72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_5542 on replicon NC_008147
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008147  Mmcs_5542  hypothetical protein  100 
 
 		 209 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.0579814 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5944  hypothetical protein  100 
 
 		 209 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5544  hypothetical protein  43.81 
 
 		 437 aa  147  8e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.0727339 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5946  hypothetical protein  43.81 
 
 		 437 aa  147  8e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4738  peptidase M23B  42.15 
 
 		 388 aa  107  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000208513 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4302  peptidase M23B  42.98 
 
 		 387 aa  103  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.416455  normal  0.37822 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2128  hypothetical protein  38.14 
 
 		 295 aa  93.6  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.400478  hitchhiker  0.00659313 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2275  hypothetical protein  35.25 
 
 		 282 aa  90.9  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.329742  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4522  hypothetical protein  33.9 
 
 		 275 aa  77.4  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.594874 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1977  hypothetical protein  32.09 
 
 		 194 aa  71.6  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158034  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3471  hypothetical protein  32.09 
 
 		 194 aa  71.6  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3348  hypothetical protein  32.09 
 
 		 194 aa  71.6  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.372059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2319  hypothetical protein  32.09 
 
 		 194 aa  71.2  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.229041  normal  0.0161406 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2985  hypothetical protein  31.34 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0688  Peptidase M23  37.78 
 
 		 383 aa  70.1  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.50956  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4187  hypothetical protein  30.6 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3999  hypothetical protein  30.6 
 
 		 194 aa  68.2  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2414  hypothetical protein  30.6 
 
 		 203 aa  68.2  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.291745 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2042  hypothetical protein  30.6 
 
 		 194 aa  67.8  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.936652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3460  hypothetical protein  30.13 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.907261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2996  hypothetical protein  29.85 
 
 		 194 aa  67  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000318278 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3850  hypothetical protein  29.85 
 
 		 194 aa  67  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5084  hypothetical protein  29.85 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000555714 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0824  Peptidase M23  35.2 
 
 		 378 aa  65.5  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2395  hypothetical protein  31.62 
 
 		 261 aa  65.5  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00354329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4566  hypothetical protein  29.85 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.252363 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2543  hypothetical protein  30.88 
 
 		 275 aa  64.3  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.578338  decreased coverage  0.00000438668 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0072  hypothetical protein  29.1 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.736738 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00220  metalloendopeptidase-like membrane protein  28.25 
 
 		 554 aa  64.3  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3211  hypothetical protein  29.1 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.729102 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0244  hypothetical protein  29.1 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0151406 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2417  hypothetical protein  28.36 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0954159 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3840  hypothetical protein  32.76 
 
 		 284 aa  62.8  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.427443  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1845  hypothetical protein  31.4 
 
 		 281 aa  61.2  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.661954  normal  0.35188 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06630  metalloendopeptidase-like membrane protein  26.42 
 
 		 547 aa  60.1  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.630482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5428  Peptidase M23  37.04 
 
 		 349 aa  58.9  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0440  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  30.47 
 
 		 392 aa  58.2  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2152  hypothetical protein  28.57 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.41449 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3025  hypothetical protein  33.33 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.144373  normal  0.932008 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0633  Co/Zn/Cd efflux system component  30.17 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0706968  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7951  hypothetical protein  33 
 
 		 312 aa  55.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4302  hypothetical protein  36.11 
 
 		 305 aa  55.8  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.628164 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0487  Peptidase M23  29.6 
 
 		 379 aa  55.8  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0974  hypothetical protein  31.4 
 
 		 321 aa  55.5  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4183  CHAP domain-containing protein  28.76 
 
 		 358 aa  55.1  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2244  peptidase M23B  30.65 
 
 		 1048 aa  55.1  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1131  hypothetical protein  29.2 
 
 		 301 aa  54.7  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4510  CHAP domain-containing protein  32.28 
 
 		 359 aa  54.3  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.160949  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1090  hypothetical protein  30.51 
 
 		 256 aa  54.3  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.018463  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0996  hypothetical protein  29.13 
 
 		 286 aa  53.9  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1194  hypothetical protein  26.4 
 
 		 320 aa  53.1  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25980  hypothetical protein  28.21 
 
 		 287 aa  52.4  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4284  CHAP domain-containing protein  33.05 
 
 		 360 aa  52.8  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.838801  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8432  hypothetical protein  32.32 
 
 		 274 aa  52.4  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.774825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8932  NLP/P60 protein  25.71 
 
 		 367 aa  52  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00108547  normal  0.263686 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2527  hypothetical protein  29.51 
 
 		 272 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000287689 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11160  hypothetical protein  24.16 
 
 		 315 aa  50.1  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1141  hypothetical protein  28.23 
 
 		 309 aa  50.4  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.617877  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0889  NLP/P60 protein  31.19 
 
 		 337 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4426  CHAP domain containing protein  30.25 
 
 		 635 aa  49.7  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.649059 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0493  hypothetical protein  26.13 
 
 		 281 aa  49.3  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.580154  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  27.82 
 
 		 329 aa  49.3  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2807  hypothetical protein  28.57 
 
 		 283 aa  49.3  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0224369  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4551  CHAP domain containing protein  28.8 
 
 		 357 aa  49.3  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.374294 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3901  hypothetical protein  24.57 
 
 		 293 aa  48.5  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0140637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1170  hypothetical protein  30 
 
 		 280 aa  48.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0379591  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1952  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  24.82 
 
 		 391 aa  47.8  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.383383  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3097  hypothetical protein  35.82 
 
 		 547 aa  45.8  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2503  LGFP repeat-containing protein  31.3 
 
 		 344 aa  44.7  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272639  normal  0.0821052 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0642  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  33.33 
 
 		 386 aa  43.5  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5541  hypothetical protein  31.07 
 
 		 385 aa  42.7  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0771131 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2808  hypothetical protein  28.8 
 
 		 183 aa  42  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408575  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>