60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2500 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2500  hypothetical protein  100 
 
 
339 aa  696    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718285  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0305  hypothetical protein  49.29 
 
 
317 aa  267  2e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2764  hypothetical protein  42.24 
 
 
294 aa  211  1e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2082  hypothetical protein  68.31 
 
 
364 aa  206  6e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0263451  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7968  hypothetical protein  41.67 
 
 
303 aa  203  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.844249  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0804  hypothetical protein  39.03 
 
 
349 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.633218 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2434  hypothetical protein  41.46 
 
 
324 aa  181  1e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.259817  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3631  hypothetical protein  35.4 
 
 
336 aa  177  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.910562  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0294  hypothetical protein  36.7 
 
 
322 aa  167  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0930  hypothetical protein  38.99 
 
 
357 aa  160  3e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7309  hypothetical protein  34.85 
 
 
324 aa  152  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2527  hypothetical protein  35.29 
 
 
340 aa  143  5e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0531  hypothetical protein  28.22 
 
 
338 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0202558  normal  0.0548232 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0443  hypothetical protein  27.37 
 
 
366 aa  103  5e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2244  peptidase M23B  47.75 
 
 
1048 aa  96.3  7e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1133  hypothetical protein  26.93 
 
 
358 aa  95.1  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0289108 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4018  hypothetical protein  27.12 
 
 
331 aa  93.6  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107588  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1132  hypothetical protein  25.57 
 
 
300 aa  93.6  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0290503 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0441  hypothetical protein  26.71 
 
 
333 aa  93.6  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118426 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0370  hypothetical protein  27.93 
 
 
335 aa  89.7  6e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3632  hypothetical protein  23.99 
 
 
347 aa  87  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.960299  hitchhiker  0.000777335 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0032  group B streptococcal surface immunogenic protein  40.62 
 
 
434 aa  85.5  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.85122  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3390  hypothetical protein  24.41 
 
 
356 aa  85.1  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0540  hypothetical protein  40 
 
 
366 aa  78.2  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27870  hypothetical protein  47.06 
 
 
227 aa  78.2  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.86582  normal  0.0220968 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2368  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  42.53 
 
 
288 aa  72.4  0.000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.238108  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1943  hypothetical protein  31.67 
 
 
289 aa  70.9  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.762706  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2375  surface antigen  41.67 
 
 
291 aa  69.3  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409403  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  35.15 
 
 
342 aa  68.9  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06630  metalloendopeptidase-like membrane protein  33.57 
 
 
547 aa  68.6  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.630482  normal 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4940  Transglycosylase domain protein  36.84 
 
 
682 aa  67.4  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  35.2 
 
 
340 aa  65.1  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3457  hypothetical protein  36.19 
 
 
220 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.102904  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  30.32 
 
 
321 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5544  hypothetical protein  31.73 
 
 
437 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.0727339 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3215  hypothetical protein  32.59 
 
 
216 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5946  hypothetical protein  31.73 
 
 
437 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20698  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2904  hypothetical protein  32.85 
 
 
251 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2948  hypothetical protein  32.85 
 
 
251 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.717952  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2934  hypothetical protein  32.85 
 
 
251 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.121978 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00220  metalloendopeptidase-like membrane protein  29.58 
 
 
554 aa  58.9  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5947  hypothetical protein  34.65 
 
 
171 aa  57  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.264862  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5545  hypothetical protein  34.65 
 
 
171 aa  57  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.092464 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11745  hypothetical protein  34.38 
 
 
256 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.409869 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5924  hypothetical protein  33.98 
 
 
370 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3481  Lytic transglycosylase catalytic  34.91 
 
 
767 aa  51.6  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0132558  hitchhiker  0.0026224 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5355  hypothetical protein  33.02 
 
 
365 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5734  hypothetical protein  33.02 
 
 
365 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.765847 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5444  hypothetical protein  33.02 
 
 
365 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.421103 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1194  hypothetical protein  40.28 
 
 
320 aa  48.9  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1508  NLP/P60 protein  22.65 
 
 
348 aa  46.6  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1672  hypothetical protein  28.95 
 
 
234 aa  45.4  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.658702  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5081  hypothetical protein  28.95 
 
 
232 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10325  hypothetical protein  25.69 
 
 
220 aa  44.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  30.98 
 
 
394 aa  44.3  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0423  hypothetical protein  33.66 
 
 
201 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0414  hypothetical protein  33.66 
 
 
201 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0402  hypothetical protein  33.66 
 
 
199 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0472134  normal  0.221882 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5762  hypothetical protein  32.04 
 
 
322 aa  42.7  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1369  hypothetical protein  27.87 
 
 
251 aa  42.7  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>