117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_37540 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_37540  PG-binding-1 domain-containing protein  100 
 
 		 276 aa  561  1.0000000000000001e-159  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.111379  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0199  peptidoglycan binding domain-containing protein  53.16 
 
 		 266 aa  255  5e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691121  normal  0.116846 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4844  peptidoglycan binding domain-containing protein  54.07 
 
 		 266 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.38175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2908  peptidoglycan binding domain-containing protein  48.31 
 
 		 273 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0270551  normal  0.498444 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1343  hypothetical protein  55.51 
 
 		 250 aa  238  5e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1931  putative phage-related protein (hydrolase)  53.14 
 
 		 268 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537579  normal  0.910807 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3197  putative phage-related protein (hydrolase)  42.69 
 
 		 267 aa  184  9e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000132764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2969  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.65 
 
 		 274 aa  177  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1872  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  40.6 
 
 		 268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.322765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2250  Lytic transglycosylase catalytic  36.33 
 
 		 294 aa  145  9e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2350  hypothetical protein  36.68 
 
 		 280 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.889087  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1197  DNA-directed RNA polymerase beta' chain  32.66 
 
 		 946 aa  107  2e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0957323  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0578  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  29.62 
 
 		 283 aa  104  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0181563  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3855  hypothetical protein  36.27 
 
 		 277 aa  100  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.322075 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0588  hypothetical protein  34.18 
 
 		 188 aa  99.4  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.255449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1239  hypothetical protein  37.19 
 
 		 258 aa  96.3  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4256  hypothetical protein  36.73 
 
 		 203 aa  95.1  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6577  hypothetical protein  32.51 
 
 		 404 aa  89  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1931  hypothetical protein  30.92 
 
 		 457 aa  89  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04252  LysM domain protein  28.99 
 
 		 424 aa  86.7  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2734  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.42 
 
 		 300 aa  85.5  8e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.230692  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0080  hypothetical protein  32.83 
 
 		 203 aa  81.3  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.658451  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4510  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.83 
 
 		 398 aa  80.9  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.678924 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6107  hypothetical protein  28.2 
 
 		 450 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.724115 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0267  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.31 
 
 		 317 aa  73.2  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09540  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  51.52 
 
 		 280 aa  61.6  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623217  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5192  peptidoglycan binding domain-containing protein  51.67 
 
 		 322 aa  58.9  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000000016794  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  52.46 
 
 		 372 aa  58.9  0.00000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0730  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.19 
 
 		 1089 aa  58.5  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0096  peptidoglycan binding domain-containing protein  53.03 
 
 		 559 aa  57  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2153  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.25 
 
 		 319 aa  57  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000738312  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1970  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  54.39 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.607803 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4199  SH3, type 3  26.7 
 
 		 459 aa  55.1  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.690204  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39690  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  55.56 
 
 		 382 aa  55.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0285  hypothetical protein  45.9 
 
 		 292 aa  53.9  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2988  peptidoglycan binding domain-containing protein  50 
 
 		 249 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.382188 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0945  peptidoglycan-binding domain 1 protein  53.45 
 
 		 260 aa  52.8  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.572838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7088  cell wall hydrolase/autolysin  49.32 
 
 		 379 aa  52.8  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1960  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.88 
 
 		 360 aa  52  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6248  NLP/P60 protein  43.28 
 
 		 285 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0809629  normal  0.153407 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2464  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  47.37 
 
 		 201 aa  51.6  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000202368  normal  0.0272444 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4980  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.54 
 
 		 128 aa  51.2  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2294  cell wall hydrolase/autolysin  47.62 
 
 		 358 aa  51.6  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0085  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.77 
 
 		 143 aa  50.8  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3347  peptidoglycan binding domain-containing protein  50 
 
 		 629 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5194  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.03 
 
 		 306 aa  50.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00951194  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4565  Transglycosylase domain protein  50 
 
 		 224 aa  50.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.651995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11630  metalloendopeptidase-like membrane protein  47.62 
 
 		 323 aa  50.4  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1726  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  45.59 
 
 		 224 aa  50.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0528889  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03060  Spore cortex-lytic enzyme SleB  57.14 
 
