124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3347 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3347  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 		 629 aa  1281    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2464  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  42.98 
 
 		 201 aa  73.2  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000202368  normal  0.0272444 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1654  peptidoglycan binding domain-containing protein  52.7 
 
 		 974 aa  72.8  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00486103  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3571  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  47.37 
 
 		 274 aa  69.7  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03060  Spore cortex-lytic enzyme SleB  48.57 
 
 		 239 aa  67.4  0.0000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2826  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.62 
 
 		 554 aa  67  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  48.61 
 
 		 372 aa  66.6  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4980  peptidoglycan binding domain-containing protein  50 
 
 		 128 aa  64.7  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2164  hypothetical protein  35 
 
 		 614 aa  63.5  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3497  peptidoglycan-binding domain 1 protein  47.89 
 
 		 182 aa  63.5  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  49.33 
 
 		 391 aa  62.4  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5403  cell wall hydrolase/autolysin  36.7 
 
 		 383 aa  61.6  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1726  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  54.41 
 
 		 224 aa  61.6  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0528889  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0267  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.25 
 
 		 317 aa  60.1  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0199  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.07 
 
 		 266 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691121  normal  0.116846 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1970  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  61.54 
 
 		 160 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.607803 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0330  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  41.24 
 
 		 792 aa  58.9  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7330  cell wall hydrolase/autolysin  46.48 
 
 		 409 aa  58.5  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.680147  normal  0.468389 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0730  peptidoglycan binding domain-containing protein  50 
 
 		 1089 aa  58.5  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1872  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  29.19 
 
 		 268 aa  58.5  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.322765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2150  cell wall hydrolase/autolysin  34.62 
 
 		 378 aa  57.4  0.0000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4396  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.24 
 
 		 313 aa  55.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000949071 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2988  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.77 
 
 		 249 aa  55.5  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.382188 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1663  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  49.09 
 
 		 283 aa  55.8  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4844  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.66 
 
 		 266 aa  55.5  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.38175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5086  cell wall hydrolase/autolysin  38.68 
 
 		 383 aa  55.5  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39690  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  49.32 
 
 		 382 aa  55.5  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09540  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  47.83 
 
 		 280 aa  55.8  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623217  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0968  stage II sporulation D domain-containing protein  43.42 
 
 		 462 aa  55.1  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00176967  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6248  NLP/P60 protein  45.83 
 
 		 285 aa  55.1  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0809629  normal  0.153407 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4538  cell wall hydrolase/autolysin  43.66 
 
 		 438 aa  54.7  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0221  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  63.89 
 
 		 447 aa  53.9  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0446157  normal  0.633026 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  50 
 
 		 433 aa  53.9  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0042  spore cortex-lytic enzyme  42.25 
 
 		 228 aa  53.5  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.415977  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3376  peptidoglycan binding domain-containing protein  56.14 
 
 		 283 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.135987 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2387  gamma-D-glutamyl-{L}-meso-diaminopimelate peptidase I. metallo peptidase. MEROPS family M14C  43.66 
 
 		 423 aa  53.5  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1812  peptidoglycan binding domain-containing protein  51.72 
 
 		 77 aa  53.5  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00132339  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0039  spore cortex-lytic enzyme  40.45 
 
 		 242 aa  53.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1188  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.62 
 
 		 321 aa  52.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1726  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  45.9 
 
 		 198 aa  52.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1897  spore cortex-lytic enzyme SleB  41.67 
 
 		 247 aa  52.8  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0572878  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5192  peptidoglycan binding domain-containing protein  54.9 
 
 		 322 aa  53.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000000016794  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05880  cell wall hydrolase SleB  33.03 
 
 		 229 aa  52.8  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.84059e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5126  peptidoglycan-binding domain 1 protein  46.27 
 
 		 200 aa  53.1  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.283972  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3152  peptidoglycan binding domain-containing protein  50.79 
 
 		 288 aa  52  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.396034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0945  peptidoglycan-binding domain 1 protein  68.42 
 
 		 260 aa  52.4  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.572838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5194  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.67 
 
