98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1194 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1194  hypothetical protein  100 
 
 		 320 aa  650    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1141  hypothetical protein  58.38 
 
 		 309 aa  192  4e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.617877  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2807  hypothetical protein  61.64 
 
 		 283 aa  192  4e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0224369  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0974  hypothetical protein  43.07 
 
 		 321 aa  191  1e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11160  hypothetical protein  42.34 
 
 		 315 aa  187  3e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2527  hypothetical protein  41.69 
 
 		 272 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000287689 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25980  hypothetical protein  42.91 
 
 		 287 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1131  hypothetical protein  45.52 
 
 		 301 aa  176  4e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1170  hypothetical protein  37.34 
 
 		 280 aa  176  5e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0379591  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3840  hypothetical protein  41.67 
 
 		 284 aa  175  8e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.427443  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3460  hypothetical protein  41.03 
 
 		 284 aa  171  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.907261  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0996  hypothetical protein  47.16 
 
 		 286 aa  170  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0633  Co/Zn/Cd efflux system component  44.54 
 
 		 312 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0706968  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1090  hypothetical protein  39.16 
 
 		 256 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.018463  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7951  hypothetical protein  34.85 
 
 		 312 aa  149  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3025  hypothetical protein  39.64 
 
 		 258 aa  147  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.144373  normal  0.932008 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8432  hypothetical protein  34.04 
 
 		 274 aa  145  7.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.774825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4302  hypothetical protein  47.93 
 
 		 305 aa  145  9e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.628164 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3901  hypothetical protein  33.89 
 
 		 293 aa  139  6e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0140637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0493  hypothetical protein  43.35 
 
 		 281 aa  138  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.580154  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1845  hypothetical protein  51.06 
 
 		 281 aa  132  9e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.661954  normal  0.35188 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1369  hypothetical protein  44.64 
 
 		 251 aa  125  9e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0487  Peptidase M23  52.24 
 
 		 379 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1417  hypothetical protein  46.15 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.140101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  48.8 
 
 		 329 aa  113  6e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5428  Peptidase M23  47.29 
 
 		 349 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2319  hypothetical protein  47.11 
 
 		 194 aa  107  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.229041  normal  0.0161406 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3348  hypothetical protein  47.11 
 
 		 194 aa  107  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.372059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1977  hypothetical protein  47.11 
 
 		 194 aa  107  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158034  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3471  hypothetical protein  47.11 
 
 		 194 aa  107  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2042  hypothetical protein  47.11 
 
 		 194 aa  106  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.936652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2543  hypothetical protein  43.7 
 
 		 275 aa  106  5e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.578338  decreased coverage  0.00000438668 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2395  hypothetical protein  43.7 
 
 		 261 aa  106  6e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00354329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0889  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 337 aa  106  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3850  hypothetical protein  46.28 
 
 		 194 aa  105  7e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2985  hypothetical protein  46.28 
 
 		 194 aa  105  7e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0072  hypothetical protein  46.28 
 
 		 200 aa  105  9e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.736738 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2996  hypothetical protein  46.28 
 
 		 194 aa  105  9e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000318278 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0244  hypothetical protein  46.28 
 
 		 192 aa  105  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0151406 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2414  hypothetical protein  46.28 
 
 		 203 aa  105  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.291745 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2417  hypothetical protein  46.28 
 
 		 194 aa  105  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0954159 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3999  hypothetical protein  46.28 
 
 		 194 aa  105  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5084  hypothetical protein  46.28 
 
 		 207 aa  105  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000555714 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3211  hypothetical protein  46.28 
 
 		 193 aa  105  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.729102 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4187  hypothetical protein  46.28 
 
 		 194 aa  104  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2275  hypothetical protein  42.34 
 
 		 282 aa  103  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.329742  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4566  hypothetical protein  46.28 
 
 		 203 aa  101  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.252363 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2128  hypothetical protein  40.88 
 
 		 295 aa  100  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.400478  hitchhiker  0.00659313 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4738  peptidase M23B  42.34 
 
 		 388 aa  97.4  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000208513 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1380  FG-GAP repeat-containing protein  41.88 
 
