92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2804 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2804  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  100 
 
 
364 aa  748    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0769202  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1832  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  49.66 
 
 
379 aa  142  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3878  LGFP repeat protein  35.22 
 
 
407 aa  104  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0449633 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4330  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.18 
 
 
485 aa  87.8  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2153  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.53 
 
 
319 aa  80.5  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000738312  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2151  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.04 
 
 
306 aa  79.7  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0511643  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0732  hypothetical protein  33.73 
 
 
185 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.81 
 
 
391 aa  73.2  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5194  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.04 
 
 
306 aa  73.6  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00951194  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5192  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.81 
 
 
322 aa  71.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000000016794  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3994  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.33 
 
 
266 aa  67  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.552337  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0056  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.23 
 
 
160 aa  67.4  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1831  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.82 
 
 
323 aa  65.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1970  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.88 
 
 
160 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.607803 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0968  stage II sporulation D domain-containing protein  33.57 
 
 
462 aa  64.3  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00176967  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0221  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.33 
 
 
447 aa  63.9  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0446157  normal  0.633026 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1518  hypothetical protein  35.42 
 
 
241 aa  63.2  0.000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1960  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.67 
 
 
360 aa  62  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5193  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35 
 
 
356 aa  62.4  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000362844  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4396  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.67 
 
 
313 aa  61.6  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000949071 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1726  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  25.98 
 
 
224 aa  61.6  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0528889  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3185  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  28.77 
 
 
193 aa  59.3  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00515387  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4755  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.1 
 
 
269 aa  57.4  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.15503  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  31.03 
 
 
372 aa  57.4  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11630  metalloendopeptidase-like membrane protein  30.47 
 
 
323 aa  55.8  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4980  peptidoglycan binding domain-containing protein  50.79 
 
 
128 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2152  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.23 
 
 
356 aa  54.3  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000936807  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0804  hypothetical protein  32.33 
 
 
349 aa  54.3  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.633218 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03950  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  34.55 
 
 
303 aa  53.9  0.000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.759104 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0581  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.91 
 
 
330 aa  53.9  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000627689  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3619  cell wall hydrolase/autolysin  34.71 
 
 
313 aa  53.5  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.802629  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0267  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.25 
 
 
317 aa  53.5  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252847  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1152  Peptidase M15A  31.25 
 
 
1050 aa  52  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000448461 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2464  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.14 
 
 
201 aa  52  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000202368  normal  0.0272444 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39690  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.76 
 
 
382 aa  52  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3286  NLP/P60 protein  31.76 
 
 
450 aa  51.2  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1246  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.39 
 
 
508 aa  50.8  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1886  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.81 
 
 
635 aa  50.8  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3969  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.95 
 
 
232 aa  50.4  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2457  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.54 
 
 
294 aa  50.1  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.156102  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0945  peptidoglycan-binding domain 1 protein  47.46 
 
 
260 aa  49.7  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.572838  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0443  hypothetical protein  32.58 
 
 
366 aa  50.1  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0042  spore cortex-lytic enzyme  40.54 
 
 
228 aa  50.1  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.415977  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2294  cell wall hydrolase/autolysin  27.66 
 
 
358 aa  49.7  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3182  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  28.43 
 
 
375 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00209082 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0032  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.82 
 
 
323 aa  48.9  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0531  hypothetical protein  28.46 
 
 
338 aa  49.3  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0202558  normal  0.0548232 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5086  cell wall hydrolase/autolysin  35.45 
 
 
383 aa  49.3  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1959  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.82 
 
 
487 aa  49.3  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315261  normal  0.0108797 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0344  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.63 
 
 
309 aa  48.1  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2755  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.85 
 
 
170 aa  48.1  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4855  cell wall hydrolase/autolysin  30.91 
 
 
396 aa  48.1  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0729  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.71 
 
 
532 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2150  cell wall hydrolase/autolysin  32.73 
 
 
378 aa  48.5  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0960  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.37 
 
 
575 aa  47.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.538106  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0311  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.26 
 
 
360 aa  47.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5126  peptidoglycan-binding domain 1 protein  28.26 
 
 
200 aa  47.4  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.283972  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2188  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.06 
 
 
549 aa  47  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.68 
 
 
433 aa  47  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7088  cell wall hydrolase/autolysin  30.14 
 
 
379 aa  46.6  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3133  NLP/P60 protein  36.99 
 
 
454 aa  47  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000296935  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2233  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.98 
 
 
251 aa  46.6  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0730  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.55 
 
 
1089 aa  46.6  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2284  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.55 
 
 
198 aa  46.6  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.586079  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7968  hypothetical protein  32.06 
 
 
303 aa  46.2  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.844249  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2434  hypothetical protein  34.83 
 
 
324 aa  45.4  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.259817  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5099  cell wall hydrolase/autolysin  27.46 
 
 
387 aa  45.8  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000380245 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.13 
 
 
327 aa  45.1  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05880  cell wall hydrolase SleB  43.08 
 
 
229 aa  45.1  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.84059e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4421  glycoside hydrolase family protein  40.32 
 
 
243 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3152  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.74 
 
 
288 aa  44.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.396034  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0528  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.53 
 
 
334 aa  45.1  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0037  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  27.39 
 
 
332 aa  45.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  41.94 
 
 
232 aa  45.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4087  peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.36 
 
 
249 aa  44.3  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92141  predicted protein  35.16 
 
 
355 aa  44.3  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.145419  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4565  Transglycosylase domain protein  40.32 
 
 
224 aa  44.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.651995  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4701  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.01 
 
 
329 aa  44.3  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.997176  normal  0.841569 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0330  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  42.25 
 
 
792 aa  44.3  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1443  Zinc D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  33.85 
 
 
242 aa  44.3  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1842  hypothetical protein  41.54 
 
 
306 aa  43.9  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.224283  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1188  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.06 
 
 
321 aa  43.9  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3376  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.65 
 
 
283 aa  44.3  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.135987 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4581  cell wall hydrolase/autolysin  27.46 
 
 
392 aa  43.9  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170729 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0837  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.72 
 
 
395 aa  43.9  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.265707  normal  0.357261 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4844  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.54 
 
 
266 aa  43.5  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.38175  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04480  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  42.42 
 
 
422 aa  43.5  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.38395  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1812  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.32 
 
 
77 aa  43.5  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00132339  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3583  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.9 
 
 
344 aa  43.1  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4849  spore cortex-lytic enzyme  33.33 
 
 
228 aa  43.1  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0199  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.54 
 
 
266 aa  43.5  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691121  normal  0.116846 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03060  Spore cortex-lytic enzyme SleB  41.94 
 
 
239 aa  43.1  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>