132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1440 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1440  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 		 275 aa  566  1e-160  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1166  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.26 
 
 		 412 aa  60.1  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.462294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1506  hypothetical protein  28.83 
 
 		 393 aa  58.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.75783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3323  NLP/P60 protein  31.13 
 
 		 277 aa  58.2  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000142294  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2029  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  48.28 
 
 		 401 aa  57  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000748498  normal  0.890774 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1435  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.13 
 
 		 363 aa  57  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7330  cell wall hydrolase/autolysin  47.27 
 
 		 409 aa  56.6  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.680147  normal  0.468389 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0669  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.86 
 
 		 465 aa  56.6  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0960  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.38 
 
 		 575 aa  55.8  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.538106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0896  Peptidase M23  37.5 
 
 		 352 aa  54.7  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7088  cell wall hydrolase/autolysin  45.45 
 
 		 379 aa  54.3  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0730  peptidoglycan binding domain-containing protein  49.09 
 
 		 1089 aa  54.7  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6248  NLP/P60 protein  27.73 
 
 		 285 aa  53.9  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0809629  normal  0.153407 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  28.14 
 
 		 232 aa  53.5  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4849  spore cortex-lytic enzyme  38.64 
 
 		 228 aa  53.1  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0056  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.28 
 
 		 160 aa  51.6  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2868  lytic murein transglycosylase  42.31 
 
 		 425 aa  52  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.387874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5086  cell wall hydrolase/autolysin  35.62 
 
 		 383 aa  51.6  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4538  cell wall hydrolase/autolysin  36.99 
 
 		 438 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1663  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  34.33 
 
 		 283 aa  50.8  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0039  spore cortex-lytic enzyme  47.17 
 
 		 242 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0968  stage II sporulation D domain-containing protein  52.83 
 
 		 462 aa  51.2  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00176967  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2024  lytic murein transglycosylase  36.36 
 
 		 457 aa  50.8  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.796607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5403  cell wall hydrolase/autolysin  43.1 
 
 		 383 aa  50.8  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1949  cell wall hydrolase, SleB  40.28 
 
 		 224 aa  50.4  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000201814  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2150  cell wall hydrolase/autolysin  37.93 
 
 		 378 aa  49.7  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1443  Zinc D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  32.38 
 
 		 242 aa  49.7  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  26.03 
 
 		 372 aa  48.9  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2152  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  44.44 
 
 		 356 aa  48.9  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000936807  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1886  peptidoglycan binding domain-containing protein  48.21 
 
 		 635 aa  49.3  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39690  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.48 
 
 		 382 aa  48.9  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.7 
 
 		 422 aa  48.9  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1316  putative peptidoglycan-binding protein  29.89 
 
 		 427 aa  48.1  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03060  Spore cortex-lytic enzyme SleB  45.28 
 
 		 239 aa  48.9  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1188  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.17 
 
 		 321 aa  48.5  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0330  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  43.4 
 
 		 792 aa  48.5  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0153  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.71 
 
 		 665 aa  48.5  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00471  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  28.26 
 
 		 421 aa  48.9  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03184  putative transglycosylase protein  34.92 
 
 		 390 aa  47.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0378496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0344  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  25.64 
 
 		 309 aa  47.8  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1560  spore cortex-lytic enzyme  43.1 
 
 		 225 aa  48.1  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1518  hypothetical protein  44 
 
 		 241 aa  47.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0052  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  42.37 
 
 		 346 aa  47.4  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.246037  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2387  gamma-D-glutamyl-{L}-meso-diaminopimelate peptidase I. metallo peptidase. MEROPS family M14C  38.98 
 
 		 423 aa  47.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4855  cell wall hydrolase/autolysin  38.1 
 
 		 396 aa  47.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3347  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.52 
 
 		 629 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1537  general secretion pathway protein-related protein  40.62 
 
 		 540 aa  47  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259719  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2466  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.27 
 
 		 562 aa  47  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1953  cell wall hydrolase, SleB  40.54 
 
 		 234 aa  47.4  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13950  hydrolase  31.96 
 
 		 406 aa  47  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2141  lytic murein transglycosylase  35.85 
 
