53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1943 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1943  hypothetical protein  100 
 
 
289 aa  585  1e-166  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.762706  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5946  hypothetical protein  40.16 
 
 
437 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20698  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5544  hypothetical protein  40.16 
 
 
437 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.0727339 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0804  hypothetical protein  44.94 
 
 
349 aa  79  0.00000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.633218 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2764  hypothetical protein  36.67 
 
 
294 aa  74.7  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5947  hypothetical protein  36.52 
 
 
171 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.264862  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5545  hypothetical protein  36.52 
 
 
171 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.092464 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0930  hypothetical protein  43.82 
 
 
357 aa  73.9  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2434  hypothetical protein  40.7 
 
 
324 aa  73.2  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.259817  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3457  hypothetical protein  34.48 
 
 
220 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.102904  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7968  hypothetical protein  36.97 
 
 
303 aa  72  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.844249  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2500  hypothetical protein  31.67 
 
 
339 aa  70.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718285  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7309  hypothetical protein  33.33 
 
 
324 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0305  hypothetical protein  42.42 
 
 
317 aa  70.1  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0032  group B streptococcal surface immunogenic protein  38.55 
 
 
434 aa  70.1  0.00000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.85122  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4940  Transglycosylase domain protein  32.43 
 
 
682 aa  68.2  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10325  hypothetical protein  34.48 
 
 
220 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2904  hypothetical protein  33.62 
 
 
251 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2948  hypothetical protein  33.62 
 
 
251 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.717952  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2934  hypothetical protein  33.62 
 
 
251 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.121978 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0505  hypothetical protein  34.21 
 
 
364 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3215  hypothetical protein  32.76 
 
 
216 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2375  surface antigen  46.25 
 
 
291 aa  66.2  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409403  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11745  hypothetical protein  34.48 
 
 
256 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.409869 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2082  hypothetical protein  34.02 
 
 
364 aa  66.2  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0263451  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5924  hypothetical protein  35.71 
 
 
370 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2244  peptidase M23B  39.56 
 
 
1048 aa  65.1  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2527  hypothetical protein  39.53 
 
 
340 aa  65.1  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5081  hypothetical protein  33.62 
 
 
232 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5355  hypothetical protein  36.52 
 
 
365 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5444  hypothetical protein  36.52 
 
 
365 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.421103 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1672  hypothetical protein  33.62 
 
 
234 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.658702  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5734  hypothetical protein  36.52 
 
 
365 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.765847 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2368  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  47.37 
 
 
288 aa  63.9  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.238108  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0294  hypothetical protein  39.08 
 
 
322 aa  62  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27870  hypothetical protein  41.1 
 
 
227 aa  61.6  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.86582  normal  0.0220968 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0441  hypothetical protein  37.21 
 
 
333 aa  62  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118426 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5762  hypothetical protein  36.36 
 
 
322 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3631  hypothetical protein  37.78 
 
 
336 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.910562  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0370  hypothetical protein  33.72 
 
 
335 aa  59.3  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0423  hypothetical protein  30.36 
 
 
201 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0414  hypothetical protein  30.36 
 
 
201 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0402  hypothetical protein  30.36 
 
 
199 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0472134  normal  0.221882 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00220  metalloendopeptidase-like membrane protein  29.55 
 
 
554 aa  57.4  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0531  hypothetical protein  24.41 
 
 
338 aa  55.8  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0202558  normal  0.0548232 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3390  hypothetical protein  36.05 
 
 
356 aa  54.7  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3632  hypothetical protein  36.05 
 
 
347 aa  54.7  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.960299  hitchhiker  0.000777335 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0443  hypothetical protein  30.4 
 
 
366 aa  53.9  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1133  hypothetical protein  25.18 
 
 
358 aa  53.5  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0289108 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06630  metalloendopeptidase-like membrane protein  28.35 
 
 
547 aa  53.1  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.630482  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1132  hypothetical protein  29.69 
 
 
300 aa  52  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0290503 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4018  hypothetical protein  26.76 
 
 
331 aa  48.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107588  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1194  hypothetical protein  32.03 
 
 
320 aa  46.6  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>