 		 514 aa  97.4  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0133276 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2244  peptidase M23B  43.33 
 
 		 1048 aa  96.3  6e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5544  hypothetical protein  27.52 
 
 		 437 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.0727339 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5946  hypothetical protein  27.52 
 
 		 437 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4302  peptidase M23B  34.74 
 
 		 387 aa  92.4  8e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.416455  normal  0.37822 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1573  peptidase M23B  54.55 
 
 		 348 aa  89.7  7e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0724492  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2152  hypothetical protein  38.89 
 
 		 178 aa  89.4  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.41449 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4522  hypothetical protein  38.3 
 
 		 275 aa  89  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.594874 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0688  Peptidase M23  34.81 
 
 		 383 aa  77.8  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.50956  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3442  Peptidase M23  38.21 
 
 		 546 aa  76.6  0.0000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1952  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  29.94 
 
 		 391 aa  76.6  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.383383  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2808  hypothetical protein  41.28 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4284  CHAP domain-containing protein  39.64 
 
 		 360 aa  75.1  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.838801  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4551  CHAP domain containing protein  30.86 
 
 		 357 aa  73.6  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.374294 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2503  LGFP repeat-containing protein  42.16 
 
 		 344 aa  73.2  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272639  normal  0.0821052 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0028  hypothetical protein  32.61 
 
 		 280 aa  72.4  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0642  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  29.03 
 
 		 386 aa  68.9  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4510  CHAP domain-containing protein  31.43 
 
 		 359 aa  68.2  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.160949  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0440  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  29.2 
 
 		 392 aa  67  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0824  Peptidase M23  31.71 
 
 		 378 aa  65.5  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20220  hypothetical protein  41.94 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.389671  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4426  CHAP domain containing protein  33.33 
 
 		 635 aa  63.9  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.649059 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3097  hypothetical protein  34.65 
 
 		 547 aa  63.2  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4183  CHAP domain-containing protein  31.62 
 
 		 358 aa  62.4  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00220  metalloendopeptidase-like membrane protein  31.17 
 
 		 554 aa  62.4  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06630  metalloendopeptidase-like membrane protein  32.26 
 
 		 547 aa  62  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.630482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2434  hypothetical protein  33.85 
 
 		 324 aa  60.8  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.259817  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0804  hypothetical protein  34.59 
 
 		 349 aa  58.9  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.633218 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3481  Lytic transglycosylase catalytic  36.08 
 
 		 767 aa  55.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0132558  hitchhiker  0.0026224 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0294  hypothetical protein  32.03 
 
 		 322 aa  53.9  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0305  hypothetical protein  34.88 
 
 		 317 aa  53.1  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3631  hypothetical protein  35.43 
 
 		 336 aa  53.1  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.910562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0930  hypothetical protein  31.21 
 
 		 357 aa  48.9  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2500  hypothetical protein  40.28 
 
 		 339 aa  48.5  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718285  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0370  hypothetical protein  32.98 
 
 		 335 aa  48.5  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7968  hypothetical protein  30.71 
 
 		 303 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.844249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2082  hypothetical protein  32.03 
 
 		 364 aa  47.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0263451  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1943  hypothetical protein  32.03 
 
 		 289 aa  47  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.762706  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0704  hypothetical protein  30.83 
 
 		 384 aa  47.4  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5944  hypothetical protein  26.4 
 
 		 209 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5542  hypothetical protein  26.4 
 
 		 209 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.0579814 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8932  NLP/P60 protein  33.68 
 
 		 367 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00108547  normal  0.263686 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1132  hypothetical protein  31.46 
 
 		 300 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0290503 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0443  hypothetical protein  31.11 
 
 		 366 aa  44.3  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2764  hypothetical protein  32.81 
 
 		 294 aa  45.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0441  hypothetical protein  26.67 
 
 		 333 aa  45.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118426 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1152  Peptidase M15A  29.41 
 
 		 1050 aa  45.1  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000448461 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0531  hypothetical protein  31.11 
 
 		 338 aa  44.3  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0202558  normal  0.0548232 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3632  hypothetical protein  32.22 
 
 		 347 aa  43.5  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.960299  hitchhiker  0.000777335 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>