87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_00310 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_00310  CHAP domain-containing protein  100 
 
 
302 aa  619  1e-176  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11330  putative cell wall binding protein  55.12 
 
 
502 aa  145  1e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.307599  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00690  putative cell wall binding protein  44.85 
 
 
2495 aa  142  9e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00880  putative cell wall binding protein  60.17 
 
 
478 aa  139  6e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal  0.955176 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0550  cell wall binding repeat-containing protein  47.06 
 
 
330 aa  138  8.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.515915  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25520  conserved repeat protein  53.96 
 
 
613 aa  135  9.999999999999999e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07880  glucan-binding domain-containing protein  47.8 
 
 
651 aa  134  1.9999999999999998e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00352799 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14530  glucan-binding domain-containing protein  48.57 
 
 
602 aa  126  6e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.259034 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0611  cell wall binding repeat-containing protein  46.1 
 
 
430 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0607  cell wall binding repeat-containing protein  42.55 
 
 
454 aa  124  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0605  cell wall binding repeat-containing protein/mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  42.14 
 
 
807 aa  120  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.187255  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02530  glucan-binding domain-containing protein  49.26 
 
 
377 aa  120  3e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.459016  normal  0.0379723 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00230  dipeptidase  45.67 
 
 
750 aa  119  7.999999999999999e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00762022 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05950  glucan-binding domain-containing protein  44.8 
 
 
753 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000330124  hitchhiker  0.0000000000107499 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06430  M6 family metalloprotease domain-containing protein  46.4 
 
 
811 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0919314 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0057  cell wall protein precursor, choline binding protein  43.68 
 
 
279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14450  glucan-binding domain-containing protein  40.23 
 
 
532 aa  116  5e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.521361  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0606  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  45.83 
 
 
550 aa  115  7.999999999999999e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.907737  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06260  glucan-binding domain-containing protein  44.9 
 
 
324 aa  111  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0591  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  35.12 
 
 
573 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000159659  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11960  putative cell wall binding protein  49.6 
 
 
578 aa  107  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000480831  normal  0.155715 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14470  putative cell wall binding protein  42.25 
 
 
512 aa  107  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.437968  normal  0.444931 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09550  putative cell wall binding protein  44.44 
 
 
331 aa  105  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0189396  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08300  glycosyl hydrolase family 25  41.54 
 
 
592 aa  104  2e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.39526 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0593  cell wall binding repeat-containing protein  37.59 
 
 
552 aa  100  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000201841  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05190  putative cell wall binding protein  42.06 
 
 
440 aa  100  4e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0592  cell wall binding repeat-containing protein/mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  36.09 
 
 
891 aa  96.3  6e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0288009  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18640  calcineurin-like phosphoesterase  37.44 
 
 
1732 aa  95.9  7e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16990  glucan-binding domain-containing protein  36.97 
 
 
342 aa  95.1  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16000  putative cell wall binding protein  45.38 
 
 
316 aa  94.4  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000272933 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0490  cell wall binding repeat-containing protein  41.35 
 
 
1557 aa  92.8  6e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14440  subtilase family protease  37.82 
 
 
817 aa  90.9  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0597  surface protein pspA precursor  40.58 
 
 
434 aa  90.5  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14460  glucan-binding domain-containing protein  44.35 
 
 
757 aa  88.2  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.706218  normal  0.855897 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05010  putative cell wall binding protein  41.18 
 
 
203 aa  86.3  6e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0151  S-layer domain ribonuclease  34.72 
 
 
1131 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.965938  hitchhiker  0.000000320353 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0121  S-layer domain-containing ribonuclease  34.72 
 
 
1131 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104142 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0077  S-layer protein  34.03 
 
 
697 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0803176  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0891  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41 
 
 
762 aa  81.3  0.00000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0223841  normal  0.138276 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0595  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  37.5 
 
 
350 aa  80.5  0.00000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0114709  normal  0.325418 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4426  CHAP domain containing protein  32.1 
 
 
635 aa  79.3  0.00000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.649059 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04260  putative cell wall binding protein  33.33 
 
 
465 aa  70.1  0.00000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.878918  normal  0.401989 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1884  secretory antigen precursor SsaA, putative  45.35 
 
