76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4302 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4302  hypothetical protein  100 
 
 		 305 aa  605  9.999999999999999e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.628164 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3840  hypothetical protein  41.5 
 
 		 284 aa  160  4e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.427443  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3460  hypothetical protein  40.71 
 
 		 284 aa  156  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.907261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1194  hypothetical protein  38.18 
 
 		 320 aa  155  9e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1090  hypothetical protein  43.85 
 
 		 256 aa  155  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.018463  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1170  hypothetical protein  34.81 
 
 		 280 aa  152  8e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0379591  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1131  hypothetical protein  57.85 
 
 		 301 aa  149  8e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25980  hypothetical protein  42.02 
 
 		 287 aa  149  8e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1141  hypothetical protein  43.33 
 
 		 309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.617877  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7951  hypothetical protein  37.96 
 
 		 312 aa  145  8.000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8432  hypothetical protein  37.04 
 
 		 274 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.774825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2527  hypothetical protein  38 
 
 		 272 aa  144  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000287689 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3901  hypothetical protein  40.36 
 
 		 293 aa  144  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0140637  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0996  hypothetical protein  43.7 
 
 		 286 aa  144  3e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2807  hypothetical protein  40.78 
 
 		 283 aa  142  5e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0224369  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0633  Co/Zn/Cd efflux system component  34.75 
 
 		 312 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0706968  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11160  hypothetical protein  35.99 
 
 		 315 aa  140  3e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0974  hypothetical protein  53.03 
 
 		 321 aa  138  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0487  Peptidase M23  43.09 
 
 		 379 aa  136  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5428  Peptidase M23  47.69 
 
 		 349 aa  135  8e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1845  hypothetical protein  56.25 
 
 		 281 aa  135  9e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.661954  normal  0.35188 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  38.4 
 
 		 329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3025  hypothetical protein  38.27 
 
 		 258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.144373  normal  0.932008 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2395  hypothetical protein  52.94 
 
 		 261 aa  125  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00354329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2543  hypothetical protein  52.94 
 
 		 275 aa  124  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.578338  decreased coverage  0.00000438668 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4302  peptidase M23B  46.75 
 
 		 387 aa  122  8e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.416455  normal  0.37822 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3348  hypothetical protein  57.69 
 
 		 194 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.372059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2319  hypothetical protein  56.73 
 
 		 194 aa  119  6e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.229041  normal  0.0161406 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1977  hypothetical protein  56.73 
 
 		 194 aa  119  6e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158034  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3471  hypothetical protein  56.73 
 
 		 194 aa  119  7e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2985  hypothetical protein  56.73 
 
 		 194 aa  119  7e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2042  hypothetical protein  56.73 
 
 		 194 aa  119  7.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.936652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3999  hypothetical protein  55.77 
 
 		 194 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4187  hypothetical protein  55.77 
 
 		 194 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5084  hypothetical protein  55.77 
 
 		 207 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000555714 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2414  hypothetical protein  55.77 
 
 		 203 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.291745 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2275  hypothetical protein  47.52 
 
 		 282 aa  115  7.999999999999999e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.329742  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3850  hypothetical protein  54.81 
 
 		 194 aa  115  8.999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0493  hypothetical protein  42.42 
 
 		 281 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.580154  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2417  hypothetical protein  54.81 
 
 		 194 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0954159 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0244  hypothetical protein  54.81 
 
 		 192 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0151406 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0072  hypothetical protein  48 
 
 		 200 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.736738 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4566  hypothetical protein  56.31 
 
 		 203 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.252363 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2128  hypothetical protein  44.37 
 
 		 295 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.400478  hitchhiker  0.00659313 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3211  hypothetical protein  54.81 
 
 		 193 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.729102 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2996  hypothetical protein  54.81 
 
 		 194 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000318278 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4522  hypothetical protein  45.21 
 
 		 275 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.594874 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4738  peptidase M23B  47.06 
 
 		 388 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000208513 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0889  NLP/P60 protein  37.29 
 
 		 337 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2244  peptidase M23B  45.19 
 
 		 1048 aa  107  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0688  Peptidase M23  38.95 
 
 		 383 aa  104  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.50956  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0824  Peptidase M23  32.86 
 
 		 378 aa  95.1  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06630  metalloendopeptidase-like membrane protein  33.33 
 
 		 547 aa  92.4  8e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.630482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4551  CHAP domain containing protein  37.29 
 
 		 357 aa  91.7  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.374294 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4510  CHAP domain-containing protein  42.03 
 
 		 359 aa  90.5  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.160949  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00220  metalloendopeptidase-like membrane protein  37.99 
 
 		 554 aa  89.7  5e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1380  FG-GAP repeat-containing protein  38.46 
 
 		 514 aa  89.4  7e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0133276 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1573  peptidase M23B  35.56 
 
 		 348 aa  89  8e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0724492  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0440  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  37.5 
 
 		 392 aa  88.6  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5544  hypothetical protein  40.74 
 
 		 437 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.0727339 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5946  hypothetical protein  40.74 
 
 		 437 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4284  CHAP domain-containing protein  38.12 
 
 		 360 aa  87  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.838801  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4183  CHAP domain-containing protein  37.82 
 
 		 358 aa  86.7  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1952  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  35.4 
 
 		 391 aa  84  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.383383  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0028  hypothetical protein  32.18 
 
 		 280 aa  83.6  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3442  Peptidase M23  39.11 
 
 		 546 aa  82  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2152  hypothetical protein  39.2 
 
 		 178 aa  78.6  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.41449 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2503  LGFP repeat-containing protein  39.29 
 
 		 344 aa  77  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272639  normal  0.0821052 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2808  hypothetical protein  33.15 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0704  hypothetical protein  31.38 
 
 		 384 aa  73.9  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0642  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  35.15 
 
 		 386 aa  69.3  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3097  hypothetical protein  34.13 
 
 		 547 aa  64.7  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4426  CHAP domain containing protein  48.05 
 
 		 635 aa  63.2  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.649059 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8932  NLP/P60 protein  32.53 
 
 		 367 aa  52.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00108547  normal  0.263686 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4933  NLP/P60 protein  39.18 
 
 		 986 aa  51.6  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20220  hypothetical protein  39.19 
 
 		 212 aa  47  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.389671  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>