More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8932 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8932  NLP/P60 protein  100 
 
 		 367 aa  743    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00108547  normal  0.263686 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4630  NLP/P60 protein  53.1 
 
 		 162 aa  158  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0160155 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  33.01 
 
 		 329 aa  127  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0889  NLP/P60 protein  30.06 
 
 		 337 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  40.83 
 
 		 331 aa  92.4  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  42.24 
 
 		 374 aa  84.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  38.84 
 
 		 306 aa  83.6  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  35.96 
 
 		 334 aa  83.2  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1747  NLP/P60 protein  41.27 
 
 		 174 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0298  NLP/P60 protein  35.66 
 
 		 437 aa  81.3  0.00000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.283102  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0041  NLP/P60  38.85 
 
 		 331 aa  80.9  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.430296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  39.66 
 
 		 308 aa  80.5  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  36.36 
 
 		 162 aa  79.7  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  36.97 
 
 		 388 aa  80.1  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  44.04 
 
 		 345 aa  79.7  0.00000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0480  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  45.19 
 
 		 390 aa  79.3  0.00000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0487  Peptidase M23  31.4 
 
 		 379 aa  78.6  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0018  NLP/P60 protein  34.27 
 
 		 188 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4511  NLP/P60 protein  37.31 
 
 		 388 aa  78.6  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.307006  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7951  hypothetical protein  35.14 
 
 		 312 aa  78.2  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  32.06 
 
 		 235 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  36.24 
 
 		 222 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  36.69 
 
 		 332 aa  78.2  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3000  NLP/P60 protein  39.1 
 
 		 463 aa  78.2  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.487438  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0148  NLP/P60 protein  45.19 
 
 		 392 aa  78.2  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2144  NLP/P60 protein  38.98 
 
 		 374 aa  77.8  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8043  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  37.5 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7290  NLP/P60 protein  45.26 
 
 		 329 aa  77  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0724969  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0633  Co/Zn/Cd efflux system component  36.5 
 
 		 312 aa  76.3  0.0000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0706968  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  36.3 
 
 		 183 aa  75.5  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8582  NLP/P60 protein  42.06 
 
 		 180 aa  75.1  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0901428  normal  0.349112 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  36.15 
 
 		 372 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  35.9 
 
 		 236 aa  75.1  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  36.15 
 
 		 372 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  36.28 
 
 		 394 aa  75.1  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3298  NLP/P60 protein  36.15 
 
 		 372 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.154902 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10024  hypothetical protein  38.94 
 
 		 281 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3054  NLP/P60 protein  39.32 
 
 		 381 aa  73.9  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0610428  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  35.81 
 
 		 338 aa  73.9  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  34.65 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  35.71 
 
 		 321 aa  73.6  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  37.3 
 
 		 340 aa  73.6  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3442  Peptidase M23  26.99 
 
 		 546 aa  73.6  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2996  hypothetical protein  35.77 
 
 		 194 aa  73.2  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000318278 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0846  lytic transglycosylase, catalytic  39.29 
 
 		 325 aa  72.8  0.000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  35.77 
 
 		 335 aa  72.8  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3471  hypothetical protein  35.77 
 
 		 194 aa  72  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  34.31 
 
 		 391 aa  72.4  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7119  NLP/P60 protein  36 
 
 		 182 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2985  hypothetical protein  35.77 
 
 		 194 aa  72  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0072  hypothetical protein  35.77 
 
 		 200 aa  72.4  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.736738 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2042  hypothetical protein  38.68 
 
 		 194 aa  72  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.936652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3999  hypothetical protein  38.68 
 
 		 194 aa  72.8  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2319  hypothetical protein  35.77 
 
 		 194 aa  72  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.229041  normal  0.0161406 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4187  hypothetical protein  38.68 
 
 		 194 aa  72.4  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2414  hypothetical protein  35.77 
 
 		 203 aa  72.4  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.291745 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3850  hypothetical protein  35.77 
 
 		 194 aa  72.4  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4564  NLP/P60 protein  36.59 
 
 		 467 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.057013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3074  NLP/P60 protein  39.66 
 
 		 116 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01906  outer membrane lipoprotein  36.72 
 
 		 221 aa  71.2  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.211693  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1820  NLP/P60 protein  37.32 
 
 		 330 aa  72  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  35.16 
 
 		 221 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5084  hypothetical protein  38.68 
 
 		 207 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000555714 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1440  NLP/P60  36.59 
 
 		 467 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51506  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1977  hypothetical protein  35.77 
 
 		 194 aa  72  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158034  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2887  NLP/P60 protein  34.97 
 
 		 179 aa  71.6  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.171139  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  37.31 
 
 		 348 aa  71.6  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3211  hypothetical protein  38.68 
 
 		 193 aa  71.2  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.729102 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1458  NLP/P60 protein  36.59 
 
 		 467 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.614878  normal  0.41084 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2839  NLP/P60 protein  35.51 
 
 		 469 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.239503 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3348  hypothetical protein  35.77 
 
 		 194 aa  72  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.372059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0244  hypothetical protein  38.68 
 
 		 192 aa  70.9  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0151406 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4566  hypothetical protein  38.32 
 
 		 203 aa  70.9  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.252363 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  38.64 
 
 		 347 aa  71.2  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2417  hypothetical protein  38.68 
 
 		 194 aa  71.2  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0954159 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3656  NLP/P60 protein  35.77 
 
 		 469 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07830  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  37.5 
 
 		 372 aa  71.2  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  35.71 
 
 		 342 aa  71.2  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3901  hypothetical protein  30.81 
 
 		 293 aa  70.9  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0140637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1427  NLP/P60 protein  41.59 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  37.72 
 
 		 370 aa  70.9  0.00000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1228  NLP/P60 protein  32.87 
 
 		 177 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  34.38 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1972  NLP/P60  35.29 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.107958  normal  0.172208 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  34.38 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1657  cell wall-associated hydrolase  30.15 
 
 		 186 aa  70.5  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.388437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0895  NLP/P60 protein  35.77 
 
 		 469 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  34.38 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  35.9 
 
 		 378 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2091  NLP/P60 protein  32.86 
 
 		 192 aa  70.9  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.315099  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  35.16 
 
 		 221 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1664  NLP/P60 protein  32.81 
 
 		 192 aa  70.9  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  34.88 
 
 		 378 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4520  NLP/P60 protein  36.96 
 
 		 472 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  38.98 
 
 		 337 aa  70.1  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1787  NLP/P60 protein  32.61 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5292  NLP/P60 protein  35.77 
 
 		 469 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.308075  normal  0.186714 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1659  hypothetical protein  33.33 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.255203  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1606  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1250  NLP/P60 protein  35.46 
 
 		 248 aa  70.1  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000552171  normal  0.790948 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>