More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4302 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4738  peptidase M23B  84.54 
 
 		 388 aa  667    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000208513 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4302  peptidase M23B  100 
 
 		 387 aa  787    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.416455  normal  0.37822 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0487  Peptidase M23  51.24 
 
 		 379 aa  326  4.0000000000000003e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5428  Peptidase M23  44.94 
 
 		 349 aa  245  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0688  Peptidase M23  41.42 
 
 		 383 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.50956  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0824  Peptidase M23  40.19 
 
 		 378 aa  176  9e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06630  metalloendopeptidase-like membrane protein  37.54 
 
 		 547 aa  168  1e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.630482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2128  hypothetical protein  57.78 
 
 		 295 aa  160  4e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.400478  hitchhiker  0.00659313 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00220  metalloendopeptidase-like membrane protein  38.01 
 
 		 554 aa  159  9e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2275  hypothetical protein  53.33 
 
 		 282 aa  146  5e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.329742  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4522  hypothetical protein  52.59 
 
 		 275 aa  139  6e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.594874 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5544  hypothetical protein  43.1 
 
 		 437 aa  137  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.0727339 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5946  hypothetical protein  43.1 
 
 		 437 aa  137  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4302  hypothetical protein  46.75 
 
 		 305 aa  122  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.628164 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2543  hypothetical protein  47.1 
 
 		 275 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.578338  decreased coverage  0.00000438668 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2395  hypothetical protein  47.83 
 
 		 261 aa  111  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00354329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3850  hypothetical protein  42.86 
 
 		 194 aa  106  8e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0072  hypothetical protein  42.86 
 
 		 200 aa  105  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.736738 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4566  hypothetical protein  42.11 
 
 		 203 aa  105  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.252363 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1141  hypothetical protein  35.23 
 
 		 309 aa  105  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.617877  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2417  hypothetical protein  42.86 
 
 		 194 aa  105  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0954159 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2996  hypothetical protein  42.11 
 
 		 194 aa  104  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000318278 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2414  hypothetical protein  42.86 
 
 		 203 aa  104  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.291745 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5084  hypothetical protein  42.86 
 
 		 207 aa  103  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000555714 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3211  hypothetical protein  42.11 
 
 		 193 aa  103  6e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.729102 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0244  hypothetical protein  42.11 
 
 		 192 aa  103  7e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0151406 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2244  peptidase M23B  44.76 
 
 		 1048 aa  102  8e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1131  hypothetical protein  44.8 
 
 		 301 aa  102  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25980  hypothetical protein  46.77 
 
 		 287 aa  101  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2527  hypothetical protein  35.21 
 
 		 272 aa  102  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000287689 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2319  hypothetical protein  41.35 
 
 		 194 aa  101  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.229041  normal  0.0161406 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3348  hypothetical protein  41.35 
 
 		 194 aa  101  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.372059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3471  hypothetical protein  41.35 
 
 		 194 aa  100  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1573  peptidase M23B  29.41 
 
 		 348 aa  100  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0724492  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1977  hypothetical protein  41.35 
 
 		 194 aa  100  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158034  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2985  hypothetical protein  41.35 
 
 		 194 aa  100  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0996  hypothetical protein  46.22 
 
 		 286 aa  100  6e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2042  hypothetical protein  41.35 
 
 		 194 aa  99.4  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.936652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3999  hypothetical protein  41.35 
 
 		 194 aa  98.6  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4187  hypothetical protein  41.35 
 
 		 194 aa  98.6  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3460  hypothetical protein  43.45 
 
 		 284 aa  98.2  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.907261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  38.27 
 
 		 375 aa  97.8  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0038  peptidase M23B  40.74 
 
 		 330 aa  97.8  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2807  hypothetical protein  42.22 
 
 		 283 aa  97.4  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0224369  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1845  hypothetical protein  47.97 
 
 		 281 aa  97.8  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.661954  normal  0.35188 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1090  hypothetical protein  40.51 
 
 		 256 aa  97.1  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.018463  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3840  hypothetical protein  40.23 
 
 		 284 aa  95.9  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.427443  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0633  Co/Zn/Cd efflux system component  35 
 
 		 312 aa  95.1  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0706968  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5542  hypothetical protein  42.98 
 
 		 209 aa  93.2  7e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.0579814 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5944  hypothetical protein  42.98 
 
 		 209 aa  93.2  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0493  hypothetical protein  34.6 
 
 		 281 aa  92.8  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.580154  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  39.1 
 
 		 329 aa  92.4  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1194  hypothetical protein  36.81 
 
 		 320 aa  92.4  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  42.4 
 
 		 238 aa  91.7  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  38.56 
 
 		 824 aa  91.7  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4426  CHAP domain containing protein  44.74 
 
 		 635 aa  91.3  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.649059 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0974  hypothetical protein  40.44 
 
 		 321 aa  89.7  8e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  39.23 
 
 		 314 aa  88.6  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  37.33 
 
 		 455 aa  87.4  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  39.86 
 
 		 238 aa  87.4  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  39.86 
 
 		 238 aa  87.4  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  38.04 
 
 		 243 aa  87  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0889  NLP/P60 protein  34.73 
 
 		 337 aa  87  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  36.73 
 
 		 727 aa  87  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  36.73 
 
 		 727 aa  87  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  41.32 
 
 		 754 aa  86.7  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5984  peptidase M23B  37.41 
 
 		 284 aa  86.3  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0310033  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3901  hypothetical protein  33.49 
 
 		 293 aa  85.9  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0140637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  36.13 
 
 		 455 aa  85.9  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  36.31 
 
 		 404 aa  85.5  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4708  peptidase M23B  41.38 
 
 		 360 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1202  Peptidase M23  39.26 
 
 		 367 aa  85.1  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1864  peptidase M23B  37.58 
 
 		 351 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.102724 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  36.24 
 
 		 452 aa  84.7  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4328  peptidase M23B  41.38 
 
 		 360 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3025  hypothetical protein  43.65 
 
 		 258 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.144373  normal  0.932008 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4414  peptidase M23B  41.38 
 
 		 360 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.307323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6368  Peptidase M23  32.49 
 
 		 269 aa  84.7  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  39.57 
 
 		 468 aa  85.1  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  36.99 
 
 		 590 aa  84.3  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  36.67 
 
 		 453 aa  84.3  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0633  Peptidase M23  36.11 
 
 		 198 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0652  Peptidase M23  36.11 
 
 		 198 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00716754  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2817  peptidase M23B  33.49 
 
 		 339 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3705  peptidase M23B  36.08 
 
 		 340 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  39.67 
 
 		 376 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  34.81 
 
 		 454 aa  83.2  0.000000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  37.33 
 
 		 457 aa  82.8  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  37.06 
 
 		 751 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  35.48 
 
 		 456 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3297  peptidase M23B  41.32 
 
 		 448 aa  82  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00235812  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4871  peptidase M23B  36.94 
 
 		 348 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.289392  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7951  hypothetical protein  35.42 
 
 		 312 aa  82  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5378  peptidase M23B  33.02 
 
 		 339 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0795  peptidase M23B  41.59 
 
 		 316 aa  81.6  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.244316 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  34.46 
 
 		 482 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  40.34 
 
 		 425 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1170  hypothetical protein  41.48 
 
 		 280 aa  80.9  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0379591  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0696  peptidase M23B  34.1 
 
 		 459 aa  81.3  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000424266  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4510  peptidase M23B  35.62 
 
 		 334 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>