107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1380 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1380  FG-GAP repeat-containing protein  100 
 
 		 514 aa  1027    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0133276 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1381  peptidase M23B  88.41 
 
 		 491 aa  590  1e-167  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.897006  normal  0.0374787 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2178  Integrins alpha chain  42.11 
 
 		 883 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.297382  hitchhiker  0.000212806 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2165  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  48.39 
 
 		 1094 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000701868 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2163  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  42.95 
 
 		 1201 aa  208  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120195 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2168  Integrins alpha chain  45.56 
 
 		 534 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000439039 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3124  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.95 
 
 		 868 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.199253  normal  0.898111 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2642  metallophosphoesterase  39.08 
 
 		 649 aa  170  6e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0441775  normal  0.87277 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3097  hypothetical protein  42.13 
 
 		 547 aa  155  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4328  hypothetical protein  31.9 
 
 		 288 aa  106  9e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1131  hypothetical protein  48.41 
 
 		 301 aa  101  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0487  Peptidase M23  51.38 
 
 		 379 aa  101  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2152  hypothetical protein  38.36 
 
 		 178 aa  100  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.41449 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1090  hypothetical protein  44.35 
 
 		 256 aa  99.4  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.018463  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11160  hypothetical protein  44.27 
 
 		 315 aa  96.7  8e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1194  hypothetical protein  49.15 
 
 		 320 aa  96.7  9e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3840  hypothetical protein  44.35 
 
 		 284 aa  96.7  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.427443  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2543  hypothetical protein  40.76 
 
 		 275 aa  95.5  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.578338  decreased coverage  0.00000438668 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3460  hypothetical protein  46.79 
 
 		 284 aa  94.7  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.907261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7951  hypothetical protein  48.18 
 
 		 312 aa  93.6  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2985  hypothetical protein  41.73 
 
 		 194 aa  93.2  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2395  hypothetical protein  43.44 
 
 		 261 aa  92  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00354329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2275  hypothetical protein  40.91 
 
 		 282 aa  92  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.329742  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2527  hypothetical protein  50.94 
 
 		 272 aa  92.4  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000287689 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3348  hypothetical protein  40.94 
 
 		 194 aa  91.3  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.372059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3471  hypothetical protein  40.94 
 
 		 194 aa  91.3  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4187  hypothetical protein  42.28 
 
 		 194 aa  91.3  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2319  hypothetical protein  40.94 
 
 		 194 aa  90.9  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.229041  normal  0.0161406 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3999  hypothetical protein  42.28 
 
 		 194 aa  90.9  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5428  Peptidase M23  44.2 
 
 		 349 aa  90.9  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1977  hypothetical protein  40.94 
 
 		 194 aa  90.5  7e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158034  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2996  hypothetical protein  40.94 
 
 		 194 aa  90.1  9e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000318278 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4302  hypothetical protein  38.46 
 
 		 305 aa  90.1  9e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.628164 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1141  hypothetical protein  44.95 
 
 		 309 aa  89.4  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.617877  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0072  hypothetical protein  40.94 
 
 		 200 aa  89.4  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.736738 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2414  hypothetical protein  40.94 
 
 		 203 aa  89.7  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.291745 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3850  hypothetical protein  40.94 
 
 		 194 aa  89.4  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2042  hypothetical protein  41.46 
 
 		 194 aa  89.4  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.936652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5084  hypothetical protein  41.46 
 
 		 207 aa  88.2  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000555714 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2807  hypothetical protein  46.36 
 
 		 283 aa  87.4  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0224369  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2128  hypothetical protein  40.91 
 
 		 295 aa  87  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.400478  hitchhiker  0.00659313 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4566  hypothetical protein  40.98 
 
 		 203 aa  87  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.252363 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0244  hypothetical protein  41.8 
 
 		 192 aa  87.4  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0151406 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2417  hypothetical protein  41.46 
 
 		 194 aa  87.4  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0954159 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3211  hypothetical protein  41.46 
 
 		 193 aa  87.4  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.729102 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  41.6 
 
 		 329 aa  86.7  8e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1845  hypothetical protein  47.12 
 
 		 281 aa  85.5  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.661954  normal  0.35188 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0974  hypothetical protein  52.04 
 
