133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1831 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1831  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  100 
 
 
323 aa  663    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2151  peptidoglycan binding domain-containing protein  57.79 
 
 
306 aa  346  3e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0511643  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5194  peptidoglycan binding domain-containing protein  57.99 
 
 
306 aa  344  1e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00951194  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2152  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  42.61 
 
 
356 aa  94  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000936807  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2153  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.74 
 
 
319 aa  90.9  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000738312  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5192  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.36 
 
 
322 aa  88.2  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000000016794  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5193  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  40.87 
 
 
356 aa  87.4  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000362844  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11630  metalloendopeptidase-like membrane protein  40.98 
 
 
323 aa  82.8  0.000000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  36.69 
 
 
372 aa  80.9  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0968  stage II sporulation D domain-containing protein  37.19 
 
 
462 aa  79.3  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00176967  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1832  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.92 
 
 
379 aa  73.9  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.78 
 
 
391 aa  71.6  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2464  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.93 
 
 
201 aa  68.2  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000202368  normal  0.0272444 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1970  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.12 
 
 
160 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.607803 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1166  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.88 
 
 
412 aa  67  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.462294  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3182  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  38.84 
 
 
375 aa  66.6  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00209082 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2804  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.82 
 
 
364 aa  65.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0769202  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1246  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.09 
 
 
508 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0960  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.57 
 
 
575 aa  63.9  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.538106  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0330  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  49.25 
 
 
792 aa  63.5  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3286  NLP/P60 protein  30.61 
 
 
450 aa  62.8  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4844  peptidoglycan binding domain-containing protein  49.23 
 
 
266 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.38175  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1440  SpoIID/LytB domain-containing protein  27.15 
 
 
762 aa  61.2  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0199  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.15 
 
 
266 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691121  normal  0.116846 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0528  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.33 
 
 
334 aa  59.7  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3133  NLP/P60 protein  28.81 
 
 
454 aa  59.7  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000296935  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4755  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.09 
 
 
269 aa  58.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.15503  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3994  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.89 
 
 
266 aa  57.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.552337  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2294  cell wall hydrolase/autolysin  31.9 
 
 
358 aa  57.8  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4980  peptidoglycan binding domain-containing protein  51.72 
 
 
128 aa  56.6  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2734  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.66 
 
 
300 aa  56.2  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.230692  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1886  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.35 
 
 
635 aa  56.2  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5403  cell wall hydrolase/autolysin  30 
 
 
383 aa  55.8  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0221  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.08 
 
 
447 aa  55.8  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0446157  normal  0.633026 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0056  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.48 
 
 
160 aa  55.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4855  cell wall hydrolase/autolysin  33.03 
 
 
396 aa  55.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0241  penicillin-insensitive murein endopeptidase  27.31 
 
 
336 aa  55.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.264656  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0085  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.56 
 
 
143 aa  55.1  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.51 
 
 
433 aa  53.9  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2284  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.33 
 
 
198 aa  53.5  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.586079  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4788  peptidoglycan binding domain-containing protein  50 
 
 
163 aa  53.5  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.907058  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18550  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  43.33 
 
 
225 aa  53.5  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0730  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.27 
 
 
1089 aa  53.1  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1960  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.77 
 
 
360 aa  52.8  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  43.33 
 
 
2277 aa  52.8  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  40.62 
 
 
324 aa  52.8  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0756  hypothetical protein  34.88 
 
 
204 aa  52  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.444213  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2755  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.33 
 
 
170 aa  51.6  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30050  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  34.58 
 
 
246 aa  51.2  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0031896  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1188  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.46 
 
 
321 aa  50.8  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1518  hypothetical protein  31.43 
 
 
241 aa  50.8  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1663  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  28.69 
 
 
283 aa  50.4  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0604  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.98 
 
 
326 aa  50.8  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.66709  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3185  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  27.54 
 
 
193 aa  50.8  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00515387  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  32.69 
 
