136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_4199 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_4199  SH3, type 3  100 
 
 		 459 aa  959    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.690204  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2308  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.02 
 
 		 1776 aa  95.5  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1493  NLP/P60 protein  30.43 
 
 		 418 aa  92  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000786314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1787  NLP/P60 family protein  27.46 
 
 		 420 aa  89.7  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000289825  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1769  NLP/P60 family protein  27.46 
 
 		 420 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000165376  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1988  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  27.46 
 
 		 420 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.1332199999999997e-59 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2037  NLP/P60 family protein  27.83 
 
 		 426 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000532667  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2059  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  28.3 
 
 		 426 aa  89  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000850665  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1938  peptidase, M23/M37 family  27.31 
 
 		 564 aa  87.8  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2868799999999999e-45 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1959  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  28.3 
 
 		 413 aa  87.8  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3369  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  28.3 
 
 		 432 aa  87.4  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000232864  unclonable  2.00404e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1812  NLP/P60 family protein  27.05 
 
 		 420 aa  87  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000382267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1952  NLP/P60 family protein  27.05 
 
 		 420 aa  87  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000344583  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1742  peptidase M23/M37 family protein  27.31 
 
 		 564 aa  87  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000319429  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1765  M24/M37 family peptidase  27.19 
 
 		 564 aa  86.7  8e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000130231  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1903  M23/37 family peptidase  27.19 
 
 		 564 aa  86.7  8e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000402629  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1909  peptidase, M23/M37 family  25.55 
 
 		 564 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00585964  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1821  NLP/P60 protein  26.86 
 
 		 430 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000102093  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0587  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.67 
 
 		 553 aa  83.6  0.000000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.369962  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5406  putative cell wall hydrolase  23.72 
 
 		 582 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000566692  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5353  enterotoxin  24.78 
 
 		 582 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000381193  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4915  cell wall hydrolase; N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  23.62 
 
 		 580 aa  79  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  9.30619e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4930  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase; enterotoxin  23.62 
 
 		 579 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000272032  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5324  enterotoxin  23.62 
 
 		 598 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.216360000000001e-60 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5603  putative cell wall hydrolase  23.79 
 
 		 582 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000253963  unclonable  5.14343e-25 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1439  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  22.26 
 
 		 1049 aa  77  0.0000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00896108  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5357  putative cell wall hydrolase  24.89 
 
 		 577 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000860779  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0272  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.84 
 
 		 1284 aa  75.1  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3345  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.79 
 
 		 448 aa  70.5  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1245  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  22.41 
 
 		 969 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0232944  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5027  NLP/P60 protein  23.97 
 
 		 578 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000376094  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  26.21 
 
 		 424 aa  68.6  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1353  NLP/P60 family protein, enterotoxin  22.52 
 
 		 549 aa  66.2  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.185421  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0080  hypothetical protein  28.81 
 
 		 203 aa  65.5  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.658451  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2393  3D domain-containing protein  30.86 
 
 		 297 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3063  peptidase M23B  27.34 
 
 		 377 aa  65.1  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000502081  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3773  3D domain-containing protein  32.17 
 
 		 284 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3768  NLP/P60 protein  25 
 
 		 575 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000116427  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5033  3D domain-containing protein  33.04 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5360  hypothetical protein  31.3 
 
 		 338 aa  63.5  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2759  3D domain-containing protein  32.17 
 
 		 575 aa  63.5  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00579221  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2674  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  20.31 
 
 		 860 aa  63.5  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000467202  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1562  NlpC/P60 family protein  22.17 
 
 		 553 aa  63.2  0.000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000246871  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  27.27 
 
 		 370 aa  62.8  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4256  hypothetical protein  29.05 
 
 		 203 aa  62.8  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3815  hypothetical protein  29.17 
 
 		 316 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00183753  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5412  hypothetical protein  31.3 
 
 		 290 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5084  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, C-terminus  28.47 
 
 		 341 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.143081  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5090  hypothetical protein  31.3 
 
 		 290 aa  62.4  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4920  enterotoxin/cell wall-binding protein  31.3 
 
