67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3878 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3878  LGFP repeat protein  100 
 
 		 407 aa  797    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0449633 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3879  SpoIID/LytB domain  55.33 
 
 		 664 aa  211  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00907037 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0039  LGFP repeat protein  52.48 
 
 		 306 aa  197  3e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.133931 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1965  LGFP repeat protein  63.35 
 
 		 316 aa  196  4.0000000000000005e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3877  LGFP repeat protein  58.99 
 
 		 654 aa  196  9e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.200487  normal  0.0193324 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36860  glucose/sorbosone dehydrogenase  47.21 
 
 		 892 aa  174  2.9999999999999996e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.095894  normal  0.0512972 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  47.83 
 
 		 846 aa  161  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1717  LGFP repeat-containing protein  47.06 
 
 		 595 aa  159  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.2949 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4447  LGFP repeat protein  41.71 
 
 		 695 aa  155  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445822 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0059  LGFP repeat protein  44.88 
 
 		 351 aa  147  4.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.183151  normal  0.560607 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4329  LGFP repeat protein  42.66 
 
 		 928 aa  137  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4038  LGFP repeat protein  38.24 
 
 		 780 aa  136  8e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.046638 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4368  LGFP repeat protein  45.12 
 
 		 1040 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0967  SCP-like extracellular  43.78 
 
 		 475 aa  127  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0383584 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4327  LGFP repeat protein  44.83 
 
 		 967 aa  125  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.343026  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0168  putative esterase  44.38 
 
 		 546 aa  121  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.485619  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2804  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.81 
 
 		 364 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0769202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2701  LGFP repeat protein  37.8 
 
 		 322 aa  113  5e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.647471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4171  LGFP repeat protein  38.14 
 
 		 617 aa  110  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.621321 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3028  LGFP repeat protein  45.78 
 
 		 396 aa  109  9.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0732  hypothetical protein  38.85 
 
 		 185 aa  99.8  9e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2298  hypothetical protein  30.92 
 
 		 300 aa  96.7  6e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.181107 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2379  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  35.18 
 
 		 879 aa  94.7  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0102944 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2380  LGFP repeat protein  34.11 
 
 		 867 aa  89.4  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.729285  normal  0.0240945 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3957  LGFP repeat-containing protein  29.02 
 
 		 708 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.420458  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1016  LGFP repeat protein  37.97 
 
 		 205 aa  84  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0562  glycoside hydrolase family protein  36.5 
 
 		 496 aa  80.1  0.00000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6068  glycoside hydrolase family protein  38.21 
 
 		 399 aa  80.1  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2440  LGFP repeat-containing protein  33.83 
 
 		 686 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199605  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2213  LGFP repeat-containing protein  33.33 
 
 		 705 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0467397 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2167  LGFP  33.33 
 
 		 754 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.381725  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2156  LGFP repeat-containing protein  32.76 
 
 		 706 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00337154 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2269  LGFP repeat protein  38.3 
 
 		 186 aa  75.9  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2565  LGFP repeat protein  37.11 
 
 		 312 aa  72.4  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.387749  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2503  LGFP repeat-containing protein  34.42 
 
 		 344 aa  72  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272639  normal  0.0821052 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1152  Peptidase M15A  36.36 
 
 		 1050 aa  70.9  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000448461 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12735  hypothetical protein  34.11 
 
 		 699 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.724333 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5652  LGFP repeat-containing protein  42.37 
 
 		 539 aa  69.7  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.786051  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5403  LGFP repeat-containing protein  36.89 
 
 		 537 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.116536 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5022  LGFP  36.89 
 
 		 537 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5110  LGFP repeat-containing protein  36.89 
 
 		 537 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.667896 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4477  LGFP repeat-containing protein  38.89 
 
 		 370 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13845  hypothetical protein  40.21 
 
 		 539 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.280356 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1157  LGFP repeat-containing protein  42.24 
 
 		 541 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0583206  normal  0.0991304 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0531  hypothetical protein  37.19 
 
 		 338 aa  67.8  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0202558  normal  0.0548232 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2434  hypothetical protein  40.71 
 
 		 324 aa  67.4  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.259817  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0443  hypothetical protein  35.97 
 
 		 366 aa  66.6  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4018  hypothetical protein  37.14 
 
 		 331 aa  53.5  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107588  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0804  hypothetical protein  32.03 
 
 		 349 aa  53.5  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.633218 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1726  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.11 
 
 		 224 aa  51.6  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0528889  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0441  hypothetical protein  50 
 
 		 333 aa  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118426 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0930  hypothetical protein  30.71 
 
 		 357 aa  50.8  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3632  hypothetical protein  52.08 
 
 		 347 aa  50.4  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.960299  hitchhiker  0.000777335 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0370  hypothetical protein  51.06 
 
 		 335 aa  50.1  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3390  hypothetical protein  50 
 
 		 356 aa  47.8  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7309  hypothetical protein  33.33 
 
 		 324 aa  46.6  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2082  hypothetical protein  29.77 
 
 		 364 aa  45.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0263451  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0305  hypothetical protein  30.47 
 
 		 317 aa  45.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7968  hypothetical protein  30.94 
 
 		 303 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.844249  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2764  hypothetical protein  30.67 
 
 		 294 aa  45.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1132  hypothetical protein  43.14 
 
 		 300 aa  44.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0290503 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0294  hypothetical protein  31.96 
 
 		 322 aa  44.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1369  hypothetical protein  30.77 
 
 		 251 aa  44.3  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2244  peptidase M23B  36 
 
 		 1048 aa  43.5  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2527  hypothetical protein  33.7 
 
 		 340 aa  43.5  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3631  hypothetical protein  31.75 
 
 		 336 aa  43.1  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.910562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06630  metalloendopeptidase-like membrane protein  32.32 
 
 		 547 aa  43.1  0.009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.630482  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>