172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1970 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1970  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  100 
 
 
160 aa  324  3e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.607803 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  41.51 
 
 
391 aa  100  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0968  stage II sporulation D domain-containing protein  42.34 
 
 
462 aa  94  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00176967  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2153  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.44 
 
 
319 aa  91.7  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000738312  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  39.55 
 
 
372 aa  83.2  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2464  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  43.71 
 
 
201 aa  82.4  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000202368  normal  0.0272444 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5192  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.39 
 
 
322 aa  80.5  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000000016794  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2151  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.94 
 
 
306 aa  78.6  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0511643  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5194  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.52 
 
 
306 aa  77.4  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00951194  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4980  peptidoglycan binding domain-containing protein  52.7 
 
 
128 aa  77  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1832  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.68 
 
 
379 aa  76.3  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2294  cell wall hydrolase/autolysin  38.24 
 
 
358 aa  74.3  0.0000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2152  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  38.33 
 
 
356 aa  72.8  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000936807  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11630  metalloendopeptidase-like membrane protein  39.34 
 
 
323 aa  71.2  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0960  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.69 
 
 
575 aa  70.9  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.538106  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4701  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.38 
 
 
329 aa  71.2  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.997176  normal  0.841569 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5193  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.13 
 
 
356 aa  70.9  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000362844  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0221  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.56 
 
 
447 aa  70.5  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0446157  normal  0.633026 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0056  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.62 
 
 
160 aa  68.6  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1831  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.12 
 
 
323 aa  67.8  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1518  hypothetical protein  43.12 
 
 
241 aa  67.8  0.00000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1960  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.94 
 
 
360 aa  67.4  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0528  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.81 
 
 
334 aa  67.4  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3994  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.16 
 
 
266 aa  67  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.552337  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4855  cell wall hydrolase/autolysin  42.2 
 
 
396 aa  66.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5099  cell wall hydrolase/autolysin  38.73 
 
 
387 aa  67  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000380245 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1440  SpoIID/LytB domain-containing protein  34.39 
 
 
762 aa  67  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7330  cell wall hydrolase/autolysin  40.91 
 
 
409 aa  66.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.680147  normal  0.468389 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39690  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  38.36 
 
 
382 aa  65.5  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4581  cell wall hydrolase/autolysin  38.03 
 
 
392 aa  65.5  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170729 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0037  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.26 
 
 
332 aa  65.5  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0730  peptidoglycan binding domain-containing protein  54.24 
 
 
1089 aa  65.1  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2734  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.11 
 
 
300 aa  64.7  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.230692  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2804  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.88 
 
 
364 aa  64.3  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0769202  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0896  Peptidase M23  41.44 
 
 
352 aa  63.9  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2284  peptidoglycan binding domain-containing protein  50.79 
 
 
198 aa  62.4  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.586079  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3182  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  34.29 
 
 
375 aa  62.8  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00209082 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2755  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.79 
 
 
170 aa  62.8  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03060  Spore cortex-lytic enzyme SleB  48.61 
 
 
239 aa  62  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0285  hypothetical protein  52.63 
 
 
292 aa  61.2  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1959  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.22 
 
 
487 aa  61.2  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315261  normal  0.0108797 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6248  NLP/P60 protein  54.72 
 
 
285 aa  61.2  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0809629  normal  0.153407 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09540  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  53.57 
 
 
280 aa  59.7  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623217  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5403  cell wall hydrolase/autolysin  34.48 
 
 
383 aa  60.1  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4396  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.09 
 
 
313 aa  59.3  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000949071 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0837  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.24 
 
 
395 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.265707  normal  0.357261 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13950  hydrolase  35.22 
 
 
406 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3347  peptidoglycan binding domain-containing protein  61.54 
 
 
629 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2150  cell wall hydrolase/autolysin  37.86 
 
 
378 aa  58.9  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5404  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.55 
 
 
398 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5493  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.55 
 
 
398 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal  0.340156 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6069  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.24 
 
 
395 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.123389 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5780  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.55 
 
 
398 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.103235  normal  0.0225993 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3286  NLP/P60 protein  34.53 
 
 
450 aa  57  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1246  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.78 
 
 
508 aa  57  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1886  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.25 
 
 
635 aa  57  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  39.36 
 
 
232 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7088  cell wall hydrolase/autolysin  39.09 
 
 
379 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4538  cell wall hydrolase/autolysin  39.09 
 
 
438 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37540  PG-binding-1 domain-containing protein  54.39 
 
 
276 aa  56.2  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.111379  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1873  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.9 
 
 
261 aa  55.5  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.499146  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0756  hypothetical protein  58.93 
 
 
204 aa  55.5  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.444213  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1663  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  51.43 
 
 
283 aa  55.5  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3152  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.71 
 
 
288 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.396034  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2826  peptidoglycan binding domain-containing protein  50.85 
 
 
554 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0085  peptidoglycan binding domain-containing protein  50.77 
 
 
143 aa  55.1  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0581  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.5 
 
 
330 aa  55.1  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000627689  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3619  cell wall hydrolase/autolysin  31.58 
 
 
313 aa  55.1  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.802629  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3133  NLP/P60 protein  33.33 
 
 
454 aa  55.1  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000296935  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3376  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.43 
 
 
283 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.135987 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0945  peptidoglycan-binding domain 1 protein  56.9 
 
 
260 aa  54.7  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.572838  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0604  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40 
 
 
326 aa  54.3  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.66709  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1654  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.27 
 
 
974 aa  54.3  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00486103  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5086  cell wall hydrolase/autolysin  35.81 
 
 
383 aa  54.3  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4087  peptidoglycan-binding domain 1 protein  45.59 
 
 
249 aa  53.9  0.0000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3497  peptidoglycan-binding domain 1 protein  45 
 
 
182 aa  53.9  0.0000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4755  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.24 
 
 
269 aa  53.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.15503  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0267  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.71 
 
 
317 aa  53.5  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252847  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.22 
 
 
327 aa  53.5  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4234  cell wall hydrolase/autolysin  33.77 
 
 
395 aa  53.9  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0032  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.88 
 
 
323 aa  53.1  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0042  spore cortex-lytic enzyme  42.5 
 
 
228 aa  52.8  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.415977  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2188  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.59 
 
 
549 aa  52.8  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30050  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  35.87 
 
 
246 aa  52  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0031896  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4768  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.79 
 
 
245 aa  51.6  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  34.15 
 
 
2277 aa  52  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1726  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  51.52 
 
 
224 aa  52  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0528889  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05880  cell wall hydrolase SleB  45.33 
 
 
229 aa  51.6  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.84059e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1812  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.67 
 
 
77 aa  51.6  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00132339  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5145  Transglycosylase domain protein  26.03 
 
 
317 aa  51.6  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1166  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.5 
 
 
412 aa  51.6  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.462294  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2387  gamma-D-glutamyl-{L}-meso-diaminopimelate peptidase I. metallo peptidase. MEROPS family M14C  46.67 
 
 
423 aa  51.2  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4849  spore cortex-lytic enzyme  49.12 
 
 
228 aa  51.2  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4565  Transglycosylase domain protein  46.77 
 
 
224 aa  50.8  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.651995  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0330  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  44 
 
 
792 aa  50.4  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2988  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.92 
 
 
249 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.382188 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2457  peptidoglycan binding domain-containing protein  50.85 
 
 
294 aa  50.1  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.156102  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0199  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.55 
 
 
266 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691121  normal  0.116846 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1443  Zinc D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  37.36 
 
 
242 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3571  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  44.62 
 
 
274 aa  50.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>