 
157 aa  70.1  0.00000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02470  putative cell wall binding protein  38.54 
 
 
271 aa  68.6  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.901982 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4551  CHAP domain containing protein  31.45 
 
 
357 aa  65.5  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.374294 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0318  LysM domain-containing protein  45.98 
 
 
266 aa  62.8  0.000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.460625  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4284  CHAP domain-containing protein  32.64 
 
 
360 aa  59.7  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.838801  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0857  glycosyl hydrolase  31.25 
 
 
2821 aa  59.7  0.00000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02590  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.65 
 
 
339 aa  59.3  0.00000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000561164 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0689  CHAP domain-containing protein  44.32 
 
 
265 aa  58.5  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00699042  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0704  CHAP domain-containing protein  44.32 
 
 
265 aa  58.5  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000444371  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5584  cell wall binding repeat-containing protein  26.47 
 
 
737 aa  58.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0013  peptidoglycan hydrolase  29.84 
 
 
589 aa  57.4  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0013556  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4183  CHAP domain-containing protein  31.13 
 
 
358 aa  57  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15380  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.78 
 
 
268 aa  55.8  0.0000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00636935  normal  0.0253427 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0796  CHAP domain-containing protein  48.33 
 
 
279 aa  55.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0779  CHAP domain-containing protein  48.33 
 
 
279 aa  55.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.635904  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0761  LysM domain-containing protein  25.64 
 
 
156 aa  54.3  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1747  YG repeat-containing glycosyl hydrolase family 70 protein  29.7 
 
 
1527 aa  53.5  0.000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1752  glycosyl hydrolase  30.08 
 
 
1514 aa  50.4  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2366  CHAP domain-containing protein  44.78 
 
 
267 aa  49.3  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.38467  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2323  CHAP domain-containing protein  44.78 
 
 
267 aa  49.3  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.404818  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0100  LysM domain-containing protein  36.84 
 
 
324 aa  49.3  0.00009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2620  CHAP domain-containing protein  33.33 
 
 
143 aa  48.5  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0422  LysM domain-containing protein  42.42 
 
 
266 aa  48.9  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2567  CHAP domain-containing protein  33.33 
 
 
143 aa  48.5  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0091  hypothetical protein  31.03 
 
 
587 aa  48.1  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4510  CHAP domain-containing protein  27.04 
 
 
359 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.160949  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0017  PcsB protein  47.46 
 
 
447 aa  48.1  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.228  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0265  CHAP domain-containing protein  38.16 
 
 
300 aa  47.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0272  CHAP domain-containing protein  38.16 
 
 
300 aa  47.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0042  glucan binding protein  45.16 
 
 
455 aa  47.4  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.634979  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2380  CHAP domain containing protein  33.04 
 
 
582 aa  47  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2136  secretory antigen precursor SsaA  37.88 
 
 
257 aa  46.6  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1880  secretory antigen precursor SsaA  37.88 
 
 
257 aa  46.6  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2370  CHAP domain-containing protein  45.76 
 
 
166 aa  46.2  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.918618  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2327  CHAP domain-containing protein  45.76 
 
 
166 aa  46.2  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2120  secretory antigen precursor SsaA-related protein  34.57 
 
 
143 aa  46.2  0.0008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2588  CHAP domain-containing protein  41.79 
 
 
255 aa  44.3  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0478  surface antigen  30.83 
 
 
499 aa  44.3  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2642  CHAP domain-containing protein  41.79 
 
 
255 aa  44.3  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2615  CHAP domain-containing protein  30.47 
 
 
560 aa  44.3  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0544  YG repeat-containing glycosyl hydrolase  23.73 
 
 
1475 aa  44.3  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0499  CHAP domain-containing protein  38.81 
 
 
334 aa  42.7  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000123555  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0486  CHAP domain-containing protein  38.81 
 
 
334 aa  42.7  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0271604  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0859  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.21 
 
 
399 aa  42.7  0.008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000303579  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0888  cell wall hydrolase/autolysin  29.27 
 
 
890 aa  42.4  0.009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000852469  normal  0.142876 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>