74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3481 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3481  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 767 aa  1528    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0132558  hitchhiker  0.0026224 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30070  transglycosylase family protein  40.29 
 
 		 278 aa  92.4  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.398467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7309  hypothetical protein  34.59 
 
 		 324 aa  79.7  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27870  hypothetical protein  33.8 
 
 		 227 aa  71.6  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.86582  normal  0.0220968 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38120  transglycosylase family protein  41 
 
 		 376 aa  71.6  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.669313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0533  Phage-related protein-like protein  30.46 
 
 		 1077 aa  70.9  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.132242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4936  Lytic transglycosylase catalytic  42.27 
 
 		 278 aa  70.9  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0731  Lytic transglycosylase catalytic  42.71 
 
 		 289 aa  68.2  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.860163  normal  0.231095 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1637  SLT domain-containing protein  37.98 
 
 		 1736 aa  67.8  0.0000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1891  Lytic transglycosylase catalytic  52.24 
 
 		 304 aa  67  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4940  Transglycosylase domain protein  30.34 
 
 		 682 aa  65.1  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2094  SLT domain-containing protein  34.01 
 
 		 1566 aa  63.5  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1847  hypothetical protein  20.65 
 
 		 877 aa  62.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0202456 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0965  hypothetical protein  38.03 
 
 		 1070 aa  62.4  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3282  Phage-related protein-like protein  36.78 
 
 		 841 aa  62  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.858294  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3035  Phage-related protein-like protein  36.78 
 
 		 841 aa  62  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.716589  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3413  prophage membrane protein  21.12 
 
 		 726 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3774  prophage LambdaBa01, membrane protein  20.69 
 
 		 811 aa  59.3  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3497  prophage LambdaBa01, membrane protein  20.69 
 
 		 811 aa  59.3  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.797646  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3416  prophage LambdaBa01, membrane protein, putative  21.36 
 
 		 725 aa  58.5  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0364  hypothetical protein  22.17 
 
 		 989 aa  57.8  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0355  Phage-related protein-like protein  22.17 
 
 		 989 aa  57.8  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3457  hypothetical protein  39.22 
 
 		 220 aa  56.6  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.102904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5946  hypothetical protein  31.97 
 
 		 437 aa  55.8  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5924  hypothetical protein  38.46 
 
 		 370 aa  55.8  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5544  hypothetical protein  31.97 
 
 		 437 aa  55.8  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.0727339 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1194  hypothetical protein  36.08 
 
 		 320 aa  55.5  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0505  hypothetical protein  37.74 
 
 		 364 aa  55.5  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3215  hypothetical protein  38.83 
 
 		 216 aa  55.1  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2764  hypothetical protein  33.68 
 
 		 294 aa  55.1  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3631  hypothetical protein  33.94 
 
 		 336 aa  54.7  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.910562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1107  phage tape measure protein  31.76 
 
 		 1276 aa  54.7  0.000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1369  TP901 family phage tail tape measure protein  31.15 
 
 		 1347 aa  53.9  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.275102  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0846  lytic transglycosylase, catalytic  37.08 
 
 		 1216 aa  53.9  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1133  hypothetical protein  37.37 
 
 		 358 aa  52.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0289108 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0597  putative prophage membrane protein  20.4 
 
 		 716 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0454  prophage LambdaBa04, tape measure protein  32.93 
 
 		 1311 aa  52.8  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0549  TP901 family phage tail tape measure protein  30.05 
 
 		 1347 aa  53.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.321201  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0804  hypothetical protein  32.03 
 
 		 349 aa  53.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.633218 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0477  prophage LambdaBa04, tape measure protein  32.93 
 
 		 1311 aa  52.8  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0930  hypothetical protein  29.13 
 
 		 357 aa  52.4  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2500  hypothetical protein  32.5 
 
 		 339 aa  52.8  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718285  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1146  Mu-like phage minor tail protein  22.59 
 
 		 1137 aa  52  0.00004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10325  hypothetical protein  36.08 
 
 		 220 aa  51.2  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2082  hypothetical protein  28.39 
 
 		 364 aa  50.8  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0263451  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8106  SLT domain protein-like protein  42.7 
 
 		 416 aa  50.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.886966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2244  peptidase M23B  34 
 
 		 1048 aa  50.4  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3248  hypothetical protein  25.54 
 
 		 318 aa  50.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.483531  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11745  hypothetical protein  40.79 
 
 		 256 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.409869 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2904  hypothetical protein  39.08 
 
 		 251 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5355  hypothetical protein  36.94 
 
 		 365 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2948  hypothetical protein  39.08 
 
 		 251 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.717952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5444  hypothetical protein  36.94 
 
 		 365 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.421103 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1672  hypothetical protein  37.63 
 
 		 234 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.658702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5734  hypothetical protein  36.94 
 
 		 365 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.765847 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2934  hypothetical protein  39.08 
 
 		 251 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.121978 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1369  hypothetical protein  35.42 
 
 		 251 aa  49.3  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1709  Phage-related protein-like protein  23.91 
 
 		 759 aa  48.9  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2527  hypothetical protein  27.59 
 
 		 340 aa  48.9  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5081  hypothetical protein  38.04 
 
 		 232 aa  48.5  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0402  hypothetical protein  40 
 
 		 199 aa  48.1  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0472134  normal  0.221882 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0414  hypothetical protein  40 
 
 		 201 aa  48.1  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0423  hypothetical protein  40 
 
 		 201 aa  48.1  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1132  hypothetical protein  43.64 
 
 		 300 aa  48.1  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0290503 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0305  hypothetical protein  35.42 
 
 		 317 aa  47  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7968  hypothetical protein  28.21 
 
 		 303 aa  47  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.844249  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0540  hypothetical protein  32 
 
 		 366 aa  47  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5849  hypothetical protein  19.17 
 
 		 786 aa  46.6  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1449  TP901 family phage tail tape measure protein  24.76 
 
 		 1120 aa  46.6  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1742  hypothetical protein  30.56 
 
 		 1448 aa  45.4  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.416454 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0671  TMP repeat protein  19.17 
 
 		 871 aa  45.4  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5762  hypothetical protein  35.87 
 
 		 322 aa  45.4  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2400  phage protein  21.69 
 
 		 1297 aa  44.7  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2434  hypothetical protein  32.43 
 
 		 324 aa  44.7  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.259817  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>