74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2152 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2152  hypothetical protein  100 
 
 		 178 aa  362  1e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.41449 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3097  hypothetical protein  49.67 
 
 		 547 aa  139  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1380  FG-GAP repeat-containing protein  37.04 
 
 		 514 aa  103  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0133276 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1131  hypothetical protein  51.55 
 
 		 301 aa  88.6  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1194  hypothetical protein  39.06 
 
 		 320 aa  87.8  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0633  Co/Zn/Cd efflux system component  43.24 
 
 		 312 aa  87.8  7e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0706968  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11160  hypothetical protein  44.14 
 
 		 315 aa  87.4  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0244  hypothetical protein  34.02 
 
 		 192 aa  87  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0151406 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2414  hypothetical protein  41.54 
 
 		 203 aa  86.3  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.291745 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1141  hypothetical protein  40 
 
 		 309 aa  86.3  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.617877  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2319  hypothetical protein  41.54 
 
 		 194 aa  86.3  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.229041  normal  0.0161406 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3471  hypothetical protein  41.54 
 
 		 194 aa  85.9  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2543  hypothetical protein  41.46 
 
 		 275 aa  85.5  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.578338  decreased coverage  0.00000438668 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1977  hypothetical protein  41.54 
 
 		 194 aa  85.9  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158034  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3460  hypothetical protein  39.67 
 
 		 284 aa  85.1  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.907261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3850  hypothetical protein  40.77 
 
 		 194 aa  84.7  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3348  hypothetical protein  40 
 
 		 194 aa  84.7  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.372059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0072  hypothetical protein  40.77 
 
 		 200 aa  84.7  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.736738 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4566  hypothetical protein  39.23 
 
 		 203 aa  84.7  7e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.252363 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2996  hypothetical protein  40.77 
 
 		 194 aa  84.7  7e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000318278 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  34.38 
 
 		 329 aa  84.3  8e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5084  hypothetical protein  40.77 
 
 		 207 aa  84.3  9e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000555714 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3211  hypothetical protein  34.36 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.729102 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2985  hypothetical protein  39.23 
 
 		 194 aa  83.6  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2042  hypothetical protein  40.77 
 
 		 194 aa  83.6  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.936652  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0996  hypothetical protein  44.9 
 
 		 286 aa  84  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25980  hypothetical protein  38.02 
 
 		 287 aa  82.8  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3840  hypothetical protein  39.34 
 
 		 284 aa  83.2  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.427443  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1845  hypothetical protein  42.34 
 
 		 281 aa  82.8  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.661954  normal  0.35188 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4187  hypothetical protein  40 
 
 		 194 aa  82.4  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3999  hypothetical protein  40 
 
 		 194 aa  82.8  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2417  hypothetical protein  40 
 
 		 194 aa  82.4  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0954159 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0974  hypothetical protein  40.17 
 
 		 321 aa  81.6  0.000000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2244  peptidase M23B  34.57 
 
 		 1048 aa  81.6  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2395  hypothetical protein  39.02 
 
 		 261 aa  80.9  0.000000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00354329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4302  hypothetical protein  39.2 
 
 		 305 aa  79  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.628164 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4183  CHAP domain-containing protein  35.93 
 
 		 358 aa  77.4  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1090  hypothetical protein  38.94 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.018463  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0889  NLP/P60 protein  34.33 
 
 		 337 aa  76.3  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3025  hypothetical protein  48.86 
 
 		 258 aa  75.1  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.144373  normal  0.932008 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0487  Peptidase M23  35.09 
 
 		 379 aa  75.1  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4551  CHAP domain containing protein  35 
 
 		 357 aa  75.1  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.374294 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4510  CHAP domain-containing protein  36.31 
 
 		 359 aa  74.7  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.160949  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8432  hypothetical protein  41.75 
 
 		 274 aa  74.3  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.774825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1170  hypothetical protein  44.66 
 
 		 280 aa  72.4  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0379591  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3901  hypothetical protein  43.4 
 
 		 293 aa  72  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0140637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2807  hypothetical protein  36.13 
 
 		 283 aa  71.6  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0224369  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0493  hypothetical protein  33.33 
 
 		 281 aa  70.5  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.580154  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4738  peptidase M23B  32.35 
 
 		 388 aa  70.5  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000208513 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4302  peptidase M23B  30.82 
 
 		 387 aa  69.7  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.416455  normal  0.37822 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4522  hypothetical protein  31.29 
 
 		 275 aa  69.3  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.594874 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4284  CHAP domain-containing protein  33.77 
 
 		 360 aa  68.9  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.838801  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2128  hypothetical protein  30.59 
 
 		 295 aa  68.2  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.400478  hitchhiker  0.00659313 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2503  LGFP repeat-containing protein  36.75 
 
 		 344 aa  68.2  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272639  normal  0.0821052 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2275  hypothetical protein  29.87 
 
 		 282 aa  67.8  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.329742  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5428  Peptidase M23  36.43 
 
 		 349 aa  67.4  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7951  hypothetical protein  43.96 
 
 		 312 aa  67  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2527  hypothetical protein  30.19 
 
 		 272 aa  66.2  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000287689 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5946  hypothetical protein  28.18 
 
 		 437 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5544  hypothetical protein  28.18 
 
 		 437 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.0727339 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2808  hypothetical protein  46.15 
 
 		 183 aa  64.3  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3442  Peptidase M23  36.59 
 
 		 546 aa  63.2  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1573  peptidase M23B  36.43 
 
 		 348 aa  62  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0724492  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0028  hypothetical protein  29.3 
 
 		 280 aa  60.1  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06630  metalloendopeptidase-like membrane protein  27.94 
 
 		 547 aa  53.9  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.630482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0824  Peptidase M23  37.36 
 
 		 378 aa  52  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0688  Peptidase M23  34.19 
 
 		 383 aa  50.1  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.50956  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1952  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  29.49 
 
 		 391 aa  50.1  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.383383  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20220  hypothetical protein  35.82 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.389671  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00220  metalloendopeptidase-like membrane protein  38.82 
 
 		 554 aa  49.7  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4426  CHAP domain containing protein  36.25 
 
 		 635 aa  47  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.649059 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0440  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  24.71 
 
 		 392 aa  45.8  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5944  hypothetical protein  28.35 
 
 		 209 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5542  hypothetical protein  28.35 
 
 		 209 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.0579814 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>