61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3097 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3103  hypothetical protein  100 
 
 
536 aa  656    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.186273  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3097  hypothetical protein  100 
 
 
547 aa  1082    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1380  FG-GAP repeat-containing protein  42.13 
 
 
514 aa  155  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0133276 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2152  hypothetical protein  50.35 
 
 
178 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.41449 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4302  peptidase M23B  38.14 
 
 
387 aa  73.9  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.416455  normal  0.37822 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4738  peptidase M23B  31.68 
 
 
388 aa  73.6  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000208513 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11160  hypothetical protein  37.59 
 
 
315 aa  72.8  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2049  hypothetical protein  25.77 
 
 
556 aa  70.1  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.383654 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1141  hypothetical protein  33.33 
 
 
309 aa  66.2  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.617877  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3460  hypothetical protein  39.34 
 
 
284 aa  65.1  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.907261  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4302  hypothetical protein  34.13 
 
 
305 aa  64.7  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.628164 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2985  hypothetical protein  31.75 
 
 
194 aa  64.3  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1131  hypothetical protein  37.96 
 
 
301 aa  64.3  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2395  hypothetical protein  28.78 
 
 
261 aa  63.9  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00354329  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3840  hypothetical protein  34.31 
 
 
284 aa  63.9  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.427443  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3348  hypothetical protein  31.75 
 
 
194 aa  63.9  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.372059  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2527  hypothetical protein  32.59 
 
 
272 aa  63.2  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000287689 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2042  hypothetical protein  30.95 
 
 
194 aa  62.4  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.936652  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3471  hypothetical protein  30.95 
 
 
194 aa  62.4  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3999  hypothetical protein  30.95 
 
 
194 aa  62.4  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4187  hypothetical protein  30.95 
 
 
194 aa  62.8  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1977  hypothetical protein  30.95 
 
 
194 aa  62  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158034  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1194  hypothetical protein  34.65 
 
 
320 aa  62  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2319  hypothetical protein  30.95 
 
 
194 aa  62  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.229041  normal  0.0161406 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  31.75 
 
 
329 aa  61.2  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0487  Peptidase M23  33.06 
 
 
379 aa  60.5  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5084  hypothetical protein  30.16 
 
 
207 aa  60.5  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000555714 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2414  hypothetical protein  30.16 
 
 
203 aa  60.5  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.291745 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1845  hypothetical protein  37.72 
 
 
281 aa  60.1  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.661954  normal  0.35188 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0244  hypothetical protein  29.37 
 
 
192 aa  60.1  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0151406 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2543  hypothetical protein  30.95 
 
 
275 aa  59.3  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.578338  decreased coverage  0.00000438668 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2996  hypothetical protein  29.37 
 
 
194 aa  58.9  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000318278 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2417  hypothetical protein  29.37 
 
 
194 aa  58.9  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0954159 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3211  hypothetical protein  29.37 
 
 
193 aa  59.7  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.729102 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1090  hypothetical protein  33.62 
 
 
256 aa  59.3  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.018463  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3850  hypothetical protein  29.37 
 
 
194 aa  58.5  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0072  hypothetical protein  29.37 
 
 
200 aa  58.5  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.736738 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4566  hypothetical protein  30.16 
 
 
203 aa  58.5  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.252363 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7951  hypothetical protein  34.82 
 
 
312 aa  58.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0633  Co/Zn/Cd efflux system component  33.91 
 
 
312 aa  57.8  0.0000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0706968  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5428  Peptidase M23  34.65 
 
 
349 aa  56.2  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25980  hypothetical protein  34.48 
 
 
287 aa  55.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2807  hypothetical protein  31.58 
 
 
283 aa  55.5  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0224369  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0824  Peptidase M23  32.03 
 
 
378 aa  54.7  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0974  hypothetical protein  33.63 
 
 
321 aa  53.9  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0889  NLP/P60 protein  30.86 
 
 
337 aa  53.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2503  LGFP repeat-containing protein  32.5 
 
 
344 aa  53.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272639  normal  0.0821052 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20220  hypothetical protein  35.34 
 
 
212 aa  52.8  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.389671  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5544  hypothetical protein  25 
 
 
437 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.0727339 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5946  hypothetical protein  25 
 
 
437 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20698  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2244  peptidase M23B  35.82 
 
 
1048 aa  53.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0996  hypothetical protein  32.98 
 
 
286 aa  52.8  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2128  hypothetical protein  31.43 
 
 
295 aa  51.6  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.400478  hitchhiker  0.00659313 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2275  hypothetical protein  28.57 
 
 
282 aa  50.1  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.329742  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3901  hypothetical protein  26.92 
 
 
293 aa  49.3  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0140637  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00220  metalloendopeptidase-like membrane protein  28.79 
 
 
554 aa  48.1  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3025  hypothetical protein  36.36 
 
 
258 aa  45.8  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.144373  normal  0.932008 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06630  metalloendopeptidase-like membrane protein  25.57 
 
 
547 aa  45.8  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.630482  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1573  peptidase M23B  33.06 
 
 
348 aa  45.1  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0724492  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2822  Glycosyl hydrolase family 32 domain-containing protein  24.44 
 
 
673 aa  43.9  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0688  Peptidase M23  26.57 
 
 
383 aa  43.5  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.50956  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>