167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0056 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0056  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 
160 aa  329  1e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  41.06 
 
 
391 aa  103  9e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1246  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.92 
 
 
508 aa  88.2  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2153  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.1 
 
 
319 aa  77  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000738312  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0960  peptidoglycan binding domain-containing protein  36 
 
 
575 aa  75.9  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.538106  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5194  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.44 
 
 
306 aa  76.3  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00951194  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1959  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.04 
 
 
487 aa  75.5  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315261  normal  0.0108797 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  31.48 
 
 
372 aa  72  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1518  hypothetical protein  40 
 
 
241 aa  71.6  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2151  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.24 
 
 
306 aa  71.2  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0511643  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3994  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.63 
 
 
266 aa  70.5  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.552337  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5192  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.17 
 
 
322 aa  68.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000000016794  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1970  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.62 
 
 
160 aa  68.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.607803 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5193  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.33 
 
 
356 aa  68.2  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000362844  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2804  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.23 
 
 
364 aa  67  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0769202  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4087  peptidoglycan-binding domain 1 protein  50.82 
 
 
249 aa  65.9  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1440  SpoIID/LytB domain-containing protein  34.18 
 
 
762 aa  66.2  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0042  spore cortex-lytic enzyme  48.44 
 
 
228 aa  65.9  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.415977  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5404  peptidoglycan binding domain-containing protein  32 
 
 
398 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5493  peptidoglycan binding domain-containing protein  32 
 
 
398 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal  0.340156 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5780  peptidoglycan binding domain-containing protein  32 
 
 
398 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.103235  normal  0.0225993 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4855  cell wall hydrolase/autolysin  31.25 
 
 
396 aa  65.5  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1166  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.12 
 
 
412 aa  63.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.462294  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4311  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.74 
 
 
305 aa  63.5  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03060  Spore cortex-lytic enzyme SleB  45.31 
 
 
239 aa  63.5  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2464  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.1 
 
 
201 aa  63.5  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000202368  normal  0.0272444 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3133  NLP/P60 protein  33.58 
 
 
454 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000296935  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2284  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.78 
 
 
198 aa  63.2  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.586079  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2294  cell wall hydrolase/autolysin  34.03 
 
 
358 aa  62.8  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0837  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.37 
 
 
395 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.265707  normal  0.357261 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3020  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  45.9 
 
 
243 aa  60.8  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000912863  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6069  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.72 
 
 
395 aa  60.8  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.123389 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3195  cell wall hydrolase, SleB  45.16 
 
 
234 aa  60.5  0.000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7330  cell wall hydrolase/autolysin  34.19 
 
 
409 aa  60.8  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.680147  normal  0.468389 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0968  stage II sporulation D domain-containing protein  33.58 
 
 
462 aa  60.8  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00176967  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0039  spore cortex-lytic enzyme  45.07 
 
 
242 aa  60.8  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11630  metalloendopeptidase-like membrane protein  35.11 
 
 
323 aa  60.1  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1886  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.61 
 
 
635 aa  60.1  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4234  cell wall hydrolase/autolysin  31.41 
 
 
395 aa  59.3  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0896  Peptidase M23  35.48 
 
 
352 aa  58.9  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2152  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.86 
 
 
356 aa  59.3  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000936807  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0032  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.85 
 
 
323 aa  58.5  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3497  peptidoglycan-binding domain 1 protein  48.48 
 
 
182 aa  58.2  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1348  peptidoglycan-binding domain 1 protein  41.94 
 
 
270 aa  58.2  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00397978 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1188  peptidoglycan binding domain-containing protein  49.18 
 
 
321 aa  58.5  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4980  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.89 
 
 
128 aa  58.2  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0221  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.91 
 
 
447 aa  58.2  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0446157  normal  0.633026 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0330  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  47.69 
 
 
792 aa  58.2  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13950  hydrolase  34.55 
 
 
406 aa  58.2  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7088  cell wall hydrolase/autolysin  32.86 
 
 
379 aa  57.8  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3286  NLP/P60 protein  30.46 
 
 
450 aa  57.8  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  44.62 
 
 
232 aa  57.4  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1560  spore cortex-lytic enzyme  46.67 
 
 
225 aa  56.6  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4330  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.28 
 
 
485 aa  55.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4581  cell wall hydrolase/autolysin  28.17 
 
 
392 aa  55.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170729 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1831  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.48 
 
 
323 aa  55.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05880  cell wall hydrolase SleB  49.21 
 
 
229 aa  55.5  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.84059e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.65 
 
 
327 aa  55.5  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5403  cell wall hydrolase/autolysin  31.76 
 
 
383 aa  55.5  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39690  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.48 
 
 
382 aa  55.1  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5099  cell wall hydrolase/autolysin  28.77 
 
 
387 aa  55.1  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000380245 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0730  peptidoglycan binding domain-containing protein  50.79 
 
 
1089 aa  55.1  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1897  spore cortex-lytic enzyme SleB  38.16 
 
 
247 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0572878  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2364  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.44 
 
 
92 aa  54.7  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0581  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  29.86 
 
 
330 aa  54.3  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000627689  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1953  cell wall hydrolase, SleB  45 
 
 
234 aa  53.9  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5086  cell wall hydrolase/autolysin  31.33 
 
 
383 aa  54.3  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0528  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.06 
 
 
334 aa  53.9  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1537  general secretion pathway protein-related protein  37.35 
 
 
540 aa  53.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259719  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4755  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.29 
 
 
269 aa  53.9  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.15503  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2150  cell wall hydrolase/autolysin  32.28 
 
 
378 aa  53.5  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2792  hypothetical protein  41.94 
 
 
264 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0037  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  27.53 
 
 
332 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1726  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  42.03 
 
 
224 aa  52.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0528889  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1832  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.66 
 
 
379 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0607  cell wall hydrolase, SleB  40.24 
 
 
236 aa  53.1  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0035  spore cortex-lytic enzyme  46.67 
 
 
231 aa  52  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3182  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  31.65 
 
 
375 aa  52.4  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00209082 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2466  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.94 
 
 
562 aa  51.6  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4538  cell wall hydrolase/autolysin  34.86 
 
 
438 aa  52  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4701  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.97 
 
 
329 aa  51.6  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.997176  normal  0.841569 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1440  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.28 
 
 
275 aa  51.6  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3571  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.47 
 
 
274 aa  52  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0756  hypothetical protein  40.54 
 
 
204 aa  51.2  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.444213  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2175  spore cortex-lytic enzyme  40.3 
 
 
270 aa  51.2  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1949  cell wall hydrolase, SleB  50 
 
 
224 aa  50.8  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000201814  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  45.16 
 
 
324 aa  50.4  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2755  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.57 
 
 
170 aa  50.4  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3347  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.28 
 
 
629 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4768  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.11 
 
 
245 aa  50.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2756  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  34.02 
 
 
253 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000173118 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2781  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  39.68 
 
 
259 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.120397  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2483  spore cortex-lytic enzyme  39.68 
 
 
253 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0343693  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4396  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.11 
 
 
313 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000949071 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2748  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  39.68 
 
 
253 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2387  gamma-D-glutamyl-{L}-meso-diaminopimelate peptidase I. metallo peptidase. MEROPS family M14C  41.27 
 
 
423 aa  49.7  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0449  spore cortex-lytic enzyme  32.95 
 
 
267 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2188  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.47 
 
 
549 aa  49.7  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2802  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  39.68 
 
 
259 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.45164  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2760  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  39.68 
 
 
259 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542492  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>