79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2395 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2395  hypothetical protein  100 
 
 
261 aa  526  1e-148  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00354329  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2543  hypothetical protein  75.36 
 
 
275 aa  376  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.578338  decreased coverage  0.00000438668 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0244  hypothetical protein  65.62 
 
 
192 aa  218  8.999999999999998e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0151406 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4566  hypothetical protein  68 
 
 
203 aa  217  1e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.252363 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5084  hypothetical protein  69.86 
 
 
207 aa  217  1e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000555714 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2417  hypothetical protein  69.86 
 
 
194 aa  217  1e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0954159 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3850  hypothetical protein  69.18 
 
 
194 aa  216  4e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0072  hypothetical protein  69.18 
 
 
200 aa  216  4e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.736738 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3348  hypothetical protein  69.18 
 
 
194 aa  216  4e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.372059  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2319  hypothetical protein  69.18 
 
 
194 aa  215  5.9999999999999996e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.229041  normal  0.0161406 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2985  hypothetical protein  69.18 
 
 
194 aa  215  7e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2414  hypothetical protein  69.18 
 
 
203 aa  214  8e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.291745 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2996  hypothetical protein  68.49 
 
 
194 aa  214  9e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000318278 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1977  hypothetical protein  69.18 
 
 
194 aa  214  9e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158034  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3471  hypothetical protein  69.18 
 
 
194 aa  214  9e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2042  hypothetical protein  69.18 
 
 
194 aa  214  9.999999999999999e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.936652  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3211  hypothetical protein  68.49 
 
 
193 aa  214  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.729102 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3999  hypothetical protein  69.18 
 
 
194 aa  214  9.999999999999999e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4187  hypothetical protein  69.18 
 
 
194 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0487  Peptidase M23  54.76 
 
 
379 aa  144  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5428  Peptidase M23  57.81 
 
 
349 aa  137  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4302  hypothetical protein  52.94 
 
 
305 aa  125  7e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.628164 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2128  hypothetical protein  42.77 
 
 
295 aa  119  6e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.400478  hitchhiker  0.00659313 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1141  hypothetical protein  47.54 
 
 
309 aa  115  6e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.617877  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2244  peptidase M23B  42.41 
 
 
1048 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1131  hypothetical protein  54.21 
 
 
301 aa  113  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4522  hypothetical protein  43.07 
 
 
275 aa  113  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.594874 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2275  hypothetical protein  44.53 
 
 
282 aa  112  5e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.329742  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0996  hypothetical protein  57 
 
 
286 aa  112  5e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0974  hypothetical protein  58.76 
 
 
321 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4302  peptidase M23B  47.83 
 
 
387 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.416455  normal  0.37822 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3460  hypothetical protein  45.16 
 
 
284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.907261  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1090  hypothetical protein  51.79 
 
 
256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.018463  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2807  hypothetical protein  50 
 
 
283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0224369  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3840  hypothetical protein  44.7 
 
 
284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.427443  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25980  hypothetical protein  54.37 
 
 
287 aa  109  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4738  peptidase M23B  48.87 
 
 
388 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000208513 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1194  hypothetical protein  43.7 
 
 
320 aa  105  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0633  Co/Zn/Cd efflux system component  46.03 
 
 
312 aa  105  6e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0706968  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2527  hypothetical protein  48.36 
 
 
272 aa  105  6e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000287689 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1845  hypothetical protein  52.68 
 
 
281 aa  105  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.661954  normal  0.35188 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7951  hypothetical protein  51.89 
 
 
312 aa  101  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0493  hypothetical protein  49.57 
 
 
281 aa  101  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.580154  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  38.81 
 
 
329 aa  100  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0688  Peptidase M23  39.47 
 
 
383 aa  98.6  9e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.50956  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0824  Peptidase M23  38.16 
 
 
378 aa  97.8  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3901  hypothetical protein  44.26 
 
 
293 aa  97.8  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0140637  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8432  hypothetical protein  50.96 
 
 
274 aa  97.1  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.774825  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0889  NLP/P60 protein  38.58 
 
 
337 aa  95.5  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1170  hypothetical protein  44.27 
 
 
280 aa  92.8  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0379591  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0440  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  40.38 
 
 
392 aa  92.8  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4284  CHAP domain-containing protein  49.07 
 
 
360 aa  92  8e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.838801  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1380  FG-GAP repeat-containing protein  43.44 
 
 
514 aa  92  8e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0133276 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1952  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  41.61 
 
 
391 aa  92  9e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.383383  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3025  hypothetical protein  56.38 
 
 
258 aa  91.3  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.144373  normal  0.932008 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06630  metalloendopeptidase-like membrane protein  38.73 
 
 
547 aa  88.2  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.630482  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00220  metalloendopeptidase-like membrane protein  38.73 
 
 
554 aa  86.3  5e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5544  hypothetical protein  40.17 
 
 
437 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.0727339 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5946  hypothetical protein  40.17 
 
 
437 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20698  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1573  peptidase M23B  40.15 
 
 
348 aa  83.6  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0724492  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11160  hypothetical protein  44.21 
 
 
315 aa  81.3  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2152  hypothetical protein  39.02 
 
 
178 aa  80.9  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.41449 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4510  CHAP domain-containing protein  39.34 
 
 
359 aa  77.4  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.160949  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4551  CHAP domain containing protein  38.52 
 
 
357 aa  77.8  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.374294 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4183  CHAP domain-containing protein  38.52 
 
 
358 aa  76.3  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0704  hypothetical protein  32.74 
 
 
384 aa  74.7  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0642  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  37.11 
 
 
386 aa  72.4  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4426  CHAP domain containing protein  45.35 
 
 
635 aa  69.7  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.649059 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2503  LGFP repeat-containing protein  37.29 
 
 
344 aa  68.9  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272639  normal  0.0821052 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0028  hypothetical protein  32.5 
 
 
280 aa  68.9  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3442  Peptidase M23  33.33 
 
 
546 aa  66.2  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2808  hypothetical protein  37.5 
 
 
183 aa  64.7  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408575  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20220  hypothetical protein  43.53 
 
 
212 aa  63.9  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.389671  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3097  hypothetical protein  28.78 
 
 
547 aa  63.5  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8932  NLP/P60 protein  37.5 
 
 
367 aa  55.5  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00108547  normal  0.263686 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5944  hypothetical protein  31.62 
 
 
209 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5542  hypothetical protein  31.62 
 
 
209 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.0579814 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4933  NLP/P60 protein  29.77 
 
 
986 aa  43.9  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4581  hypothetical protein  63.33 
 
 
72 aa  42  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.484909  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>