048 aa  95.5  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0032  group B streptococcal surface immunogenic protein  31.8 
 
 		 434 aa  95.1  7e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.85122  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2368  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  51.76 
 
 		 288 aa  92  6e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.238108  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2375  surface antigen  51.81 
 
 		 291 aa  91.3  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409403  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7309  hypothetical protein  49.37 
 
 		 324 aa  91.3  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2764  hypothetical protein  41.59 
 
 		 294 aa  86.7  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2527  hypothetical protein  42.57 
 
 		 340 aa  86.3  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0305  hypothetical protein  30.49 
 
 		 317 aa  82.4  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2434  hypothetical protein  37.93 
 
 		 324 aa  81.3  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.259817  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7968  hypothetical protein  41.18 
 
 		 303 aa  80.5  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.844249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2500  hypothetical protein  47.06 
 
 		 339 aa  80.5  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718285  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0930  hypothetical protein  37.61 
 
 		 357 aa  74.7  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0804  hypothetical protein  32.07 
 
 		 349 aa  74.7  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.633218 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2082  hypothetical protein  44.05 
 
 		 364 aa  70.5  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0263451  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0294  hypothetical protein  32.46 
 
 		 322 aa  70.1  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4940  Transglycosylase domain protein  30.86 
 
 		 682 aa  69.7  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3481  Lytic transglycosylase catalytic  33.79 
 
 		 767 aa  66.2  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0132558  hitchhiker  0.0026224 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5544  hypothetical protein  44.3 
 
 		 437 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.0727339 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5946  hypothetical protein  44.3 
 
 		 437 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3631  hypothetical protein  39.51 
 
 		 336 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.910562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1943  hypothetical protein  41.1 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.762706  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3457  hypothetical protein  37.5 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.102904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3215  hypothetical protein  35.71 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2904  hypothetical protein  35.71 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2948  hypothetical protein  35.71 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.717952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2934  hypothetical protein  35.71 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.121978 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0370  hypothetical protein  36.14 
 
 		 335 aa  56.6  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0656  chromosome segregation ATPases-like protein  33.33 
 
 		 526 aa  55.1  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0611009  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0441  hypothetical protein  38.55 
 
 		 333 aa  54.7  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118426 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11745  hypothetical protein  38.1 
 
 		 256 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.409869 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4018  hypothetical protein  34.15 
 
 		 331 aa  54.3  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5947  hypothetical protein  41.33 
 
 		 171 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.264862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5545  hypothetical protein  41.33 
 
 		 171 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.092464 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0540  hypothetical protein  31.78 
 
 		 366 aa  52  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3390  hypothetical protein  32.93 
 
 		 356 aa  50.1  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00220  metalloendopeptidase-like membrane protein  33.33 
 
 		 554 aa  48.9  0.00006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06630  metalloendopeptidase-like membrane protein  32.61 
 
 		 547 aa  48.5  0.00009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.630482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3632  hypothetical protein  31.71 
 
 		 347 aa  48.1  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.960299  hitchhiker  0.000777335 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5924  hypothetical protein  31.4 
 
 		 370 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5762  hypothetical protein  37.97 
 
 		 322 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1132  hypothetical protein  31.82 
 
 		 300 aa  46.2  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0290503 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0505  hypothetical protein  30.58 
 
 		 364 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0531  hypothetical protein  30.95 
 
 		 338 aa  43.9  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0202558  normal  0.0548232 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0443  hypothetical protein  26.92 
 
 		 366 aa  43.1  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1133  hypothetical protein  31.33 
 
 		 358 aa  42.4  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0289108 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0402  hypothetical protein  35.62 
 
 		 199 aa  41.6  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0472134  normal  0.221882 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>