16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1369 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1369  hypothetical protein  100 
 
 
251 aa  499  1e-140  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1417  hypothetical protein  50.72 
 
 
262 aa  180  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.140101  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1194  hypothetical protein  43.01 
 
 
320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2244  peptidase M23B  34.74 
 
 
1048 aa  52.8  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2434  hypothetical protein  30.71 
 
 
324 aa  52  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.259817  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0804  hypothetical protein  30.95 
 
 
349 aa  52  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.633218 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06630  metalloendopeptidase-like membrane protein  34.04 
 
 
547 aa  51.6  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.630482  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00220  metalloendopeptidase-like membrane protein  33.33 
 
 
554 aa  51.2  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3481  Lytic transglycosylase catalytic  35.42 
 
 
767 aa  50.8  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0132558  hitchhiker  0.0026224 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1152  Peptidase M15A  28.24 
 
 
1050 aa  48.9  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000448461 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1132  hypothetical protein  43.86 
 
 
300 aa  45.8  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0290503 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7951  hypothetical protein  30.6 
 
 
312 aa  45.4  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0443  hypothetical protein  29.19 
 
 
366 aa  45.4  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0531  hypothetical protein  30.82 
 
 
338 aa  44.7  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0202558  normal  0.0548232 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1943  hypothetical protein  32.56 
 
 
289 aa  42.7  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.762706  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2500  hypothetical protein  27.87 
 
 
339 aa  42.7  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718285  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>