70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2969 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2969  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 
274 aa  555  1e-157  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1872  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  45.86 
 
 
268 aa  233  2.0000000000000002e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.322765  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0199  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.86 
 
 
266 aa  185  9e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691121  normal  0.116846 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1343  hypothetical protein  41.57 
 
 
250 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4844  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.93 
 
 
266 aa  180  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.38175  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37540  PG-binding-1 domain-containing protein  38.65 
 
 
276 aa  177  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.111379  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2908  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.32 
 
 
273 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0270551  normal  0.498444 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1931  putative phage-related protein (hydrolase)  39.71 
 
 
268 aa  162  7e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537579  normal  0.910807 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2250  Lytic transglycosylase catalytic  37.34 
 
 
294 aa  156  4e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2350  hypothetical protein  40.82 
 
 
280 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.889087  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3197  putative phage-related protein (hydrolase)  30.42 
 
 
267 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000132764  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0588  hypothetical protein  36.56 
 
 
188 aa  109  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.255449  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3855  hypothetical protein  33.66 
 
 
277 aa  100  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.322075 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4256  hypothetical protein  34.54 
 
 
203 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0578  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.83 
 
 
283 aa  98.2  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0181563  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4510  peptidoglycan binding domain-containing protein  33 
 
 
398 aa  97.4  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.678924 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0080  hypothetical protein  32.47 
 
 
203 aa  95.5  8e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.658451  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6577  hypothetical protein  30.15 
 
 
404 aa  86.7  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04252  LysM domain protein  33.62 
 
 
424 aa  86.3  6e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2734  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.29 
 
 
300 aa  84.3  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.230692  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1239  hypothetical protein  31.77 
 
 
258 aa  81.3  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0267  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.79 
 
 
317 aa  80.9  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252847  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6107  hypothetical protein  28.87 
 
 
450 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.724115 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1197  DNA-directed RNA polymerase beta' chain  30.14 
 
 
946 aa  71.2  0.00000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0957323  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1931  hypothetical protein  29.44 
 
 
457 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0730  peptidoglycan binding domain-containing protein  50 
 
 
1089 aa  60.1  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2284  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.62 
 
 
198 aa  54.7  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.586079  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3571  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.1 
 
 
274 aa  52.8  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  46.88 
 
 
324 aa  52.8  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2988  peptidoglycan binding domain-containing protein  48.98 
 
 
249 aa  52.4  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.382188 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3497  peptidoglycan-binding domain 1 protein  40.98 
 
 
182 aa  52  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0968  stage II sporulation D domain-containing protein  31.08 
 
 
462 aa  51.2  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00176967  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11630  metalloendopeptidase-like membrane protein  41.94 
 
 
323 aa  50.8  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1949  cell wall hydrolase, SleB  39.81 
 
 
224 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000201814  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2387  gamma-D-glutamyl-{L}-meso-diaminopimelate peptidase I. metallo peptidase. MEROPS family M14C  40 
 
 
423 aa  50.1  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.44 
 
 
391 aa  49.7  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  40.98 
 
 
372 aa  49.3  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39690  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.21 
 
 
382 aa  49.3  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2153  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.1 
 
 
319 aa  48.9  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000738312  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4199  SH3, type 3  26.74 
 
 
459 aa  48.5  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.690204  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2464  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  45.28 
 
 
201 aa  47.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000202368  normal  0.0272444 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0056  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.46 
 
 
160 aa  47  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1440  SpoIID/LytB domain-containing protein  41.79 
 
 
762 aa  47.4  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0042  spore cortex-lytic enzyme  36.84 
 
 
228 aa  46.6  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.415977  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6248  NLP/P60 protein  37.08 
 
 
285 aa  46.6  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0809629  normal  0.153407 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3347  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.52 
 
 
629 aa  46.6  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1440  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.91 
 
 
275 aa  46.2  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1831  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.9 
 
 
323 aa  46.2  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1970  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.31 
 
 
160 aa  45.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.607803 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2508  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.07 
 
 
256 aa  45.8  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0275667  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1726  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.81 
 
 
224 aa  45.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0528889  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4421  glycoside hydrolase family protein  39.68 
 
 
243 aa  45.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0153  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  40.91 
 
 
665 aa  45.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0960  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.93 
 
 
575 aa  44.3  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.538106  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1188  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.01 
 
 
321 aa  44.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2294  cell wall hydrolase/autolysin  36.23 
 
 
358 aa  44.3  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1663  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  33.33 
 
 
283 aa  44.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2152  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.21 
 
 
356 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000936807  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4581  cell wall hydrolase/autolysin  35.82 
 
 
392 aa  43.9  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170729 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2188  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.71 
 
 
549 aa  43.9  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0037  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.2 
 
 
332 aa  43.5  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5193  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.76 
 
 
356 aa  43.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000362844  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5099  cell wall hydrolase/autolysin  37.31 
 
 
387 aa  43.1  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000380245 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4980  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.7 
 
 
128 aa  42.7  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5403  cell wall hydrolase/autolysin  32.14 
 
 
383 aa  42.7  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7088  cell wall hydrolase/autolysin  27.93 
 
 
379 aa  42.4  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03060  Spore cortex-lytic enzyme SleB  38.1 
 
 
239 aa  42.4  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5192  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.51 
 
 
322 aa  42.4  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000000016794  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4701  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.33 
 
 
329 aa  42  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.997176  normal  0.841569 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0221  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.96 
 
 
447 aa  42  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0446157  normal  0.633026 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>