 		 239 aa  50.1  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3890  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  46.88 
 
 		 164 aa  49.7  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2151  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.08 
 
 		 306 aa  49.7  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0511643  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3376  peptidoglycan binding domain-containing protein  49.18 
 
 		 283 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.135987 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6069  peptidoglycan binding domain-containing protein  51.85 
 
 		 395 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123389 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2387  gamma-D-glutamyl-{L}-meso-diaminopimelate peptidase I. metallo peptidase. MEROPS family M14C  36.54 
 
 		 423 aa  49.3  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13950  hydrolase  51.85 
 
 		 406 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 232 aa  49.3  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4755  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.55 
 
 		 269 aa  48.9  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.15503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4788  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 163 aa  48.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.907058  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1225  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  48.39 
 
 		 234 aa  48.5  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1953  cell wall hydrolase, SleB  47.27 
 
 		 234 aa  48.5  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0837  peptidoglycan binding domain-containing protein  51.85 
 
 		 395 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.265707  normal  0.357261 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3152  peptidoglycan binding domain-containing protein  50.82 
 
 		 288 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.396034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1886  peptidoglycan binding domain-containing protein  49.06 
 
 		 635 aa  48.1  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  42.86 
 
 		 324 aa  47.8  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03950  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  38.1 
 
 		 303 aa  47.8  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.759104 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5404  peptidoglycan binding domain-containing protein  50 
 
 		 398 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5493  peptidoglycan binding domain-containing protein  50 
 
 		 398 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal  0.340156 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5780  peptidoglycan binding domain-containing protein  50 
 
 		 398 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.103235  normal  0.0225993 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5126  peptidoglycan-binding domain 1 protein  45.16 
 
 		 200 aa  47.4  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.283972  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4383  peptidoglycan binding domain-containing protein  60 
 
 		 233 aa  47  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18110  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  49.21 
 
 		 279 aa  47.4  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.459182  normal  0.956828 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2508  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.75 
 
 		 256 aa  47  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0275667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1579  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  60 
 
 		 232 aa  47  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.988473 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1812  peptidoglycan binding domain-containing protein  52 
 
 		 77 aa  46.6  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00132339  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2755  peptidoglycan binding domain-containing protein  53.85 
 
 		 170 aa  46.2  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0303  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  46.77 
 
 		 232 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.220204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7330  cell wall hydrolase/autolysin  33.33 
 
 		 409 aa  45.8  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.680147  normal  0.468389 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2115  SCP-like extracellular  47.83 
 
 		 349 aa  45.8  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.147298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4311  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.75 
 
 		 305 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0968  stage II sporulation D domain-containing protein  50 
 
 		 462 aa  45.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00176967  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0153  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  44.83 
 
 		 665 aa  45.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  43.94 
 
 		 391 aa  45.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5403  cell wall hydrolase/autolysin  43.4 
 
 		 383 aa  45.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4396  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.62 
 
 		 313 aa  44.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000949071 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4538  cell wall hydrolase/autolysin  34.69 
 
 		 438 aa  44.3  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4855  cell wall hydrolase/autolysin  50 
 
 		 396 aa  44.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 327 aa  44.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2457  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.72 
 
 		 294 aa  44.3  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.156102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05880  cell wall hydrolase SleB  38.75 
 
 		 229 aa  44.3  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.84059e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18550  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.8 
 
 		 225 aa  44.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  41.79 
 
 		 2277 aa  44.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0042  spore cortex-lytic enzyme  41.27 
 
 		 228 aa  44.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.415977  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2284  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.46 
 
 		 198 aa  43.9  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.586079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0221  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.33 
 
 		 447 aa  43.5  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0446157  normal  0.633026 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5086  cell wall hydrolase/autolysin  43.55 
 
 		 383 aa  43.9  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01179  putative periplasmic protein  56.25 
 
 		 410 aa  43.9  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.383601  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0604  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.15 
 
 		 326 aa  43.9  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.66709  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1560  spore cortex-lytic enzyme  49.06 
 
 		 225 aa  43.9  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26920  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  43.55 
 
 		 254 aa  43.5  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.158752  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>