119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3376 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3376  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 
283 aa  567  1e-161  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.135987 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3152  peptidoglycan binding domain-containing protein  87.23 
 
 
288 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.396034  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4180  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  71.54 
 
 
232 aa  336  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4246  peptidoglycan binding domain-containing protein  71.54 
 
 
232 aa  336  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.537178  normal  0.324419 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4402  peptidoglycan binding domain-containing protein  71.54 
 
 
232 aa  336  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.221935  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13627  hypothetical protein  55.98 
 
 
275 aa  199  3e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.34134e-24  normal  0.0487291 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3571  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  41.97 
 
 
274 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2187  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase  36 
 
 
235 aa  100  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.421813 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3521  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  36.02 
 
 
181 aa  84  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.410023  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2410  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.77 
 
 
247 aa  77.4  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2018  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  31.8 
 
 
251 aa  67.4  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169128  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2350  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  30.56 
 
 
304 aa  62.4  0.000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.568206 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2007  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  32.2 
 
 
251 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0212673 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2185  negative regulator of AmpC, AmpD  29.12 
 
 
289 aa  60.1  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.415587  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3403  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.52 
 
 
288 aa  60.1  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0566227  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4565  Transglycosylase domain protein  47.3 
 
 
224 aa  60.5  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.651995  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1985  negative regulator of AmpC, AmpD  28.89 
 
 
288 aa  59.3  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.116261  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03060  Spore cortex-lytic enzyme SleB  52.78 
 
 
239 aa  58.5  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05880  cell wall hydrolase SleB  50.75 
 
 
229 aa  58.5  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.84059e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5126  peptidoglycan-binding domain 1 protein  48.1 
 
 
200 aa  57.8  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.283972  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09540  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  53.12 
 
 
280 aa  57.8  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623217  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1896  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.82 
 
 
265 aa  55.8  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.126557  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0285  hypothetical protein  46.97 
 
 
292 aa  55.5  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1270  negative regulator of AmpC, AmpD  29.49 
 
 
289 aa  55.5  0.0000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1042  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.54 
 
 
283 aa  54.7  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0960  peptidoglycan binding domain-containing protein  51.47 
 
 
575 aa  54.7  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.538106  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1732  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.8 
 
 
268 aa  54.3  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0945  peptidoglycan-binding domain 1 protein  50.75 
 
 
260 aa  54.7  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.572838  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0221  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  49.28 
 
 
447 aa  54.7  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0446157  normal  0.633026 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3546  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  29.67 
 
 
255 aa  54.3  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.457198 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4849  spore cortex-lytic enzyme  44 
 
 
228 aa  54.7  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1970  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  46.43 
 
 
160 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.607803 
 
 
-
 
NC_004310  BR1444  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.36 
 
 
268 aa  53.9  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.16069  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1400  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.36 
 
 
268 aa  53.9  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.896798  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1897  spore cortex-lytic enzyme SleB  44.59 
 
 
247 aa  53.9  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0572878  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1560  spore cortex-lytic enzyme  47.06 
 
 
225 aa  53.5  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2175  spore cortex-lytic enzyme  45.57 
 
 
270 aa  53.9  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2464  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  50 
 
 
201 aa  53.5  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000202368  normal  0.0272444 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3347  peptidoglycan binding domain-containing protein  56.14 
 
 
629 aa  53.1  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0267  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.95 
 
 
317 aa  53.1  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252847  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  52.24 
 
 
433 aa  53.1  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1953  cell wall hydrolase, SleB  47.83 
 
 
234 aa  52.8  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4057  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  25.37 
 
 
288 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.100978  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2294  cell wall hydrolase/autolysin  53.23 
 
 
358 aa  50.8  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1949  cell wall hydrolase, SleB  46.38 
 
 
224 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000201814  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5086  cell wall hydrolase/autolysin  52.31 
 
 
383 aa  51.2  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1812  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.83 
 
 
77 aa  51.2  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00132339  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1225  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  52.24 
 
 
234 aa  50.8  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2906  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.63 
 
 
252 aa  50.8  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.923766  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0042  spore cortex-lytic enzyme  56.06 
 
 
228 aa  51.2  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.415977  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0096  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.09 
 
 
559 aa  50.1  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4980  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.18 
 
 
128 aa  49.3  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37540  PG-binding-1 domain-containing protein  49.18 
 
 
276 aa  49.3  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.111379  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0968  stage II sporulation D domain-containing protein  39.58 
 
 
462 aa  49.3  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00176967  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1443  Zinc D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  44.62 
 
 
242 aa  48.9  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0291  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  42.55 
 
 
282 aa  48.9  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.93701 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  50 
 
 
372 aa  48.5  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2104  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.2 
 
 
254 aa  48.9  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.312946 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1726  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  45.05 
 
 
224 aa  48.5  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0528889  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2781  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  41.89 
 
 
259 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.120397  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2562  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  41.89 
 
 
253 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00268297  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2518  spore cortex-lytic enzyme  41.89 
 
 
253 aa  47.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2748  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  41.89 
 
 
253 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0877  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase domain-containing protein  29.23 
 
 
383 aa  48.1  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6183  1 N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.01 
 
 
283 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.301475  normal  0.754247 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2151  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.88 
 
 
306 aa  48.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0511643  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2553  spore cortex-lytic enzyme SleB  41.89 
 
 
259 aa  47.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0187217  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2802  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  41.89 
 
 
259 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.45164  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2760  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  41.89 
 
 
259 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542492  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2532  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  41.89 
 
 
253 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000946366 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  41.89 
 
 
232 aa  47.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4910  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  28.39 
 
 
249 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.456045  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3695  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  42.65 
 
 
157 aa  47.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2483  spore cortex-lytic enzyme  41.89 
 
 
253 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0343693  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3051  negative regulator of AmpC, AmpD  32.89 
 
 
234 aa  47.4  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.8874  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4788  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.45 
 
 
163 aa  47.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.907058  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4374  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  28.75 
 
 
249 aa  47  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0600815  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2756  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  41.89 
 
 
253 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000173118 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1166  peptidoglycan binding domain-containing protein  50 
 
 
412 aa  47  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.462294  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1188  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.88 
 
 
321 aa  46.6  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2867  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  26.92 
 
 
253 aa  47  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.973804 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30050  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  36.89 
 
 
246 aa  46.6  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0031896  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4396  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.86 
 
 
313 aa  46.6  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000949071 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0039  spore cortex-lytic enzyme  42.68 
 
 
242 aa  46.2  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1663  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  47.06 
 
 
283 aa  46.2  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4755  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.06 
 
 
269 aa  46.2  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.15503  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4538  cell wall hydrolase/autolysin  42.5 
 
 
438 aa  45.8  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5194  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.45 
 
 
306 aa  46.2  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00951194  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39690  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  50.79 
 
 
382 aa  45.8  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2150  cell wall hydrolase/autolysin  51.56 
 
 
378 aa  45.8  0.0008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.26 
 
 
422 aa  45.8  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2607  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  27.78 
 
 
253 aa  45.8  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.559154  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0756  hypothetical protein  44.62 
 
 
204 aa  45.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.444213  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3195  cell wall hydrolase, SleB  44.12 
 
 
234 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0528  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.53 
 
 
334 aa  45.4  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2755  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.48 
 
 
170 aa  45.4  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  48.48 
 
 
391 aa  45.4  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18550  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.39 
 
 
225 aa  45.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  39.68 
 
 
2277 aa  45.4  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3185  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  45.31 
 
 
193 aa  45.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00515387  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>