78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1090 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1090  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  504  9.999999999999999e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.018463  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3840  hypothetical protein  48.68 
 
 		 284 aa  190  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.427443  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3460  hypothetical protein  47.14 
 
 		 284 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.907261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1170  hypothetical protein  44.21 
 
 		 280 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0379591  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1141  hypothetical protein  57.93 
 
 		 309 aa  171  7.999999999999999e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.617877  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2527  hypothetical protein  44.54 
 
 		 272 aa  170  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000287689 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1194  hypothetical protein  41.7 
 
 		 320 aa  170  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1131  hypothetical protein  44.57 
 
 		 301 aa  169  3e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2807  hypothetical protein  46.32 
 
 		 283 aa  166  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0224369  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3901  hypothetical protein  42.92 
 
 		 293 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0140637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8432  hypothetical protein  43.24 
 
 		 274 aa  160  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.774825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4302  hypothetical protein  53.69 
 
 		 305 aa  156  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.628164 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11160  hypothetical protein  38.14 
 
 		 315 aa  155  7e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0633  Co/Zn/Cd efflux system component  36.14 
 
 		 312 aa  152  7e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0706968  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25980  hypothetical protein  42.69 
 
 		 287 aa  150  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0493  hypothetical protein  42.51 
 
 		 281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.580154  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0974  hypothetical protein  49.32 
 
 		 321 aa  143  3e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0996  hypothetical protein  43.09 
 
 		 286 aa  143  3e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3025  hypothetical protein  44 
 
 		 258 aa  142  4e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.144373  normal  0.932008 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7951  hypothetical protein  37.23 
 
 		 312 aa  141  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1845  hypothetical protein  54.35 
 
 		 281 aa  136  4e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.661954  normal  0.35188 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0487  Peptidase M23  55.74 
 
 		 379 aa  132  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  52.5 
 
 		 329 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0889  NLP/P60 protein  48.44 
 
 		 337 aa  128  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5428  Peptidase M23  43.79 
 
 		 349 aa  122  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2042  hypothetical protein  48.41 
 
 		 194 aa  115  5e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.936652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1977  hypothetical protein  47.62 
 
 		 194 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158034  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3471  hypothetical protein  47.62 
 
 		 194 aa  115  7.999999999999999e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2319  hypothetical protein  47.62 
 
 		 194 aa  115  7.999999999999999e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.229041  normal  0.0161406 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2395  hypothetical protein  50.82 
 
 		 261 aa  115  8.999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00354329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3348  hypothetical protein  47.62 
 
 		 194 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.372059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3999  hypothetical protein  47.62 
 
 		 194 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2985  hypothetical protein  47.62 
 
 		 194 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4187  hypothetical protein  47.62 
 
 		 194 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5084  hypothetical protein  46.83 
 
 		 207 aa  112  6e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000555714 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2414  hypothetical protein  46.03 
 
 		 203 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.291745 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2417  hypothetical protein  46.83 
 
 		 194 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0954159 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0244  hypothetical protein  46.83 
 
 		 192 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0151406 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2996  hypothetical protein  46.83 
 
 		 194 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000318278 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3211  hypothetical protein  46.83 
 
 		 193 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.729102 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3850  hypothetical protein  46.03 
 
 		 194 aa  110  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0072  hypothetical protein  46.03 
 
 		 200 aa  109  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.736738 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2543  hypothetical protein  46.03 
 
 		 275 aa  107  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.578338  decreased coverage  0.00000438668 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4566  hypothetical protein  43.84 
 
 		 203 aa  108  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.252363 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2244  peptidase M23B  44.12 
 
 		 1048 aa  107  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4738  peptidase M23B  48.51 
 
 		 388 aa  104  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000208513 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1380  FG-GAP repeat-containing protein  42.66 
 
 		 514 aa  103  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0133276 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1573  peptidase M23B  55.1 
 
 		 348 aa  102  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0724492  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2128  hypothetical protein  40.15 
 
 		 295 aa  102  8e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.400478  hitchhiker  0.00659313 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4302  peptidase M23B  36.82 
 
 		 387 aa  100  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.416455  normal  0.37822 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2275  hypothetical protein  39.42 
 
 		 282 aa  99.8  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.329742  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0688  Peptidase M23  39.63 
 
 		 383 aa  93.6  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.50956  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4522  hypothetical protein  40.77 
 
 		 275 aa  90.1  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.594874 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5946  hypothetical protein  34.59 
 
 		 437 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5544  hypothetical protein  34.59 
 
 		 437 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.0727339 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4284  CHAP domain-containing protein  45.05 
 
 		 360 aa  86.3  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.838801  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4510  CHAP domain-containing protein  39.58 
 
 		 359 aa  84.7  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.160949  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06630  metalloendopeptidase-like membrane protein  35.8 
 
 		 547 aa  84  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.630482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00220  metalloendopeptidase-like membrane protein  35.19 
 
 		 554 aa  82.4  0.000000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4551  CHAP domain containing protein  39.2 
 
 		 357 aa  81.3  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.374294 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0824  Peptidase M23  34.57 
 
 		 378 aa  80.1  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2152  hypothetical protein  38.94 
 
 		 178 aa  80.1  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.41449 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2503  LGFP repeat-containing protein  37.5 
 
 		 344 aa  79  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272639  normal  0.0821052 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4183  CHAP domain-containing protein  34.48 
 
 		 358 aa  79  0.00000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1952  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  34.68 
 
 		 391 aa  78.2  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.383383  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3442  Peptidase M23  37.8 
 
 		 546 aa  77.4  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2808  hypothetical protein  37.84 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0440  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  34.87 
 
 		 392 aa  75.9  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0028  hypothetical protein  35.77 
 
 		 280 aa  76.3  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0642  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  34.38 
 
 		 386 aa  70.5  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3097  hypothetical protein  32.58 
 
 		 547 aa  63.5  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0704  hypothetical protein  27.78 
 
 		 384 aa  59.3  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4426  CHAP domain containing protein  35.42 
 
 		 635 aa  58.5  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.649059 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8932  NLP/P60 protein  32.56 
 
 		 367 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00108547  normal  0.263686 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20220  hypothetical protein  43.24 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.389671  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4933  NLP/P60 protein  37.5 
 
 		 986 aa  51.2  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5944  hypothetical protein  30.33 
 
 		 209 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5542  hypothetical protein  30.33 
 
 		 209 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.0579814 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>