 
232 aa  50.8  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9044  cell wall hydrolase/autolysin  29.08 
 
 
381 aa  51.2  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4396  peptidoglycan binding domain-containing protein  23.75 
 
 
313 aa  50.4  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000949071 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7330  cell wall hydrolase/autolysin  30.51 
 
 
409 aa  50.4  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.680147  normal  0.468389 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2188  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.14 
 
 
549 aa  50.4  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1654  peptidoglycan binding domain-containing protein  40 
 
 
974 aa  50.1  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00486103  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2826  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.64 
 
 
554 aa  50.1  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3571  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  51.02 
 
 
274 aa  50.4  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2387  gamma-D-glutamyl-{L}-meso-diaminopimelate peptidase I. metallo peptidase. MEROPS family M14C  37.36 
 
 
423 aa  49.7  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1537  general secretion pathway protein-related protein  47.46 
 
 
540 aa  49.3  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259719  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7088  cell wall hydrolase/autolysin  29.93 
 
 
379 aa  49.3  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0285  hypothetical protein  39.62 
 
 
292 aa  48.9  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1959  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.14 
 
 
487 aa  48.5  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315261  normal  0.0108797 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3497  peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.44 
 
 
182 aa  48.5  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4581  cell wall hydrolase/autolysin  37.63 
 
 
392 aa  48.9  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170729 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5099  cell wall hydrolase/autolysin  36.56 
 
 
387 aa  48.9  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000380245 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09540  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  44.83 
 
 
280 aa  48.1  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623217  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3296  penicillin-insensitive murein endopeptidase  27.61 
 
 
307 aa  48.5  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00347762 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4849  spore cortex-lytic enzyme  36.46 
 
 
228 aa  48.1  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4330  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.48 
 
 
485 aa  47.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3284  penicillin-insensitive murein endopeptidase  31.21 
 
 
309 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3607  penicillin-insensitive murein endopeptidase  31.21 
 
 
309 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4565  Transglycosylase domain protein  42.19 
 
 
224 aa  47.8  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.651995  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5145  Transglycosylase domain protein  34.72 
 
 
317 aa  47.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3619  cell wall hydrolase/autolysin  28.05 
 
 
313 aa  47  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.802629  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4701  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  28.57 
 
 
329 aa  47  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.997176  normal  0.841569 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3484  penicillin-insensitive murein endopeptidase  27.39 
 
 
309 aa  47  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.395907 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03060  Spore cortex-lytic enzyme SleB  42.37 
 
 
239 aa  47  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0042  spore cortex-lytic enzyme  44.07 
 
 
228 aa  46.6  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.415977  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4087  peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.19 
 
 
249 aa  46.6  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5086  cell wall hydrolase/autolysin  32 
 
 
383 aa  46.6  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3195  cell wall hydrolase, SleB  33.33 
 
 
234 aa  46.2  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2969  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.9 
 
 
274 aa  45.8  0.0009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1588  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  46.55 
 
 
359 aa  45.4  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0248929  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2150  cell wall hydrolase/autolysin  25.17 
 
 
378 aa  45.4  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2694  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.29 
 
 
315 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1225  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.33 
 
 
234 aa  45.8  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3347  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.8 
 
 
629 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0945  peptidoglycan-binding domain 1 protein  42.86 
 
 
260 aa  45.4  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.572838  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1197  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.36 
 
 
667 aa  45.8  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0450  penicillin-insensitive murein endopeptidase  28.4 
 
 
318 aa  45.4  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.100196  normal  0.0724042 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1872  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  46.15 
 
 
268 aa  45.8  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.322765  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26920  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  38.14 
 
 
254 aa  45.8  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.158752  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6248  NLP/P60 protein  40 
 
 
285 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0809629  normal  0.153407 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09470  putative peptidoglycan binding protein  41.94 
 
 
335 aa  45.1  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.265495  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1334  penicillin-insensitive murein endopeptidase  28.85 
 
 
310 aa  44.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>