79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_4426 on replicon NC_011879
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011879  Achl_4426  CHAP domain containing protein  100 
 
 
635 aa  1275    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.649059 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4551  CHAP domain containing protein  30.4 
 
 
357 aa  113  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.374294 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4284  CHAP domain-containing protein  31.14 
 
 
360 aa  112  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.838801  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4183  CHAP domain-containing protein  30.37 
 
 
358 aa  112  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4510  CHAP domain-containing protein  30.29 
 
 
359 aa  110  6e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.160949  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4302  peptidase M23B  44.53 
 
 
387 aa  104  6e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.416455  normal  0.37822 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4738  peptidase M23B  44.53 
 
 
388 aa  99.8  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000208513 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5544  hypothetical protein  44.88 
 
 
437 aa  99  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.0727339 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5946  hypothetical protein  44.88 
 
 
437 aa  99  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20698  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2417  hypothetical protein  41.03 
 
 
194 aa  97.1  9e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0954159 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0057  cell wall protein precursor, choline binding protein  39.61 
 
 
279 aa  96.3  1e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2275  hypothetical protein  39.33 
 
 
282 aa  95.1  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.329742  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0072  hypothetical protein  40.38 
 
 
200 aa  95.5  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.736738 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2128  hypothetical protein  37.33 
 
 
295 aa  95.5  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.400478  hitchhiker  0.00659313 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5084  hypothetical protein  40.38 
 
 
207 aa  94.4  6e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000555714 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3850  hypothetical protein  40.38 
 
 
194 aa  94  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2414  hypothetical protein  40.38 
 
 
203 aa  94  8e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.291745 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0244  hypothetical protein  39.74 
 
 
192 aa  93.2  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0151406 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1977  hypothetical protein  39.74 
 
 
194 aa  93.2  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158034  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3471  hypothetical protein  39.74 
 
 
194 aa  93.2  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3211  hypothetical protein  39.74 
 
 
193 aa  92.8  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.729102 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3348  hypothetical protein  39.74 
 
 
194 aa  92.8  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.372059  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4187  hypothetical protein  39.74 
 
 
194 aa  92  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2319  hypothetical protein  39.1 
 
 
194 aa  91.3  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.229041  normal  0.0161406 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2996  hypothetical protein  39.1 
 
 
194 aa  90.9  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000318278 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2042  hypothetical protein  39.1 
 
 
194 aa  90.9  7e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.936652  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2985  hypothetical protein  39.1 
 
 
194 aa  90.5  9e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25980  hypothetical protein  33.77 
 
 
287 aa  90.5  9e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3999  hypothetical protein  39.1 
 
 
194 aa  90.1  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4566  hypothetical protein  39.1 
 
 
203 aa  88.6  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.252363 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4522  hypothetical protein  42.19 
 
 
275 aa  86.7  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.594874 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2395  hypothetical protein  37.42 
 
 
261 aa  84  0.000000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00354329  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0487  Peptidase M23  32.14 
 
 
379 aa  84  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0688  Peptidase M23  36.61 
 
 
383 aa  82.4  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.50956  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0974  hypothetical protein  37.32 
 
 
321 aa  82.4  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2543  hypothetical protein  36.13 
 
 
275 aa  81.6  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.578338  decreased coverage  0.00000438668 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1131  hypothetical protein  36.92 
 
 
301 aa  80.5  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2807  hypothetical protein  35.91 
 
 
283 aa  79.3  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0224369  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00310  CHAP domain-containing protein  32.1 
 
 
302 aa  79  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0996  hypothetical protein  40.32 
 
 
286 aa  78.6  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1194  hypothetical protein  33.33 
 
 
320 aa  78.2  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1141  hypothetical protein  32.73 
 
 
309 aa  76.6  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.617877  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5428  Peptidase M23  36.09 
 
 
349 aa  75.9  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1845  hypothetical protein  37.69 
 
 
281 aa  74.3  0.000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.661954  normal  0.35188 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2527  hypothetical protein  33.73 
 
 
272 aa  73.9  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000287689 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4302  hypothetical protein  35.52 
 
 
305 aa  73.6  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.628164 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1090  hypothetical protein  37.01 
 
 
256 aa  72.8  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.018463  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7951  hypothetical protein  32.6 
 
 
312 aa  70.9  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3840  hypothetical protein  34.48 
 
 
284 aa  69.7  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.427443  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3460  hypothetical protein  34.48 
 
 
284 aa  69.7  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.907261  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0633  Co/Zn/Cd efflux system component  30.67 
 
 
312 aa  66.2  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0706968  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06630  metalloendopeptidase-like membrane protein  31.82 
 
 
547 aa  65.9  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.630482  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00220  metalloendopeptidase-like membrane protein  29.17 
 
 
554 aa  65.5  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0824  Peptidase M23  32.3 
 
 
378 aa  62  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0440  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  32.14 
 
 
392 aa  60.5  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1952  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  32.14 
 
 
391 aa  60.1  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.383383  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11160  hypothetical protein  30.82 
 
 
315 aa  58.5  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1170  hypothetical protein  32.03 
 
 
280 aa  58.2  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0379591  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8432  hypothetical protein  34.92 
 
 
274 aa  58.2  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.774825  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3025  hypothetical protein  31.18 
 
 
258 aa  57.4  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.144373  normal  0.932008 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2152  hypothetical protein  28.48 
 
 
178 aa  54.3  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.41449 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0642  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  36.7 
 
 
386 aa  54.3  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0028  hypothetical protein  32.45 
 
 
280 aa  53.9  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3901  hypothetical protein  27.89 
 
 
293 aa  53.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0140637  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3097  hypothetical protein  26.58 
 
 
547 aa  53.5  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  25.41 
 
 
329 aa  51.2  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1380  FG-GAP repeat-containing protein  27.97 
 
 
514 aa  51.2  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0133276 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5944  hypothetical protein  30.25 
 
 
209 aa  51.2  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5542  hypothetical protein  30.25 
 
 
209 aa  51.2  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.0579814 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1430  cell wall hydrolase  37.93 
 
 
397 aa  50.8  0.00008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1573  peptidase M23B  27.98 
 
 
348 aa  50.4  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0724492  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0889  NLP/P60 protein  25.99 
 
 
337 aa  50.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3442  Peptidase M23  27.44 
 
 
546 aa  49.3  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2244  peptidase M23B  31.72 
 
 
1048 aa  49.7  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0493  hypothetical protein  25.71 
 
 
281 aa  48.5  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.580154  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2615  CHAP domain-containing protein  29.85 
 
 
560 aa  45.4  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2620  CHAP domain-containing protein  35.96 
 
 
143 aa  43.9  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2567  CHAP domain-containing protein  35.96 
 
 
143 aa  43.9  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5541  hypothetical protein  25.5 
 
 
385 aa  43.9  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0771131 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>