48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3215 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3215  hypothetical protein  100 
 
 
216 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2904  hypothetical protein  73.97 
 
 
251 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2934  hypothetical protein  73.97 
 
 
251 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.121978 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2948  hypothetical protein  73.97 
 
 
251 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.717952  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3457  hypothetical protein  75.45 
 
 
220 aa  310  1e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.102904  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11745  hypothetical protein  71.43 
 
 
256 aa  307  9e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.409869 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1672  hypothetical protein  53.93 
 
 
234 aa  170  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.658702  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5081  hypothetical protein  59.85 
 
 
232 aa  166  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10325  hypothetical protein  55.03 
 
 
220 aa  155  7e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5544  hypothetical protein  51.83 
 
 
437 aa  151  8e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.0727339 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5946  hypothetical protein  51.83 
 
 
437 aa  151  8e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20698  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0423  hypothetical protein  63.64 
 
 
201 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0402  hypothetical protein  63.64 
 
 
199 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0472134  normal  0.221882 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0414  hypothetical protein  63.64 
 
 
201 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5762  hypothetical protein  53.49 
 
 
322 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0505  hypothetical protein  52.05 
 
 
364 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4940  Transglycosylase domain protein  48.09 
 
 
682 aa  127  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5924  hypothetical protein  57.26 
 
 
370 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5444  hypothetical protein  53.23 
 
 
365 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.421103 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5355  hypothetical protein  53.23 
 
 
365 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5734  hypothetical protein  53.23 
 
 
365 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.765847 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5947  hypothetical protein  40.32 
 
 
171 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.264862  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5545  hypothetical protein  40.32 
 
 
171 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.092464 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2527  hypothetical protein  40.66 
 
 
340 aa  68.9  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1943  hypothetical protein  32.76 
 
 
289 aa  67  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.762706  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0804  hypothetical protein  39.84 
 
 
349 aa  65.1  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.633218 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7968  hypothetical protein  31.75 
 
 
303 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.844249  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2244  peptidase M23B  42.86 
 
 
1048 aa  63.2  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2764  hypothetical protein  37.04 
 
 
294 aa  62.8  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2082  hypothetical protein  38.32 
 
 
364 aa  61.6  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0263451  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2500  hypothetical protein  34.91 
 
 
339 aa  61.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718285  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7309  hypothetical protein  36.59 
 
 
324 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2434  hypothetical protein  47.06 
 
 
324 aa  60.5  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.259817  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27870  hypothetical protein  35.71 
 
 
227 aa  57.4  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.86582  normal  0.0220968 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0305  hypothetical protein  34.48 
 
 
317 aa  57.4  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0032  group B streptococcal surface immunogenic protein  34.15 
 
 
434 aa  55.5  0.0000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.85122  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3631  hypothetical protein  37.04 
 
 
336 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.910562  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0930  hypothetical protein  40 
 
 
357 aa  54.7  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0294  hypothetical protein  35 
 
 
322 aa  53.1  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2368  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  40 
 
 
288 aa  52.4  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.238108  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3481  Lytic transglycosylase catalytic  39.13 
 
 
767 aa  51.2  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0132558  hitchhiker  0.0026224 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0531  hypothetical protein  33.33 
 
 
338 aa  47.8  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0202558  normal  0.0548232 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2375  surface antigen  37.63 
 
 
291 aa  46.6  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409403  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0443  hypothetical protein  33.33 
 
 
366 aa  45.4  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0441  hypothetical protein  32.26 
 
 
333 aa  45.1  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118426 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3632  hypothetical protein  38.89 
 
 
347 aa  43.1  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.960299  hitchhiker  0.000777335 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0370  hypothetical protein  34.41 
 
 
335 aa  43.5  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3390  hypothetical protein  37.04 
 
 
356 aa  42.4  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.389067 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>