More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5428 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5428  Peptidase M23  100 
 
 
349 aa  717    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0487  Peptidase M23  48.31 
 
 
379 aa  323  2e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4302  peptidase M23B  44.94 
 
 
387 aa  256  4e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.416455  normal  0.37822 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4738  peptidase M23B  41.95 
 
 
388 aa  249  7e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000208513 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0688  Peptidase M23  33.43 
 
 
383 aa  167  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.50956  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0824  Peptidase M23  34.13 
 
 
378 aa  162  9e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2543  hypothetical protein  57.81 
 
 
275 aa  155  7e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.578338  decreased coverage  0.00000438668 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4302  hypothetical protein  48.72 
 
 
305 aa  155  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.628164 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2395  hypothetical protein  57.81 
 
 
261 aa  154  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00354329  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4566  hypothetical protein  53.03 
 
 
203 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.252363 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1977  hypothetical protein  52.27 
 
 
194 aa  145  8.000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158034  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2042  hypothetical protein  53.03 
 
 
194 aa  145  8.000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.936652  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3471  hypothetical protein  52.27 
 
 
194 aa  145  9e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2319  hypothetical protein  52.27 
 
 
194 aa  145  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.229041  normal  0.0161406 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2414  hypothetical protein  51.52 
 
 
203 aa  145  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.291745 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3348  hypothetical protein  52.27 
 
 
194 aa  145  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.372059  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3850  hypothetical protein  51.52 
 
 
194 aa  145  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5084  hypothetical protein  51.52 
 
 
207 aa  144  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000555714 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4187  hypothetical protein  52.27 
 
 
194 aa  144  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0072  hypothetical protein  51.52 
 
 
200 aa  144  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.736738 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3999  hypothetical protein  52.27 
 
 
194 aa  144  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2996  hypothetical protein  51.52 
 
 
194 aa  144  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000318278 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2417  hypothetical protein  51.52 
 
 
194 aa  144  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0954159 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2985  hypothetical protein  51.52 
 
 
194 aa  142  8e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3211  hypothetical protein  50.76 
 
 
193 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.729102 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0244  hypothetical protein  50.76 
 
 
192 aa  141  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0151406 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2128  hypothetical protein  48.55 
 
 
295 aa  130  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.400478  hitchhiker  0.00659313 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1141  hypothetical protein  40.56 
 
 
309 aa  130  5.0000000000000004e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.617877  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0974  hypothetical protein  53.17 
 
 
321 aa  129  6e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1090  hypothetical protein  42.41 
 
 
256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.018463  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06630  metalloendopeptidase-like membrane protein  32.24 
 
 
547 aa  127  3e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.630482  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2275  hypothetical protein  47.1 
 
 
282 aa  125  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.329742  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25980  hypothetical protein  50.81 
 
 
287 aa  124  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2807  hypothetical protein  46.81 
 
 
283 aa  123  4e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0224369  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00220  metalloendopeptidase-like membrane protein  30.59 
 
 
554 aa  123  4e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1194  hypothetical protein  47.29 
 
 
320 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2527  hypothetical protein  49.21 
 
 
272 aa  120  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000287689 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1131  hypothetical protein  53.7 
 
 
301 aa  119  4.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3460  hypothetical protein  41.28 
 
 
284 aa  118  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.907261  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0996  hypothetical protein  51.54 
 
 
286 aa  118  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1573  peptidase M23B  34.04 
 
 
348 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0724492  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1845  hypothetical protein  50 
 
 
281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.661954  normal  0.35188 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3840  hypothetical protein  42.55 
 
 
284 aa  117  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.427443  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  36.36 
 
 
329 aa  116  6.9999999999999995e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1170  hypothetical protein  48.12 
 
 
280 aa  105  8e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0379591  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4522  hypothetical protein  42.03 
 
 
275 aa  105  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.594874 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1380  FG-GAP repeat-containing protein  44.2 
 
 
514 aa  103  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0133276 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11160  hypothetical protein  38.64 
 