 		 306 aa  52.4  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00951194  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2151  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 306 aa  51.6  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0511643  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37540  PG-binding-1 domain-containing protein  50 
 
 		 276 aa  51.2  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.111379  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2553  spore cortex-lytic enzyme SleB  40.54 
 
 		 259 aa  50.8  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0187217  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4855  cell wall hydrolase/autolysin  47.62 
 
 		 396 aa  51.2  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1225  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  43.66 
 
 		 234 aa  51.2  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11630  metalloendopeptidase-like membrane protein  46.88 
 
 		 323 aa  50.8  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2781  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  37.97 
 
 		 259 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.120397  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2562  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  37.08 
 
 		 253 aa  49.7  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00268297  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2518  spore cortex-lytic enzyme  37.08 
 
 		 253 aa  49.7  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0056  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.28 
 
 		 160 aa  50.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2748  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  37.08 
 
 		 253 aa  49.7  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0085  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.32 
 
 		 143 aa  49.7  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0096  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.93 
 
 		 559 aa  50.1  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0153  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  43.24 
 
 		 665 aa  50.1  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2802  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  37.97 
 
 		 259 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.45164  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2756  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  36.56 
 
 		 253 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000173118 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4849  spore cortex-lytic enzyme  46.27 
 
 		 228 aa  50.4  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4565  Transglycosylase domain protein  42.42 
 
 		 224 aa  50.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.651995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04480  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  46.48 
 
 		 422 aa  50.1  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.38395  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2483  spore cortex-lytic enzyme  37.08 
 
 		 253 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0343693  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2841  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  50.82 
 
 		 554 aa  49.3  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00157478  normal  0.0185409 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2284  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.51 
 
 		 198 aa  49.7  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.586079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4180  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  69.7 
 
 		 232 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4246  peptidoglycan binding domain-containing protein  69.7 
 
 		 232 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.537178  normal  0.324419 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4402  peptidoglycan binding domain-containing protein  69.7 
 
 		 232 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.221935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5193  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  38.16 
 
 		 356 aa  49.3  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000362844  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.51 
 
 		 327 aa  49.7  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.57 
 
 		 422 aa  49.7  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2760  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  37.08 
 
 		 259 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542492  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2532  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  37.08 
 
 		 253 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000946366 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2734  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.36 
 
 		 300 aa  48.9  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.230692  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0032  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.36 
 
 		 323 aa  48.9  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1842  hypothetical protein  39.51 
 
 		 306 aa  48.1  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.224283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3994  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.15 
 
 		 266 aa  48.1  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.552337  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2153  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.62 
 
 		 319 aa  48.1  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000738312  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  40.58 
 
 		 2277 aa  48.1  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1960  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.56 
 
 		 360 aa  47.8  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2356  glycoside hydrolase family 25  40.35 
 
 		 297 aa  47.8  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000423175  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3195  cell wall hydrolase, SleB  44.62 
 
 		 234 aa  47.8  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2152  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  38.16 
 
 		 356 aa  47.8  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000936807  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1440  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.52 
 
 		 275 aa  47.8  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4311  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.94 
 
 		 305 aa  47.4  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4234  cell wall hydrolase/autolysin  40.68 
 
 		 395 aa  47.4  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3619  cell wall hydrolase/autolysin  48.15 
 
 		 313 aa  47.4  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.802629  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0091  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.75 
 
 		 171 aa  47  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.337262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2294  cell wall hydrolase/autolysin  40.91 
 
 		 358 aa  46.6  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1153  transglycosylase domain-containing protein  43.1 
 
 		 266 aa  47.4  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.478792 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3173  peptidase M23B  32 
 
 		 314 aa  47  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000536198  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0528  peptidoglycan binding domain-containing protein  57.14 
 
 		 334 aa  46.6  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2969  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.52 
 
 		 274 aa  46.6  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2508  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.1 
 
 		 256 aa  47  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0275667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2457  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.13 
 
 		 294 aa  46.6  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.156102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2188  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  50.98 
 
 		 549 aa  47  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>