 		 321 aa  85.9  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0996  hypothetical protein  42.2 
 
 		 286 aa  80.1  0.00000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0633  Co/Zn/Cd efflux system component  45.19 
 
 		 312 aa  79  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0706968  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8432  hypothetical protein  41.23 
 
 		 274 aa  79.3  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.774825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0889  NLP/P60 protein  43.4 
 
 		 337 aa  77.8  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2503  LGFP repeat-containing protein  33.33 
 
 		 344 aa  76.3  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272639  normal  0.0821052 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3025  hypothetical protein  48.42 
 
 		 258 aa  75.1  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.144373  normal  0.932008 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25980  hypothetical protein  43.81 
 
 		 287 aa  73.9  0.000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0824  Peptidase M23  36.73 
 
 		 378 aa  73.9  0.000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00220  metalloendopeptidase-like membrane protein  37.69 
 
 		 554 aa  73.9  0.000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0493  hypothetical protein  32.18 
 
 		 281 aa  73.6  0.000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.580154  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06630  metalloendopeptidase-like membrane protein  32.53 
 
 		 547 aa  72.8  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.630482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1170  hypothetical protein  43.16 
 
 		 280 aa  72.4  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0379591  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2244  peptidase M23B  39.2 
 
 		 1048 aa  70.5  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3901  hypothetical protein  35.71 
 
 		 293 aa  69.3  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0140637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1240  YD repeat-containing protein  29.93 
 
 		 1328 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4738  peptidase M23B  34.31 
 
 		 388 aa  67.8  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000208513 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20220  hypothetical protein  43.42 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.389671  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0028  hypothetical protein  32.05 
 
 		 280 aa  67  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2808  hypothetical protein  39.8 
 
 		 183 aa  66.6  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.82 
 
 		 1222 aa  65.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4302  peptidase M23B  37.72 
 
 		 387 aa  65.9  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.416455  normal  0.37822 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4522  hypothetical protein  30.6 
 
 		 275 aa  63.9  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.594874 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1573  peptidase M23B  35.29 
 
 		 348 aa  63.2  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0724492  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1952  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  33.77 
 
 		 391 aa  63.2  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.383383  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1158  YD repeat-containing protein  29.06 
 
 		 1517 aa  61.2  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0480723  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0440  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  32.23 
 
 		 392 aa  60.8  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0688  Peptidase M23  35.56 
 
 		 383 aa  61.2  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.50956  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3122  Integrins alpha chain  31.61 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0941302  hitchhiker  0.000197077 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4186  hypothetical protein  30.33 
 
 		 760 aa  60.5  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.394785 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.41 
 
 		 1340 aa  57.4  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.37 
 
 		 1113 aa  56.2  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.15 
 
 		 1225 aa  55.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4549  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.32 
 
 		 690 aa  55.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1008  CHAP domain-containing protein  34.11 
 
 		 562 aa  54.7  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00120354  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0642  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  41.46 
 
 		 386 aa  53.9  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  24.71 
 
 		 1019 aa  52.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2038  FG-GAP  26.87 
 
 		 690 aa  52.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0466844 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4187  hypothetical protein  25.43 
 
 		 506 aa  52.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.951598  normal  0.259515 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2398  FG-GAP repeat-containing protein  27.27 
 
 		 417 aa  51.6  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.276606  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  22.37 
 
 		 1154 aa  51.6  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.324183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.32 
 
 		 1118 aa  51.2  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2778  Integrins alpha chain  30.13 
 
 		 409 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2571  FG-GAP repeat protein  27.19 
 
 		 456 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5544  hypothetical protein  29.17 
 
 		 437 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.0727339 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5946  hypothetical protein  29.17 
 
 		 437 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  26.34 
 
 		 1838 aa  46.2  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.21 
 
 		 2194 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4284  CHAP domain-containing protein  30.63 
 
 		 360 aa  46.2  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.838801  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5474  hypothetical protein  24.45 
 
 		 780 aa  46.2  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.769605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  24.58 
 
 		 1289 aa  45.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  26.94 
 
 		 872 aa  45.8  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4551  CHAP domain containing protein  29.13 
 
 		 357 aa  45.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.374294 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>