115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_5544 on replicon NC_008147
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008147  Mmcs_5544  hypothetical protein  100 
 
 		 437 aa  897    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.0727339 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5946  hypothetical protein  100 
 
 		 437 aa  897    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5762  hypothetical protein  68.29 
 
 		 322 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3215  hypothetical protein  53.46 
 
 		 216 aa  151  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2904  hypothetical protein  41.44 
 
 		 251 aa  150  6e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2948  hypothetical protein  41.44 
 
 		 251 aa  150  6e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.717952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2934  hypothetical protein  41.44 
 
 		 251 aa  150  6e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.121978 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3457  hypothetical protein  56 
 
 		 220 aa  145  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.102904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5081  hypothetical protein  48.47 
 
 		 232 aa  144  5e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11745  hypothetical protein  45.55 
 
 		 256 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.409869 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10325  hypothetical protein  48.25 
 
 		 220 aa  140  3e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1672  hypothetical protein  47.24 
 
 		 234 aa  138  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.658702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4302  peptidase M23B  44.17 
 
 		 387 aa  136  7.000000000000001e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.416455  normal  0.37822 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5542  hypothetical protein  45.45 
 
 		 209 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.0579814 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5944  hypothetical protein  45.45 
 
 		 209 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4738  peptidase M23B  41.36 
 
 		 388 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000208513 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2275  hypothetical protein  50.78 
 
 		 282 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.329742  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2128  hypothetical protein  50.78 
 
 		 295 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.400478  hitchhiker  0.00659313 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0414  hypothetical protein  48.18 
 
 		 201 aa  127  6e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0423  hypothetical protein  48.18 
 
 		 201 aa  127  6e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0402  hypothetical protein  48.18 
 
 		 199 aa  127  6e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0472134  normal  0.221882 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5545  hypothetical protein  49.18 
 
 		 171 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.092464 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5947  hypothetical protein  49.18 
 
 		 171 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.264862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5355  hypothetical protein  53.39 
 
 		 365 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5444  hypothetical protein  53.39 
 
 		 365 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.421103 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5734  hypothetical protein  53.39 
 
 		 365 aa  118  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.765847 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4522  hypothetical protein  48.74 
 
 		 275 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.594874 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0505  hypothetical protein  50.42 
 
 		 364 aa  113  6e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5924  hypothetical protein  50 
 
 		 370 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4940  Transglycosylase domain protein  44.19 
 
 		 682 aa  111  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3460  hypothetical protein  37.91 
 
 		 284 aa  102  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.907261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1194  hypothetical protein  27.52 
 
 		 320 aa  95.1  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00220  metalloendopeptidase-like membrane protein  42.62 
 
 		 554 aa  92.8  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4566  hypothetical protein  40.48 
 
 		 203 aa  91.7  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.252363 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3840  hypothetical protein  44.83 
 
 		 284 aa  92  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.427443  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0487  Peptidase M23  32.32 
 
 		 379 aa  90.1  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3348  hypothetical protein  40.48 
 
 		 194 aa  90.1  7e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.372059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06630  metalloendopeptidase-like membrane protein  41.8 
 
 		 547 aa  90.1  7e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.630482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2319  hypothetical protein  40.48 
 
 		 194 aa  89.7  9e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.229041  normal  0.0161406 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3471  hypothetical protein  40.48 
 
 		 194 aa  89.7  9e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4284  CHAP domain-containing protein  38.25 
 
 		 360 aa  89.4  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.838801  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1977  hypothetical protein  40.48 
 
 		 194 aa  89.7  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158034  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0072  hypothetical protein  39.68 
 
 		 200 aa  88.6  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.736738 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2414  hypothetical protein  39.68 
 
 		 203 aa  88.6  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.291745 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3850  hypothetical protein  39.68 
 
 		 194 aa  88.6  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4302  hypothetical protein  40.74 
 
 		 305 aa  88.2  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.628164 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2985  hypothetical protein  39.68 
 
 		 194 aa  87.8  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2996  hypothetical protein  39.68 
 
 		 194 aa  87.4  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000318278 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2042  hypothetical protein  39.68 
 
 		 194 aa  87.4  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.936652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5084  hypothetical protein  38.89 
 
 		 207 aa  86.7  8e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000555714 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2417  hypothetical protein  38.89 
 
