More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4738 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4738  peptidase M23B  100 
 
 
388 aa  790    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000208513 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4302  peptidase M23B  84.54 
 
 
387 aa  642    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.416455  normal  0.37822 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0487  Peptidase M23  50.13 
 
 
379 aa  332  6e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5428  Peptidase M23  41.95 
 
 
349 aa  237  3e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0688  Peptidase M23  41.54 
 
 
383 aa  202  9e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.50956  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0824  Peptidase M23  38.6 
 
 
378 aa  163  5.0000000000000005e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2128  hypothetical protein  55.56 
 
 
295 aa  150  3e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.400478  hitchhiker  0.00659313 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06630  metalloendopeptidase-like membrane protein  37.17 
 
 
547 aa  144  4e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.630482  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00220  metalloendopeptidase-like membrane protein  35.51 
 
 
554 aa  140  3.9999999999999997e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2275  hypothetical protein  52.59 
 
 
282 aa  140  4.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.329742  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4522  hypothetical protein  51.11 
 
 
275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.594874 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5544  hypothetical protein  43.56 
 
 
437 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.0727339 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5946  hypothetical protein  43.56 
 
 
437 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20698  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4302  hypothetical protein  40.78 
 
 
305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.628164 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2543  hypothetical protein  47.41 
 
 
275 aa  110  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.578338  decreased coverage  0.00000438668 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2395  hypothetical protein  48.87 
 
 
261 aa  109  6e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00354329  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3850  hypothetical protein  43.66 
 
 
194 aa  107  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2414  hypothetical protein  43.66 
 
 
203 aa  106  7e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.291745 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2996  hypothetical protein  42.96 
 
 
194 aa  106  8e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000318278 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5084  hypothetical protein  43.66 
 
 
207 aa  105  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000555714 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2417  hypothetical protein  42.96 
 
 
194 aa  105  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0954159 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0072  hypothetical protein  42.25 
 
 
200 aa  105  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.736738 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3211  hypothetical protein  42.96 
 
 
193 aa  104  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.729102 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4566  hypothetical protein  42.22 
 
 
203 aa  103  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.252363 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0244  hypothetical protein  42.96 
 
 
192 aa  103  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0151406 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3348  hypothetical protein  42.25 
 
 
194 aa  102  9e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.372059  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1131  hypothetical protein  48 
 
 
301 aa  102  9e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3460  hypothetical protein  35.9 
 
 
284 aa  102  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.907261  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1977  hypothetical protein  42.25 
 
 
194 aa  102  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158034  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3471  hypothetical protein  42.25 
 
 
194 aa  102  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2527  hypothetical protein  37.33 
 
 
272 aa  102  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000287689 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2319  hypothetical protein  41.55 
 
 
194 aa  101  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.229041  normal  0.0161406 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3840  hypothetical protein  42.01 
 
 
284 aa  100  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.427443  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1573  peptidase M23B  28.65 
 
 
348 aa  100  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0724492  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1090  hypothetical protein  49.19 
 
 
256 aa  100  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.018463  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0996  hypothetical protein  47.06 
 
 
286 aa  99.4  9e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1141  hypothetical protein  35.96 
 
 
309 aa  99  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.617877  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4187  hypothetical protein  41.55 
 
 
194 aa  99.4  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2985  hypothetical protein  40.85 
 
 
194 aa  99  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2807  hypothetical protein  43.36 
 
 
283 aa  99.4  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0224369  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25980  hypothetical protein  44.44 
 
 
287 aa  99  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2042  hypothetical protein  40.85 
 
 
194 aa  98.2  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.936652  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3999  hypothetical protein  40.85 
 
 
194 aa  97.8  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5542  hypothetical protein  42.15 
 
 
209 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.0579814 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5944  hypothetical protein  42.15 
 
 
209 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1194  hypothetical protein  42.34 
 
 
320 aa  97.1  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1845  hypothetical protein  46.32 
 
 
281 aa  96.3  9e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.661954  normal  0.35188 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0493  hypothetical protein  36.67 
 
 
281 aa  95.5  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.580154  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0633  Co/Zn/Cd efflux system component  40.72 
 
 
312 aa  94.4  3e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0706968  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2244  peptidase M23B  39.13 
 
 
1048 aa  93.6  6e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  40.6 
 
 
329 aa  93.6  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  39.04 
 
 
375 aa  92  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0974  hypothetical protein  43.38 
 
 
321 aa  92.4  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3025  hypothetical protein  46.03 
 
 
258 aa  87.8  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.144373  normal  0.932008 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4426  CHAP domain containing protein  44.74 
 
 
635 aa  86.7  6e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.649059 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3901  hypothetical protein  35.51 
 
 
293 aa  86.3  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0140637  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  30.69 
 
 
456 aa  86.3  9e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  36.13 
 
 
455 aa  86.3  9e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0889  NLP/P60 protein  35.33 
 
 
337 aa  86.3  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  38 
 
 
457 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  36 
 
 
453 aa  84.3  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  40.8 
 
 
238 aa  84  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3209  Peptidase M23  33.97 
 
 
392 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.626752  normal  0.571204 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  36 
 
 
459 aa  82.8  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1170  hypothetical protein  37.37 
 
 
280 aa  82.4  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0379591  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  34.81 
 
 
454 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7951  hypothetical protein  33.49 
 
 
312 aa  82.4  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  34.67 
 
 
455 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2983  peptidase M23B  33.33 
 
 
392 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11160  hypothetical protein  35.53 
 
 
315 aa  82  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3167  Peptidase M23  33.33 
 
 
391 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5984  peptidase M23B  35.33 
 
 
284 aa  80.9  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0310033  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  29.5 
 
 
824 aa  80.9  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4510  CHAP domain-containing protein  39.44 
 
 
359 aa  80.9  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.160949  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4284  CHAP domain-containing protein  40.74 
 
 
360 aa  80.5  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.838801  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2472  peptidase M23B  44.86 
 
 
446 aa  79.7  0.00000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000997494  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4026  peptidase M23B  36.81 
 
 
539 aa  79.7  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.435878  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  33.56 
 
 
314 aa  79  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  33.76 
 
 
377 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  38.84 
 
 
754 aa  78.6  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8432  hypothetical protein  40.48 
 
 
274 aa  77.8  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.774825  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6051  Peptidase M23  40.27 
 
 
382 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.72546  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0038  peptidase M23B  36.13 
 
 
330 aa  77.8  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0633  Peptidase M23  35.42 
 
 
198 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0652  Peptidase M23  35.42 
 
 
198 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00716754  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  35.66 
 
 
751 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  34.97 
 
 
590 aa  76.6  0.0000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5846  peptidase M23B  37.7 
 
 
415 aa  76.6  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  35.29 
 
 
238 aa  76.6  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  28.57 
 
 
300 aa  76.6  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  35.29 
 
 
238 aa  76.6  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2817  peptidase M23B  36.73 
 
 
339 aa  76.6  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0513  peptidase M23B  40.74 
 
 
439 aa  76.6  0.0000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842896  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0110  M23/M37 peptidase domain-containing protein  33.11 
 
 
343 aa  75.9  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.236132  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  39.2 
 
 
375 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3297  peptidase M23B  43.93 
 
 
448 aa  76.3  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00235812  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2464  Peptidase M23  35.94 
 
 
231 aa  75.1  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126719  normal  0.891349 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  37.01 
 
 
379 aa  75.1  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  34.13 
 
 
283 aa  75.5  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2119  Peptidase M23  37.76 
 
 
440 aa  75.5  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12383  hitchhiker  0.00773867 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>