36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3390 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3390  hypothetical protein  100 
 
 		 356 aa  723    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3632  hypothetical protein  78.96 
 
 		 347 aa  548  1e-155  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.960299  hitchhiker  0.000777335 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0441  hypothetical protein  50.81 
 
 		 333 aa  298  1e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118426 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0370  hypothetical protein  49.35 
 
 		 335 aa  290  3e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4018  hypothetical protein  42.49 
 
 		 331 aa  243  3.9999999999999997e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0443  hypothetical protein  40.29 
 
 		 366 aa  223  3e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0531  hypothetical protein  41.54 
 
 		 338 aa  222  7e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0202558  normal  0.0548232 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1132  hypothetical protein  39.2 
 
 		 300 aa  199  6e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0290503 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1133  hypothetical protein  34.34 
 
 		 358 aa  174  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0289108 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3631  hypothetical protein  27.96 
 
 		 336 aa  102  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.910562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2500  hypothetical protein  24.41 
 
 		 339 aa  85.1  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718285  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7309  hypothetical protein  26.27 
 
 		 324 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2527  hypothetical protein  31.79 
 
 		 340 aa  76.6  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0804  hypothetical protein  25.81 
 
 		 349 aa  73.6  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.633218 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0930  hypothetical protein  34.33 
 
 		 357 aa  72.8  0.000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2434  hypothetical protein  38.14 
 
 		 324 aa  72.8  0.000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.259817  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0305  hypothetical protein  32.8 
 
 		 317 aa  71.6  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0294  hypothetical protein  32.33 
 
 		 322 aa  70.9  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7968  hypothetical protein  23.85 
 
 		 303 aa  70.1  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.844249  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00220  metalloendopeptidase-like membrane protein  33.33 
 
 		 554 aa  69.7  0.00000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2764  hypothetical protein  34.96 
 
 		 294 aa  69.3  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2082  hypothetical protein  33.33 
 
 		 364 aa  62.4  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0263451  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06630  metalloendopeptidase-like membrane protein  31.82 
 
 		 547 aa  57  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.630482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1943  hypothetical protein  36.05 
 
 		 289 aa  54.7  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.762706  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  26.46 
 
 		 337 aa  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2244  peptidase M23B  34.12 
 
 		 1048 aa  49.7  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27870  hypothetical protein  32.93 
 
 		 227 aa  48.9  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.86582  normal  0.0220968 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  24.72 
 
 		 337 aa  46.6  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  23 
 
 		 374 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1508  NLP/P60 protein  23.7 
 
 		 348 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3457  hypothetical protein  29.03 
 
 		 220 aa  43.9  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.102904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2904  hypothetical protein  32.1 
 
 		 251 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2948  hypothetical protein  32.1 
 
 		 251 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.717952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2934  hypothetical protein  32.1 
 
 		 251 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.121978 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3878  LGFP repeat protein  48.89 
 
 		 407 aa  43.9  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0449633 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4940  Transglycosylase domain protein  28.92 
 
 		 682 aa  43.1  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>