116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4701 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4701  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  100 
 
 
329 aa  667    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.997176  normal  0.841569 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0221  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.33 
 
 
447 aa  164  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0446157  normal  0.633026 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1448  Lytic transglycosylase catalytic  55.47 
 
 
362 aa  155  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0207836  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5779  hypothetical protein  56.72 
 
 
225 aa  142  8e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.225562  normal  0.467407 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1781  hypothetical protein  45.16 
 
 
213 aa  135  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0154  hypothetical protein  47.45 
 
 
201 aa  135  9.999999999999999e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1440  SpoIID/LytB domain-containing protein  43.59 
 
 
762 aa  89.7  6e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3133  NLP/P60 protein  28.01 
 
 
454 aa  77  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000296935  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3286  NLP/P60 protein  30.77 
 
 
450 aa  75.1  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1166  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.8 
 
 
412 aa  73.9  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.462294  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1960  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.4 
 
 
360 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1970  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.38 
 
 
160 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.607803 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2153  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.83 
 
 
319 aa  70.9  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000738312  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0896  Peptidase M23  35.26 
 
 
352 aa  70.5  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  30.94 
 
 
372 aa  66.2  0.0000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1246  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.99 
 
 
508 aa  61.6  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2152  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.06 
 
 
356 aa  60.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000936807  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0037  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.25 
 
 
332 aa  60.1  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11630  metalloendopeptidase-like membrane protein  30.14 
 
 
323 aa  59.7  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5194  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.73 
 
 
306 aa  58.9  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00951194  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.77 
 
 
391 aa  58.9  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1518  hypothetical protein  33.53 
 
 
241 aa  58.5  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0960  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.24 
 
 
575 aa  57.4  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.538106  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4980  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.44 
 
 
128 aa  57  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5192  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.89 
 
 
322 aa  57  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000000016794  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1197  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.28 
 
 
667 aa  56.6  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05880  cell wall hydrolase SleB  43.04 
 
 
229 aa  55.8  0.0000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.84059e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3994  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.95 
 
 
266 aa  55.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.552337  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5193  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.19 
 
 
356 aa  54.3  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000362844  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0730  peptidoglycan binding domain-containing protein  50 
 
 
1089 aa  54.7  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2908  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.54 
 
 
273 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0270551  normal  0.498444 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0968  stage II sporulation D domain-containing protein  29.61 
 
 
462 aa  53.1  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00176967  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  28.48 
 
 
232 aa  53.1  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09540  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  32.26 
 
 
280 aa  52.8  0.000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623217  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0056  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.97 
 
 
160 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2310  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.67 
 
 
221 aa  52  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.724805  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1832  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.21 
 
 
379 aa  51.6  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1959  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.53 
 
 
487 aa  51.2  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315261  normal  0.0108797 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1443  Zinc D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  38.1 
 
 
242 aa  50.8  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4421  glycoside hydrolase family protein  41.77 
 
 
243 aa  50.4  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4849  spore cortex-lytic enzyme  40 
 
 
228 aa  50.4  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5086  cell wall hydrolase/autolysin  33.08 
 
 
383 aa  50.4  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.33 
 
 
422 aa  50.1  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2755  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.41 
 
 
170 aa  49.7  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39690  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.57 
 
 
382 aa  48.5  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0476  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.94 
 
 
206 aa  48.5  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4855  cell wall hydrolase/autolysin  31.45 
 
 
396 aa  48.9  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1949  cell wall hydrolase, SleB  44.78 
 
 
224 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000201814  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0879  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  38.81 
 
 
250 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.174161  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2607  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  37.68 
 
 
253 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.559154  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7088  cell wall hydrolase/autolysin  29.01 
 
 
379 aa  47.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0765  Zinc D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  41.67 
 
 
263 aa  47.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.510522  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0992  glycoside hydrolase family 18  37.25 
 
 
426 aa  47.8  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00884991  hitchhiker  0.00000357477 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1440  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.64 
 
 
275 aa  47  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1042  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.37 
 
 
283 aa  47  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6183  1 N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  40 
 
 
283 aa  46.6  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.301475  normal  0.754247 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2553  spore cortex-lytic enzyme SleB  38.67 
 
 
259 aa  46.6  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0187217  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2867  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  34.78 
 
 
253 aa  46.6  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.973804 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2566  spore cortex-lytic enzyme SleC  38.75 
 
 
438 aa  46.6  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1897  spore cortex-lytic enzyme SleB  33.71 
 
 
247 aa  46.2  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0572878  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0271  NlpC/P60 family protein  29.27 
 
 
257 aa  46.2  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.677165 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3497  peptidoglycan-binding domain 1 protein  42.59 
 
 
182 aa  46.2  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4057  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  38.1 
 
 
288 aa  46.2  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.100978  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21900  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.75 
 
 
263 aa  45.8  0.0009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1270  negative regulator of AmpC, AmpD  35.06 
 
 
289 aa  45.8  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1888  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  36.59 
 
 
332 aa  45.4  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1886  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.66 
 
 
635 aa  45.8  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2007  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  37.31 
 
 
251 aa  45.8  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0212673 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1831  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  27.54 
 
 
323 aa  45.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3380  NLP/P60 protein  28.46 
 
 
234 aa  44.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0941  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.82 
 
 
250 aa  45.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0224398  normal  0.101209 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.89 
 
 
327 aa  44.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0904  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  35.82 
 
 
250 aa  45.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.146365  normal  0.280229 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  35.59 
 
 
2277 aa  45.1  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0729  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.44 
 
 
532 aa  44.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9044  cell wall hydrolase/autolysin  29.14 
 
 
381 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03950  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  27.78 
 
 
303 aa  45.1  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.759104 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2781  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  38.03 
 
 
259 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.120397  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2562  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  38.03 
 
 
253 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00268297  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2518  spore cortex-lytic enzyme  38.03 
 
 
253 aa  44.3  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2483  spore cortex-lytic enzyme  36.99 
 
 
253 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0343693  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2748  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  38.03 
 
 
253 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4194  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.48 
 
 
528 aa  44.3  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1732  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.78 
 
 
268 aa  44.7  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0255  NlpC/P60 family protein  28.46 
 
 
269 aa  44.3  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0261  NlpC/P60 family protein  28.46 
 
 
269 aa  44.3  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2804  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.01 
 
 
364 aa  43.9  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0769202  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2802  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  38.03 
 
 
259 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.45164  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2760  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  38.03 
 
 
259 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542492  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2532  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  38.03 
 
 
253 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000946366 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2756  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  38.03 
 
 
253 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000173118 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0052  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  47.27 
 
 
346 aa  44.3  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.246037  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30050  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  28.23 
 
 
246 aa  44.3  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0031896  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3186  hypothetical protein  36.76 
 
 
256 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2151  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.81 
 
 
306 aa  43.9  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0511643  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18550  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.59 
 
 
225 aa  43.9  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2284  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.44 
 
 
198 aa  43.5  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.586079  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4565  Transglycosylase domain protein  43.75 
 
 
224 aa  43.5  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.651995  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0939  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.36 
 
 
310 aa  43.5  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2175  spore cortex-lytic enzyme  33.33 
 
 
270 aa  43.5  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>