 		 290 aa  62.4  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4935  enterotoxin/cell wall-binding protein  31.3 
 
 		 294 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5330  hypothetical protein  31.3 
 
 		 290 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3987700000000004e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5481  hypothetical protein  31.3 
 
 		 290 aa  62.4  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5364  hypothetical protein  32.17 
 
 		 292 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1487  hypothetical protein  26.2 
 
 		 310 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000144613  hitchhiker  0.00534322 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1931  putative phage-related protein (hydrolase)  29.07 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537579  normal  0.910807 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5592  hypothetical protein  31.3 
 
 		 292 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000165295 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2250  Lytic transglycosylase catalytic  30.65 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3005  hypothetical protein  30.36 
 
 		 570 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0520915  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3743  hypothetical protein  28.68 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00197762  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2684  hypothetical protein  26.52 
 
 		 524 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0188967  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0640  peptidase M23B  28.57 
 
 		 386 aa  60.8  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000535366  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3009  enterotoxin  30.36 
 
 		 548 aa  60.5  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2756  hypothetical protein  26.35 
 
 		 440 aa  60.1  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00725843  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2967  hypothetical protein  26.35 
 
 		 440 aa  60.1  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000478189  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0203  enterotoxin, putative  22.66 
 
 		 603 aa  60.1  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0263  peptidase, M23/M37 family  22.66 
 
 		 603 aa  60.1  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0304388 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2705  hypothetical protein  30.36 
 
 		 524 aa  60.1  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2734  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.14 
 
 		 300 aa  59.7  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.230692  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2964  enterotoxin  30.36 
 
 		 488 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000376462 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3187  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.81 
 
 		 474 aa  59.7  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0462523  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2968  enterotoxin  30.36 
 
 		 529 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3766  hypothetical protein  27.91 
 
 		 310 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000229315  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3562  hypothetical protein  27.91 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0820775  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3725  hypothetical protein  27.91 
 
 		 310 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9172500000000004e-32 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3461  enterotoxin/cell-wall binding protein  27.91 
 
 		 310 aa  58.2  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000115171  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3475  enterotoxin/cell wall-binding protein  27.91 
 
 		 311 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0617059  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3845  hypothetical protein  27.91 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00016497  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2273  enterotoxin  30.36 
 
 		 500 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0333544 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0707  3D domain-containing protein  31.9 
 
 		 478 aa  58.2  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0706  enterotoxin/cell wall-binding protein  31.9 
 
 		 414 aa  57.8  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0692  enterotoxin/cell wall-binding protein  31.9 
 
 		 410 aa  57.8  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1872  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  28.33 
 
 		 268 aa  57.4  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.322765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0199  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.24 
 
 		 266 aa  57  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691121  normal  0.116846 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0849  enterotoxin  30.6 
 
 		 422 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4487  enterotoxin  30.33 
 
 		 469 aa  57  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113564 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1343  hypothetical protein  25.55 
 
 		 250 aa  56.2  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2016  SH3 type 3 domain-containing protein  24.18 
 
 		 773 aa  56.2  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000554023  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6577  hypothetical protein  25.68 
 
 		 404 aa  55.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4552  peptidase, M23/M37 family  29.79 
 
 		 384 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000312233  normal  0.0469454 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0779  peptidase, M23/M37 family  29.79 
 
 		 384 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0000701566  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1239  hypothetical protein  24.02 
 
 		 258 aa  55.1  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37540  PG-binding-1 domain-containing protein  26.7 
 
 		 276 aa  55.1  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.111379  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0610  peptidase M23B  23.08 
 
 		 383 aa  55.1  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000136568  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3481  3D domain-containing protein  29.57 
 
 		 321 aa  55.1  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00402969  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0801  peptidase, M23/M37 family  26.09 
 
 		 386 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70657e-48 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0959  enterotoxin  31.03 
 
 		 426 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0887  hypothetical protein  31.03 
 
 		 420 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0588  hypothetical protein  26.82 
 
 		 188 aa  53.9  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.255449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0891  enterotoxin  31.03 
 
 		 410 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46371e-34 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>