 		 194 aa  86.3  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0954159 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1845  hypothetical protein  37.59 
 
 		 281 aa  85.1  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.661954  normal  0.35188 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3999  hypothetical protein  38.89 
 
 		 194 aa  85.1  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4187  hypothetical protein  38.89 
 
 		 194 aa  85.1  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0244  hypothetical protein  38.89 
 
 		 192 aa  85.1  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0151406 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3211  hypothetical protein  38.89 
 
 		 193 aa  85.1  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.729102 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0974  hypothetical protein  40.77 
 
 		 321 aa  85.1  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1090  hypothetical protein  40 
 
 		 256 aa  85.5  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.018463  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2395  hypothetical protein  40.17 
 
 		 261 aa  84.3  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00354329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1141  hypothetical protein  30.41 
 
 		 309 aa  84  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.617877  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4426  CHAP domain containing protein  44.88 
 
 		 635 aa  83.6  0.000000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.649059 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25980  hypothetical protein  34.27 
 
 		 287 aa  83.6  0.000000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0996  hypothetical protein  43.27 
 
 		 286 aa  83.6  0.000000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1943  hypothetical protein  40.16 
 
 		 289 aa  83.2  0.000000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.762706  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2527  hypothetical protein  39.02 
 
 		 340 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0824  Peptidase M23  34.46 
 
 		 378 aa  82.4  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5428  Peptidase M23  49.43 
 
 		 349 aa  82.4  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2527  hypothetical protein  31.86 
 
 		 272 aa  82.4  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000287689 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2543  hypothetical protein  37.29 
 
 		 275 aa  79  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.578338  decreased coverage  0.00000438668 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0688  Peptidase M23  47.27 
 
 		 383 aa  79.3  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.50956  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2807  hypothetical protein  39.83 
 
 		 283 aa  78.6  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0224369  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7309  hypothetical protein  39.34 
 
 		 324 aa  77.4  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2244  peptidase M23B  31.49 
 
 		 1048 aa  75.5  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1131  hypothetical protein  40.37 
 
 		 301 aa  75.5  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0440  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  34.33 
 
 		 392 aa  73.6  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1170  hypothetical protein  29.78 
 
 		 280 aa  72.4  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0379591  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  34.46 
 
 		 329 aa  71.6  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7951  hypothetical protein  45 
 
 		 312 aa  71.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4510  CHAP domain-containing protein  31.69 
 
 		 359 aa  69.7  0.00000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.160949  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1952  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  30.52 
 
 		 391 aa  69.7  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.383383  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2375  surface antigen  42.7 
 
 		 291 aa  68.6  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409403  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3025  hypothetical protein  40.95 
 
 		 258 aa  68.2  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.144373  normal  0.932008 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4551  CHAP domain containing protein  31.29 
 
 		 357 aa  68.2  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.374294 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2368  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  41.94 
 
 		 288 aa  67.4  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.238108  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0633  Co/Zn/Cd efflux system component  29.57 
 
 		 312 aa  65.1  0.000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0706968  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0889  NLP/P60 protein  32.64 
 
 		 337 aa  64.7  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8432  hypothetical protein  37.74 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.774825  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2764  hypothetical protein  33.94 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4183  CHAP domain-containing protein  26.79 
 
 		 358 aa  63.9  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0032  group B streptococcal surface immunogenic protein  37.8 
 
 		 434 aa  63.2  0.000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.85122  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27870  hypothetical protein  44.3 
 
 		 227 aa  62.4  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.86582  normal  0.0220968 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11160  hypothetical protein  26.98 
 
 		 315 aa  62.4  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0028  hypothetical protein  26.67 
 
 		 280 aa  62  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2082  hypothetical protein  36.36 
 
 		 364 aa  62  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0263451  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2152  hypothetical protein  31.82 
 
 		 178 aa  61.6  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.41449 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2500  hypothetical protein  31.73 
 
 		 339 aa  61.6  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718285  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0704  hypothetical protein  29.34 
 
 		 384 aa  60.8  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0305  hypothetical protein  33.01 
 
 		 317 aa  61.2  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3442  Peptidase M23  30.97 
 
 		 546 aa  60.1  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3631  hypothetical protein  40 
 
 		 336 aa  60.1  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.910562  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>