More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2268 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2268  Peptidase M23  100 
 
 
344 aa  671    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177888  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2444  peptidase M23B  34.76 
 
 
318 aa  106  6e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000108635  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0558  peptidase M23B  32.35 
 
 
445 aa  106  7e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.926866  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2040  peptidase  39.71 
 
 
369 aa  100  4e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0406653  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  39.63 
 
 
468 aa  100  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2199  Peptidase M23  42.64 
 
 
316 aa  99  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3272  peptidase M23B  39.35 
 
 
459 aa  98.2  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.790257 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0855  Fe-S type hydro-lyases tartrate/fumarate alpha region  35.67 
 
 
310 aa  97.8  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000487918  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2852  peptidase M23B  41.35 
 
 
315 aa  97.4  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0621759  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2464  Peptidase M23  43.17 
 
 
231 aa  97.1  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126719  normal  0.891349 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4435  Peptidase M23  34.52 
 
 
308 aa  97.1  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1960  peptidase M23  38.97 
 
 
319 aa  96.3  7e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.065884  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0192  Peptidase M23  41.27 
 
 
312 aa  96.3  7e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  43.85 
 
 
301 aa  96.3  7e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  42.74 
 
 
303 aa  95.1  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  39.68 
 
 
300 aa  94  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0696  M24/M37 family peptidase  37.16 
 
 
388 aa  94.4  3e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0489006  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  44.25 
 
 
376 aa  93.6  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  42.86 
 
 
452 aa  93.6  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3063  peptidase M23B  38.99 
 
 
377 aa  93.6  5e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000502081  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00220  metalloendopeptidase-like membrane protein  45.27 
 
 
554 aa  93.2  6e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0376  peptidase M23B  43.88 
 
 
271 aa  93.2  6e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0795  peptidase M23B  41.94 
 
 
253 aa  92.4  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  37.34 
 
 
569 aa  91.7  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  40.77 
 
 
375 aa  91.7  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0912  Peptidase M23  41.79 
 
 
276 aa  91.3  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.677753 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  36.42 
 
 
309 aa  91.7  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4836  Peptidase M23  45.38 
 
 
230 aa  90.9  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000639661  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  40.65 
 
 
304 aa  90.9  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04359  peptidase  38.76 
 
 
313 aa  90.5  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0330  Peptidase M23  40.67 
 
 
424 aa  90.5  4e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0430576 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  40.76 
 
 
419 aa  90.1  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1202  Peptidase M23  40.48 
 
 
367 aa  90.5  4e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  44.14 
 
 
324 aa  90.1  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  42.37 
 
 
482 aa  90.1  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0610  Peptidase M23  39.44 
 
 
318 aa  90.1  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0598438  normal  0.897424 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2753  LysM/M23/M37 peptidase  38.52 
 
 
363 aa  90.1  6e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4026  peptidase M23B  43.41 
 
 
539 aa  89.7  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.435878  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  38.24 
 
 
399 aa  90.1  6e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  42.74 
 
 
582 aa  89.7  6e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2141  peptidase M23B  43.61 
 
 
649 aa  89.7  6e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.506727 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2111  peptidase M23B  40.3 
 
 
362 aa  89.7  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.315561 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3607  peptidase M23B  39.29 
 
 
469 aa  89.4  7e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0610326  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1738  M23/M37 peptidase domain-containing protein  36.76 
 
 
303 aa  89.4  8e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.708166  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3011  peptidase M23B  35.76 
 
 
482 aa  89.4  9e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.698295 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  37.88 
 
 
423 aa  89  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2621  M24/M37 family peptidase  40.77 
 
 
350 aa  89  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2264  peptidase M23B  36.73 
 
 
450 aa  89  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971907  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1340  Peptidase M23  44.72 
 
 
346 aa  88.6  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.363221  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  43.31 
 
 
430 aa  88.2  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  42.96 
 
 
379 aa  88.2  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  45.07 
 
 
541 aa  88.2  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  45.37 
 
 
274 aa  88.2  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2318  LysM/M23/M37 peptidase  39.71 
 
 
307 aa  87.8  3e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.234924  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  48.08 
 
 
377 aa  87.4  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1283  Peptidase M23  43.26 
 
 
251 aa  87.8  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  37.5 
 
 
399 aa  87.8  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2938  M24/M37 family peptidase  40 
 
 
350 aa  87.4  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3520  Peptidase M23  34.34 
 
 
640 aa  87.4  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.259567  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4205  peptidase M23B  36.99 
 
 
236 aa  87.8  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0068065 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  38.62 
 
 
430 aa  87.8  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1277  Peptidase M23  47.06 
 
 
431 aa  87.4  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.376949  normal  0.138008 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2039  Peptidase M23  42.64 
 
 
414 aa  87  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0205491  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  43.55 
 
 
751 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  39.02 
 
 
301 aa  87.4  4e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  41.8 
 
 
590 aa  86.7  5e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  38 
 
 
402 aa  86.7  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3812  Peptidase M23  33.73 
 
 
640 aa  86.3  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0838  M24/M37 family peptidase  34.07 
 
 
269 aa  86.7  6e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0667187  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3774  peptidase M23B  37.93 
 
 
266 aa  86.7  6e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1363  Peptidase M23  37.36 
 
 
402 aa  86.3  7e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.498283  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  39.46 
 
 
282 aa  86.3  7e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3326  Peptidase M23  38.82 
 
 
340 aa  86.3  7e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  40.65 
 
 
321 aa  86.3  8e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  39.42 
 
 
229 aa  86.3  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1877  Peptidase M23  43.88 
 
 
273 aa  85.9  8e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000121356  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  43.33 
 
 
431 aa  85.9  9e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0778  Peptidase M23  36.36 
 
 
305 aa  85.9  9e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.266342  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4206  peptidase M23B  40.14 
 
 
270 aa  85.5  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0280  peptidase M23  38.52 
 
 
656 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.076484  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  33.52 
 
 
533 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0602  peptidase, M23/M37 family  36.36 
 
 
268 aa  85.5  0.000000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06630  metalloendopeptidase-like membrane protein  42.25 
 
 
547 aa  85.5  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.630482  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  38.35 
 
 
453 aa  85.5  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  37.16 
 
 
491 aa  85.5  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0268  M23 peptidase domain protein  39.57 
 
 
417 aa  85.5  0.000000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  38.41 
 
 
442 aa  85.1  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  39.52 
 
 
300 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  39.34 
 
 
527 aa  85.1  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2447  M23/M37 familypeptidase  40.31 
 
 
499 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.372819  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  44.25 
 
 
374 aa  84.7  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3798  peptidase M23B  34.67 
 
 
676 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24711  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2192  Peptidase M23  39.42 
 
 
296 aa  84.3  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0192897  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1326  peptidoglycan-binding LysM  44.09 
 
 
349 aa  84.3  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0931152 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1220  peptidase, M23/M37 family  34 
 
 
385 aa  84.3  0.000000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000900007  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  42.31 
 
 
238 aa  84  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  42.86 
 
 
441 aa  84  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5898  Peptidase M23  47.17 
 
 
332 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.941404  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2416  hypothetical protein  43.56 
 
 
410 aa  83.6  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000144361  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4328  peptidase M23B  43.33 
 
 
360 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>