26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2615 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2615  CHAP domain-containing protein  100 
 
 		 560 aa  1111    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2527  protein of unknown function DUF1535  38.89 
 
 		 904 aa  161  4e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.776522  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09170  hypothetical protein  38.08 
 
 		 808 aa  144  4e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.887975  normal  0.329696 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0719  hypothetical protein  42.63 
 
 		 818 aa  140  4.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0373  hypothetical protein  31.37 
 
 		 496 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.154623  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4057  hypothetical protein  33.58 
 
 		 910 aa  105  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4852  hypothetical protein  32.2 
 
 		 316 aa  77  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0625952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1920  hypothetical protein  29.01 
 
 		 3834 aa  73.2  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2076  hypothetical protein  32.92 
 
 		 465 aa  70.5  0.00000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.960322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1235  hypothetical protein  28.61 
 
 		 2024 aa  70.1  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4059  hypothetical protein  31.84 
 
 		 587 aa  70.1  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.360369  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3789  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.77 
 
 		 591 aa  70.1  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3167  S-layer domain-containing protein  29.53 
 
 		 637 aa  64.7  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2873  Poly(beta-D-mannuronate) lyase  32.82 
 
 		 1554 aa  62.4  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0258698 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3335  hypothetical protein  28.7 
 
 		 577 aa  57  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.304879  normal  0.237472 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  27.43 
 
 		 2713 aa  55.8  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0057  cell wall protein precursor, choline binding protein  31.18 
 
 		 279 aa  55.8  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2545  hypothetical protein  31.58 
 
 		 4120 aa  54.7  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09720  hypothetical protein  27.39 
 
 		 704 aa  52.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.506636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4263  hypothetical protein  40.68 
 
 		 848 aa  52  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0364  fibro-slime family protein  41.18 
 
 		 570 aa  49.3  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.227511 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  40.32 
 
 		 1289 aa  47  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2184  immunoglobulin I-set domain-containing protein  26.67 
 
 		 1507 aa  45.1  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4426  CHAP domain containing protein  29.1 
 
 		 635 aa  45.1  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.649059 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00310  CHAP domain-containing protein  34.69 
 
 		 302 aa  43.5  0.01  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0422  LysM domain-containing protein  34.41 
 
 		 266 aa  43.5  0.01  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>