More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0824 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0824  Peptidase M23  100 
 
 
378 aa  744    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00220  metalloendopeptidase-like membrane protein  58.38 
 
 
554 aa  382  1e-105  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06630  metalloendopeptidase-like membrane protein  55.88 
 
 
547 aa  379  1e-104  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.630482  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0688  Peptidase M23  40.59 
 
 
383 aa  180  4.999999999999999e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.50956  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4302  peptidase M23B  40.18 
 
 
387 aa  176  5e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.416455  normal  0.37822 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4738  peptidase M23B  38.62 
 
 
388 aa  166  8e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000208513 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5428  Peptidase M23  35.47 
 
 
349 aa  152  8e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0487  Peptidase M23  35.47 
 
 
379 aa  137  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4871  peptidase M23B  51.7 
 
 
348 aa  114  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.289392  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  47.33 
 
 
454 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4732  peptidase M23B  41.71 
 
 
394 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130567  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1868  Peptidase M23  38.34 
 
 
398 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0529967  normal  0.144009 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1864  peptidase M23B  49.66 
 
 
351 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.102724 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2128  hypothetical protein  40.52 
 
 
295 aa  108  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.400478  hitchhiker  0.00659313 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  47.2 
 
 
455 aa  108  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  50.41 
 
 
243 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  47.2 
 
 
455 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  39.43 
 
 
541 aa  108  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  44.44 
 
 
430 aa  108  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  44.3 
 
 
229 aa  107  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  42.17 
 
 
375 aa  107  3e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  48.78 
 
 
282 aa  107  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2106  M24/M37 family peptidase  44.31 
 
 
328 aa  107  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  48.31 
 
 
411 aa  105  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  48.72 
 
 
569 aa  105  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  39.87 
 
 
375 aa  105  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5846  peptidase M23B  40.96 
 
 
415 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0795  peptidase M23B  50 
 
 
316 aa  105  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.244316 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  42.58 
 
 
379 aa  105  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  48.46 
 
 
400 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  45.19 
 
 
404 aa  105  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0758  Peptidase M23  50 
 
 
290 aa  104  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06251  M23/M37 familypeptidase  41.57 
 
 
323 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0447795 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3209  Peptidase M23  47.01 
 
 
392 aa  104  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.626752  normal  0.571204 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  48.31 
 
 
503 aa  103  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  45.6 
 
 
453 aa  104  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5408  Peptidase M23  52.89 
 
 
538 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252675  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  33.98 
 
 
324 aa  103  4e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  48.28 
 
 
314 aa  103  5e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5898  Peptidase M23  42.62 
 
 
332 aa  103  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.941404  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  50.41 
 
 
238 aa  103  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  47.66 
 
 
533 aa  103  7e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2275  hypothetical protein  38.67 
 
 
282 aa  103  7e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.329742  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2745  putative transmembrane protein  50.4 
 
 
332 aa  103  7e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.170207  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  45.6 
 
 
456 aa  102  8e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  44.06 
 
 
402 aa  102  8e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  44.27 
 
 
379 aa  102  9e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0592  M23/M37 familypeptidase  48.33 
 
 
282 aa  102  1e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.181185  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  45.6 
 
 
457 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  50.41 
 
 
238 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  38.41 
 
 
443 aa  102  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  46.92 
 
 
233 aa  102  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1304  peptidase M23B  47.29 
 
 
413 aa  102  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137059  normal  0.602682 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  44.53 
 
 
446 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  32.29 
 
 
375 aa  102  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2244  peptidase M23B  37.2 
 
 
1048 aa  102  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  40.59 
 
 
442 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3929  peptidase M23B  45.39 
 
 
319 aa  102  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  43.94 
 
 
312 aa  101  2e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  45.6 
 
 
459 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2983  peptidase M23B  41.3 
 
 
392 aa  101  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  43.07 
 
 
447 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  43.07 
 
 
447 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  38.33 
 
 
377 aa  101  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  37.97 
 
 
442 aa  100  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0609  Peptidase M23  44.7 
 
 
412 aa  100  3e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.01787e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  46.15 
 
 
472 aa  100  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0210  peptidase M23B  45.19 
 
 
216 aa  100  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  normal  0.0105886 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  37.89 
 
 
377 aa  100  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  45.45 
 
 
238 aa  100  4e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  43.85 
 
 
399 aa  100  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  43.85 
 
 
399 aa  100  4e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4522  hypothetical protein  33.77 
 
 
275 aa  100  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.594874 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  47.46 
 
 
474 aa  100  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0866  Peptidase M23  42.4 
 
 
489 aa  100  5e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.329722  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2912  peptidase M23B  46.97 
 
 
330 aa  99.8  7e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.471591  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  46.61 
 
 
475 aa  99.4  9e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5984  peptidase M23B  50.91 
 
 
284 aa  99.4  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0310033  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2486  peptidase M23B  45.69 
 
 
305 aa  99.4  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000462301  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3167  Peptidase M23  45.52 
 
 
391 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  42.25 
 
 
387 aa  99.4  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  37.42 
 
 
309 aa  99  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33100  metalloendopeptidase-like membrane protein  48.21 
 
 
326 aa  99.4  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.718817 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2761  peptidase M23  52.78 
 
 
529 aa  98.6  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.758494  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3690  peptidase M23B  49.15 
 
 
328 aa  99  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1738  M23/M37 peptidase domain-containing protein  42.86 
 
 
303 aa  97.8  2e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.708166  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0525  peptidase M23  41.38 
 
 
271 aa  97.8  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  40.14 
 
 
445 aa  98.2  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04359  peptidase  42.45 
 
 
313 aa  98.6  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2504  Peptidase M23  40.25 
 
 
290 aa  97.8  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.241623  normal  0.0435896 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  46.15 
 
 
517 aa  98.6  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1277  Peptidase M23  44.85 
 
 
431 aa  98.2  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.376949  normal  0.138008 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2444  peptidase M23B  45 
 
 
318 aa  97.8  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000108635  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  45.95 
 
 
475 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1960  peptidase M23  41.79 
 
 
319 aa  97.8  3e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.065884  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  45.61 
 
 
473 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2395  hypothetical protein  38.16 
 
 
261 aa  97.8  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00354329  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4572  Peptidase M23  47.75 
 
 
615 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.476433  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1772  M23/M37 familypeptidase  42.96 
 
 
327 aa  97.4  4e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  38.06 
 
 
423 aa  97.4  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>