198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4980 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4980  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 
128 aa  260  6e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1970  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  52.7 
 
 
160 aa  77  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.607803 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  57.81 
 
 
391 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2734  peptidoglycan binding domain-containing protein  59.38 
 
 
300 aa  73.6  0.0000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.230692  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0968  stage II sporulation D domain-containing protein  53.73 
 
 
462 aa  69.7  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00176967  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2284  peptidoglycan binding domain-containing protein  57.14 
 
 
198 aa  68.6  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.586079  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2153  peptidoglycan binding domain-containing protein  53.85 
 
 
319 aa  67.8  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000738312  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  51.56 
 
 
372 aa  67.4  0.00000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4844  peptidoglycan binding domain-containing protein  54.1 
 
 
266 aa  67  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.38175  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0199  peptidoglycan binding domain-containing protein  52.46 
 
 
266 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691121  normal  0.116846 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5194  peptidoglycan binding domain-containing protein  59.68 
 
 
306 aa  65.9  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00951194  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3347  peptidoglycan binding domain-containing protein  50 
 
 
629 aa  64.7  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2151  peptidoglycan binding domain-containing protein  54.84 
 
 
306 aa  63.9  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0511643  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0945  peptidoglycan-binding domain 1 protein  55.56 
 
 
260 aa  62.8  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.572838  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3497  peptidoglycan-binding domain 1 protein  51.61 
 
 
182 aa  62.4  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2152  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  46.88 
 
 
356 aa  62  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000936807  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1663  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  46.84 
 
 
283 aa  61.6  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2387  gamma-D-glutamyl-{L}-meso-diaminopimelate peptidase I. metallo peptidase. MEROPS family M14C  50.77 
 
 
423 aa  60.5  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0221  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  47.14 
 
 
447 aa  60.5  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0446157  normal  0.633026 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  46.67 
 
 
232 aa  60.5  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0730  peptidoglycan binding domain-containing protein  51.61 
 
 
1089 aa  60.1  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0330  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  50 
 
 
792 aa  59.3  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1188  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.22 
 
 
321 aa  58.9  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0267  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.37 
 
 
317 aa  59.3  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252847  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2464  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  50.77 
 
 
201 aa  59.3  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000202368  normal  0.0272444 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09540  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  50.82 
 
 
280 aa  58.9  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623217  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0039  spore cortex-lytic enzyme  49.3 
 
 
242 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0056  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.89 
 
 
160 aa  58.2  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0756  hypothetical protein  51.52 
 
 
204 aa  57.8  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.444213  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  48.48 
 
 
422 aa  57.4  0.00000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3994  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.15 
 
 
266 aa  57.4  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.552337  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6248  NLP/P60 protein  47.54 
 
 
285 aa  57.4  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0809629  normal  0.153407 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4701  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  44.44 
 
 
329 aa  57  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.997176  normal  0.841569 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  47.62 
 
 
433 aa  57  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1832  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  47.69 
 
 
379 aa  57  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5192  peptidoglycan binding domain-containing protein  52.54 
 
 
322 aa  57  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000000016794  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1831  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  51.72 
 
 
323 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4396  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.97 
 
 
313 aa  57  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000949071 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1812  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.12 
 
 
77 aa  55.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00132339  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0285  hypothetical protein  44.64 
 
 
292 aa  55.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03060  Spore cortex-lytic enzyme SleB  43.37 
 
 
239 aa  55.5  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0085  peptidoglycan binding domain-containing protein  50 
 
 
143 aa  56.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4849  spore cortex-lytic enzyme  47.62 
 
 
228 aa  56.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1654  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.75 
 
 
974 aa  56.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00486103  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2826  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.42 
 
 
554 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4087  peptidoglycan-binding domain 1 protein  45.68 
 
 
249 aa  55.8  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0992  glycoside hydrolase family 18  40.7 
 
 
426 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00884991  hitchhiker  0.00000357477 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0042  spore cortex-lytic enzyme  40.24 
 
