36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4018 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4018  hypothetical protein  100 
 
 
331 aa  672    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107588  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1133  hypothetical protein  49.85 
 
 
358 aa  270  2e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0289108 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3390  hypothetical protein  42.74 
 
 
356 aa  248  1e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3632  hypothetical protein  40.71 
 
 
347 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.960299  hitchhiker  0.000777335 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1132  hypothetical protein  45.21 
 
 
300 aa  226  6e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0290503 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0370  hypothetical protein  40.91 
 
 
335 aa  219  6e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0441  hypothetical protein  42.96 
 
 
333 aa  212  7e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118426 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0443  hypothetical protein  37.43 
 
 
366 aa  198  9e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0531  hypothetical protein  37.07 
 
 
338 aa  188  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0202558  normal  0.0548232 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0804  hypothetical protein  27.87 
 
 
349 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.633218 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3631  hypothetical protein  28.43 
 
 
336 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.910562  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7968  hypothetical protein  28.57 
 
 
303 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.844249  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0930  hypothetical protein  30 
 
 
357 aa  97.4  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2500  hypothetical protein  27.12 
 
 
339 aa  94.4  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718285  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7309  hypothetical protein  28.31 
 
 
324 aa  93.6  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2527  hypothetical protein  38.06 
 
 
340 aa  89  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2764  hypothetical protein  25.08 
 
 
294 aa  88.2  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2434  hypothetical protein  27.78 
 
 
324 aa  80.1  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.259817  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0294  hypothetical protein  27.24 
 
 
322 aa  79.7  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00220  metalloendopeptidase-like membrane protein  34.9 
 
 
554 aa  78.2  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0305  hypothetical protein  26 
 
 
317 aa  77.4  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06630  metalloendopeptidase-like membrane protein  34.01 
 
 
547 aa  70.5  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.630482  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2082  hypothetical protein  33.33 
 
 
364 aa  67  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0263451  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0032  group B streptococcal surface immunogenic protein  28.76 
 
 
434 aa  60.8  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.85122  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5879  NLP/P60 protein  28.03 
 
 
333 aa  60.1  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884921  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2244  peptidase M23B  31.85 
 
 
1048 aa  57.8  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27870  hypothetical protein  34.15 
 
 
227 aa  53.5  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.86582  normal  0.0220968 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  28.19 
 
 
334 aa  52.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  27.7 
 
 
331 aa  48.9  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1943  hypothetical protein  26.76 
 
 
289 aa  48.1  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.762706  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3878  LGFP repeat protein  52.27 
 
 
407 aa  47  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0449633 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3958  NLP/P60 protein  25 
 
 
323 aa  45.8  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.068937  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1508  NLP/P60 protein  25 
 
 
348 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0265  NlpC/P60 family protein  26.53 
 
 
432 aa  44.3  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.894472  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2368  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  31.33 
 
 
288 aa  43.9  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.238108  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0656  chromosome segregation ATPases-like protein  29.22 
 
 
526 aa  42.4  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0611009  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>