26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1239 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1239  hypothetical protein  100 
 
 
258 aa  518  1e-146  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2734  peptidoglycan binding domain-containing protein  58.82 
 
 
300 aa  265  4e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.230692  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4256  hypothetical protein  55.96 
 
 
203 aa  218  7e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0080  hypothetical protein  55.21 
 
 
203 aa  213  2.9999999999999995e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.658451  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4510  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.76 
 
 
398 aa  124  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.678924 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1872  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.89 
 
 
268 aa  106  3e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.322765  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3855  hypothetical protein  35.42 
 
 
277 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.322075 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6577  hypothetical protein  34.2 
 
 
404 aa  97.8  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37540  PG-binding-1 domain-containing protein  37.19 
 
 
276 aa  95.5  8e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.111379  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2250  Lytic transglycosylase catalytic  33.16 
 
 
294 aa  91.3  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2350  hypothetical protein  31.02 
 
 
280 aa  88.2  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.889087  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1343  hypothetical protein  36.27 
 
 
250 aa  87.4  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0588  hypothetical protein  29.73 
 
 
188 aa  85.1  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.255449  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1931  putative phage-related protein (hydrolase)  34.74 
 
 
268 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537579  normal  0.910807 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2969  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.12 
 
 
274 aa  80.9  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0578  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.17 
 
 
283 aa  78.2  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0181563  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3197  putative phage-related protein (hydrolase)  31.18 
 
 
267 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000132764  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2908  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.28 
 
 
273 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0270551  normal  0.498444 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0199  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.16 
 
 
266 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691121  normal  0.116846 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4844  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.64 
 
 
266 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.38175  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1197  DNA-directed RNA polymerase beta' chain  29.1 
 
 
946 aa  64.3  0.000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0957323  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6107  hypothetical protein  28.29 
 
 
450 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.724115 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1931  hypothetical protein  25.65 
 
 
457 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4199  SH3, type 3  24.02 
 
 
459 aa  55.8  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.690204  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04252  LysM domain protein  23.77 
 
 
424 aa  52.8  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0267  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.03 
 
 
317 aa  45.8  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252847  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>