30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3197 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3197  putative phage-related protein (hydrolase)  100 
 
 		 267 aa  546  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000132764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2908  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.63 
 
 		 273 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0270551  normal  0.498444 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0199  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.17 
 
 		 266 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691121  normal  0.116846 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4844  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.02 
 
 		 266 aa  188  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.38175  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1931  putative phage-related protein (hydrolase)  45.73 
 
 		 268 aa  186  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537579  normal  0.910807 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37540  PG-binding-1 domain-containing protein  42.69 
 
 		 276 aa  184  9e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.111379  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1343  hypothetical protein  41.67 
 
 		 250 aa  171  9e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1872  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.14 
 
 		 268 aa  136  4e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.322765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2969  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.42 
 
 		 274 aa  132  6.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2350  hypothetical protein  34.21 
 
 		 280 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.889087  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1197  DNA-directed RNA polymerase beta' chain  35.8 
 
 		 946 aa  115  5e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0957323  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2250  Lytic transglycosylase catalytic  31.78 
 
 		 294 aa  103  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0578  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.31 
 
 		 283 aa  100  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0181563  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0588  hypothetical protein  32.28 
 
 		 188 aa  93.2  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.255449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3855  hypothetical protein  33.51 
 
 		 277 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.322075 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4510  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.76 
 
 		 398 aa  89.7  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.678924 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6107  hypothetical protein  30.27 
 
 		 450 aa  89.7  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.724115 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4256  hypothetical protein  34.41 
 
 		 203 aa  87.8  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1931  hypothetical protein  28.69 
 
 		 457 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0080  hypothetical protein  34.09 
 
 		 203 aa  82  0.000000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.658451  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2734  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.27 
 
 		 300 aa  80.1  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.230692  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1239  hypothetical protein  31.18 
 
 		 258 aa  77.8  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6577  hypothetical protein  30.05 
 
 		 404 aa  75.1  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04252  LysM domain protein  24.12 
 
 		 424 aa  72  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0267  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.61 
 
 		 317 aa  62.4  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0285  hypothetical protein  43.64 
 
 		 292 aa  47.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3347  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.03 
 
 		 629 aa  44.3  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2188  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  43.1 
 
 		 549 aa  44.3  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4199  SH3, type 3  26.83 
 
 		 459 aa  43.1  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.690204  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05880  cell wall hydrolase SleB  35.14 
 
 		 229 aa  42.7  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.84059e-17  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>