 
315 aa  103  5e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0633  Co/Zn/Cd efflux system component  34.64 
 
 
312 aa  102  8e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0706968  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1952  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  39.62 
 
 
391 aa  102  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.383383  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8432  hypothetical protein  48.48 
 
 
274 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.774825  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3901  hypothetical protein  42.86 
 
 
293 aa  100  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0140637  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2244  peptidase M23B  47.76 
 
 
1048 aa  100  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0493  hypothetical protein  43.65 
 
 
281 aa  98.2  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.580154  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0440  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  38.36 
 
 
392 aa  98.2  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3025  hypothetical protein  53.06 
 
 
258 aa  94.7  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.144373  normal  0.932008 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0889  NLP/P60 protein  37.59 
 
 
337 aa  94  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7951  hypothetical protein  41.04 
 
 
312 aa  93.6  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5544  hypothetical protein  40.77 
 
 
437 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.0727339 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5946  hypothetical protein  40.77 
 
 
437 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20698  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6368  Peptidase M23  41.22 
 
 
269 aa  88.2  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4183  CHAP domain-containing protein  34.95 
 
 
358 aa  87.8  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4510  CHAP domain-containing protein  33.16 
 
 
359 aa  87  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.160949  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5984  peptidase M23B  36.42 
 
 
284 aa  85.5  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0310033  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0642  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  34.43 
 
 
386 aa  84.3  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0028  hypothetical protein  31.31 
 
 
280 aa  82.8  0.000000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4551  CHAP domain containing protein  30.22 
 
 
357 aa  81.3  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.374294 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  36.51 
 
 
387 aa  80.5  0.00000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2152  hypothetical protein  36.43 
 
 
178 aa  80.1  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.41449 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04900  metalloendopeptidase-like membrane protein  35.76 
 
 
235 aa  79.3  0.00000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33100  metalloendopeptidase-like membrane protein  37.16 
 
 
326 aa  79  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.718817 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4510  peptidase M23B  34.67 
 
 
334 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  39.37 
 
 
824 aa  77.8  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  29.71 
 
 
445 aa  75.5  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2895  Peptidase M23  33.14 
 
 
199 aa  75.5  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.351071  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1864  Peptidase M23  35.42 
 
 
293 aa  75.5  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.475918  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5120  Peptidase M23  30.95 
 
 
288 aa  74.7  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  28.37 
 
 
442 aa  75.1  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  37.1 
 
 
454 aa  74.7  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3955  peptidase M23B  36.52 
 
 
457 aa  74.7  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.053083  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4284  CHAP domain-containing protein  34.22 
 
 
360 aa  75.1  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.838801  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4426  CHAP domain containing protein  36.09 
 
 
635 aa  74.7  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.649059 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3617  peptidase M23B  36.52 
 
 
457 aa  74.7  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0923859  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2268  Peptidase M23  37.12 
 
 
344 aa  74.3  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177888  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1354  peptidase M23B  34.9 
 
 
424 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000810467  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0210  peptidase M23B  34.62 
 
 
216 aa  73.9  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  normal  0.0105886 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  38.06 
 
 
430 aa  73.6  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1938  peptidase, M23/M37 family  37.1 
 
 
564 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2868799999999999e-45 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1765  M24/M37 family peptidase  37.1 
 
 
564 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000130231  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1903  M23/37 family peptidase  37.1 
 
 
564 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000402629  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1909  peptidase, M23/M37 family  36.29 
 
 
564 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00585964  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2192  M24/M37 family peptidase  36.72 
 
 
337 aa  72  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0203  enterotoxin, putative  33.33 
 
 
603 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1742  peptidase M23/M37 family protein  37.1 
 
 
564 aa  72  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000319429  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3442  Peptidase M23  36.07 
 
 
546 aa  72  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  34.44 
 
 
402 aa  72.4  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0263  peptidase, M23/M37 family  33.33 
 
 
603 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0304388 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4708  peptidase M23B  38.76 
 
 
360 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  38.4 
 
 
455 aa  71.2  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4328  peptidase M23B  38.76 
 
 
360 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>