 		 437 aa  47  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000451146  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1465  lytic murein transglycosylase  38.98 
 
 		 400 aa  47  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20045 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4701  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  44.64 
 
 		 329 aa  47  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.997176  normal  0.841569 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2153  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.45 
 
 		 319 aa  46.6  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000738312  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2991  lytic murein transglycosylase  35.53 
 
 		 455 aa  46.6  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.729746  normal  0.516476 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3432  lytic murein transglycosylase  32.84 
 
 		 428 aa  46.6  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2316  lytic murein transglycosylase  27.47 
 
 		 439 aa  46.6  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000238033  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1994  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  26.37 
 
 		 433 aa  46.2  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1213  lytic murein transglycosylase  32.05 
 
 		 417 aa  46.2  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04480  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  35.96 
 
 		 422 aa  46.2  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.38395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2969  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.91 
 
 		 274 aa  46.2  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0042  spore cortex-lytic enzyme  39.13 
 
 		 228 aa  46.2  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.415977  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3255  lytic murein transglycosylase  29.76 
 
 		 418 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.278323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  43.4 
 
 		 391 aa  46.2  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1837  lytic murein transglycosylase  33.33 
 
 		 474 aa  45.8  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.436573 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1688  lytic murein transglycosylase  33.33 
 
 		 466 aa  45.8  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3571  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.33 
 
 		 274 aa  45.8  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  40 
 
 		 1012 aa  45.8  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5192  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.17 
 
 		 322 aa  45.8  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000000016794  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3272  hypothetical protein  27.06 
 
 		 217 aa  45.4  0.0009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000705988  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0061  lytic murein transglycosylase  27.91 
 
 		 434 aa  45.4  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.266485  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2464  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  43.4 
 
 		 201 aa  45.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000202368  normal  0.0272444 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3137  extracellular solute-binding protein  35.21 
 
 		 524 aa  45.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2755  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.83 
 
 		 170 aa  45.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0032  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.68 
 
 		 323 aa  44.7  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0799  hypothetical protein  29.33 
 
 		 216 aa  45.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11630  metalloendopeptidase-like membrane protein  38.81 
 
 		 323 aa  45.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2467  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 523 aa  45.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000299001 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0750  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.46 
 
 		 531 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3279  lytic murein transglycosylase  32.47 
 
 		 413 aa  45.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.991349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2341  lytic murein transglycosylase  24.18 
 
 		 424 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000746143  normal  0.0730107 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0756  hypothetical protein  38.33 
 
 		 204 aa  44.3  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.444213  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2459  lytic murein transglycosylase  24.18 
 
 		 430 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000623044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3599  lytic murein transglycosylase  37.74 
 
 		 410 aa  44.3  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.522427  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0212  lytic murein transglycosylase  32.26 
 
 		 395 aa  44.3  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.740075  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0051  lytic murein transglycosylase  35.44 
 
 		 421 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1972  lytic murein transglycosylase  38.6 
 
 		 486 aa  44.7  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000382948  normal  0.768189 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5099  cell wall hydrolase/autolysin  32.39 
 
 		 387 aa  44.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000380245 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5193  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  40 
 
 		 356 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000362844  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1755  lytic murein transglycosylase  28.57 
 
 		 436 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000443123  hitchhiker  0.00243223 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2998  carboxyl-terminal protease  36.99 
 
 		 480 aa  43.9  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000384491  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2304  lytic murein transglycosylase  39.62 
 
 		 407 aa  43.9  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0222996  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2269  lytic murein transglycosylase  24.18 
 
 		 424 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00964574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0033  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.68 
 
 		 346 aa  43.9  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.259592  normal  0.110455 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3195  cell wall hydrolase, SleB  36.51 
 
 		 234 aa  43.9  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05880  cell wall hydrolase SleB  41.51 
 
 		 229 aa  43.9  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.84059e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0014  vgrG protein  38.03 
 
 		 1017 aa  43.9  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2705  lytic murein transglycosylase  27.27 
 
 		 438 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000884934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1197  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.21 
 
 		 667 aa  43.9  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1947  lytic murein transglycosylase  35.85 
 
 		 395 aa  43.9  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000327314  normal  0.0135301 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>