 
228 aa  55.1  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.415977  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2804  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  50.79 
 
 
364 aa  55.5  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0769202  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5193  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  46.67 
 
 
356 aa  54.7  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000362844  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1246  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.86 
 
 
508 aa  54.3  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2694  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.77 
 
 
315 aa  54.7  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0528  peptidoglycan binding domain-containing protein  60 
 
 
334 aa  54.3  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  38.27 
 
 
324 aa  53.9  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26920  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  43.9 
 
 
254 aa  53.9  0.0000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.158752  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3571  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  47.83 
 
 
274 aa  53.9  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1225  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  47.89 
 
 
234 aa  53.5  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05880  cell wall hydrolase SleB  46.15 
 
 
229 aa  52.8  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.84059e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3152  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.53 
 
 
288 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.396034  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0960  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.62 
 
 
575 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.538106  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6616  transcriptional regulator, XRE family  52.63 
 
 
239 aa  52  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2457  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.88 
 
 
294 aa  52.8  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.156102  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  39.13 
 
 
2277 aa  52.4  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30050  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  30.63 
 
 
246 aa  52.8  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0031896  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1872  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  52.83 
 
 
268 aa  52.4  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.322765  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3619  cell wall hydrolase/autolysin  65.71 
 
 
313 aa  51.6  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.802629  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1197  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.64 
 
 
667 aa  51.6  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1842  hypothetical protein  37.08 
 
 
306 aa  51.6  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.224283  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1726  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  50 
 
 
224 aa  51.6  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0528889  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4768  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  48.44 
 
 
245 aa  51.6  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37540  PG-binding-1 domain-containing protein  47.54 
 
 
276 aa  51.2  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.111379  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1886  peptidoglycan binding domain-containing protein  50 
 
 
635 aa  51.2  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4330  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.15 
 
 
485 aa  50.8  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03950  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  49.09 
 
 
303 aa  50.8  0.000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.759104 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2188  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  43.48 
 
 
549 aa  50.4  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  40 
 
 
327 aa  50.8  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1348  peptidoglycan-binding domain 1 protein  41.43 
 
 
270 aa  50.4  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00397978 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0581  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  47.46 
 
 
330 aa  50.4  0.000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000627689  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4311  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.75 
 
 
305 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5145  Transglycosylase domain protein  39.66 
 
 
317 aa  49.7  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18110  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  34.83 
 
 
279 aa  50.1  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.459182  normal  0.956828 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11630  metalloendopeptidase-like membrane protein  47.54 
 
 
323 aa  50.1  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1960  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.94 
 
 
360 aa  50.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1440  SpoIID/LytB domain-containing protein  44.16 
 
 
762 aa  50.1  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2294  cell wall hydrolase/autolysin  43.75 
 
 
358 aa  48.9  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5126  peptidoglycan-binding domain 1 protein  48.39 
 
 
200 aa  49.3  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.283972  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3376  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.18 
 
 
283 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.135987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3182  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  45 
 
 
375 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00209082 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18550  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  42.11 
 
 
225 aa  49.3  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1518  hypothetical protein  42.47 
 
 
241 aa  48.5  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4855  cell wall hydrolase/autolysin  38.82 
 
 
396 aa  48.5  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2908  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.98 
 
 
273 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0270551  normal  0.498444 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5086  cell wall hydrolase/autolysin  45.76 
 
 
383 aa  47.8  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0604  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.67 
 
 
326 aa  47.8  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.66709  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4565  Transglycosylase domain protein  41.94 
 
 
224 aa  47.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.651995  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1443  Zinc D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  44.78 
 
 
242 aa  47.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1560  spore cortex-lytic enzyme  44.12 
 
 
225 aa  47.4  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5099  cell wall hydrolase/autolysin  43.75 
 
 
387 aa  47.4  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000380245 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0539  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.16 
 
 
464 aa  47.4  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4383  peptidoglycan binding domain-containing protein  50.88 
 
 
233 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245541  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>