27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1343 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II1343  hypothetical protein  100 
 
 
250 aa  502  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0199  peptidoglycan binding domain-containing protein  62.66 
 
 
266 aa  291  8e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691121  normal  0.116846 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4844  peptidoglycan binding domain-containing protein  62.66 
 
 
266 aa  278  5e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.38175  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37540  PG-binding-1 domain-containing protein  56.33 
 
 
276 aa  243  1.9999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.111379  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1931  putative phage-related protein (hydrolase)  59.23 
 
 
268 aa  241  1e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537579  normal  0.910807 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2908  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.92 
 
 
273 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0270551  normal  0.498444 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2969  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.77 
 
 
274 aa  184  1.0000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3197  putative phage-related protein (hydrolase)  41.67 
 
 
267 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000132764  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1872  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  43.43 
 
 
268 aa  173  1.9999999999999998e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.322765  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2350  hypothetical protein  39.47 
 
 
280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.889087  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2250  Lytic transglycosylase catalytic  39.91 
 
 
294 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0588  hypothetical protein  36.41 
 
 
188 aa  111  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.255449  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1197  DNA-directed RNA polymerase beta' chain  34.29 
 
 
946 aa  108  7.000000000000001e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0957323  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04252  LysM domain protein  30.7 
 
 
424 aa  106  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2734  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.27 
 
 
300 aa  105  7e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.230692  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3855  hypothetical protein  40.41 
 
 
277 aa  105  7e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.322075 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6577  hypothetical protein  37.7 
 
 
404 aa  97.1  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1931  hypothetical protein  31.42 
 
 
457 aa  95.9  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4256  hypothetical protein  35.57 
 
 
203 aa  93.2  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0578  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.28 
 
 
283 aa  92  8e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0181563  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1239  hypothetical protein  36.27 
 
 
258 aa  89.4  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6107  hypothetical protein  31.56 
 
 
450 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.724115 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4510  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.32 
 
 
398 aa  82.8  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.678924 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0080  hypothetical protein  30.81 
 
 
203 aa  77.8  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.658451  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0267  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.05 
 
 
317 aa  70.9  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252847  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4199  SH3, type 3  25.99 
 
 
459 aa  55.8  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.690204  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7330  cell wall hydrolase/autolysin  39.13 
 
 
409 aa  42  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.680147  normal  0.468389 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>