160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1959 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1959  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 
487 aa  985    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315261  normal  0.0108797 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3286  NLP/P60 protein  32.74 
 
 
450 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1440  SpoIID/LytB domain-containing protein  32.46 
 
 
762 aa  131  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1246  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.95 
 
 
508 aa  123  7e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3133  NLP/P60 protein  30.28 
 
 
454 aa  123  9e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000296935  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.9 
 
 
391 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1886  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.8 
 
 
635 aa  105  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2188  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  28.67 
 
 
549 aa  102  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1166  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.41 
 
 
412 aa  96.7  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.462294  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0960  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.76 
 
 
575 aa  80.1  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.538106  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4087  peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.18 
 
 
249 aa  78.2  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0056  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.04 
 
 
160 aa  75.5  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0101  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  28.85 
 
 
294 aa  71.6  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7088  cell wall hydrolase/autolysin  36.54 
 
 
379 aa  71.6  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1518  hypothetical protein  33.85 
 
 
241 aa  70.9  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2294  cell wall hydrolase/autolysin  33.33 
 
 
358 aa  68.9  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0032  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.82 
 
 
323 aa  66.6  0.0000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3994  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.3 
 
 
266 aa  66.2  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.552337  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39690  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.54 
 
 
382 aa  64.7  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1960  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.33 
 
 
360 aa  63.5  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0344  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.96 
 
 
309 aa  63.5  0.000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5099  cell wall hydrolase/autolysin  30.99 
 
 
387 aa  62.4  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000380245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9263  hypothetical protein  45.16 
 
 
381 aa  61.6  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.553952 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4581  cell wall hydrolase/autolysin  30.28 
 
 
392 aa  61.6  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170729 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1970  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.22 
 
 
160 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.607803 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2150  cell wall hydrolase/autolysin  26.45 
 
 
378 aa  60.8  0.00000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13950  hydrolase  31.71 
 
 
406 aa  60.8  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5403  cell wall hydrolase/autolysin  33.55 
 
 
383 aa  60.8  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3528  peptidoglycan binding domain-containing protein  48.68 
 
 
389 aa  60.8  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4788  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.06 
 
 
163 aa  60.5  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.907058  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03950  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  33.12 
 
 
303 aa  60.5  0.00000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.759104 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5086  cell wall hydrolase/autolysin  35.66 
 
 
383 aa  60.5  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0311  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.12 
 
 
360 aa  58.9  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5404  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.67 
 
 
398 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5493  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.67 
 
 
398 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal  0.340156 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5780  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.67 
 
 
398 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.103235  normal  0.0225993 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4538  cell wall hydrolase/autolysin  26.63 
 
 
438 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0837  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.48 
 
 
395 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.265707  normal  0.357261 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4855  cell wall hydrolase/autolysin  28.83 
 
 
396 aa  57.8  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2786  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.44 
 
 
587 aa  57.4  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6069  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.39 
 
 
395 aa  57  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.123389 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  46.03 
 
 
433 aa  57  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0581  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.1 
 
 
330 aa  57  0.0000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000627689  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5145  Transglycosylase domain protein  29.09 
 
 
317 aa  56.6  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9044  cell wall hydrolase/autolysin  32.61 
 
 
381 aa  56.6  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1188  peptidoglycan binding domain-containing protein  40 
 
 
321 aa  55.8  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1663  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  44.78 
 
 
283 aa  55.5  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0912  periplasmic protease  36.84 
 
 
482 aa  55.5  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00173688 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0607  cell wall hydrolase, SleB  50 
 
 
236 aa  55.8  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7330  cell wall hydrolase/autolysin  30.95 
 
 
409 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.680147  normal  0.468389 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4311  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.39 
 
 
305 aa  53.9  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03060  Spore cortex-lytic enzyme SleB  31.93 
 
 
239 aa  53.1  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1709  spore cortex-lytic enzyme  53.06 
 
 
267 aa  52.8  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.233149  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0042  spore cortex-lytic enzyme  46.77 
 
 
228 aa  53.1  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.415977  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1348  peptidoglycan-binding domain 1 protein  43.84 
 
 
270 aa  53.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00397978 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0896  Peptidase M23  33.8 
 
 
352 aa  53.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0968  stage II sporulation D domain-containing protein  32.1 
 
 
462 aa  52.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00176967  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.46 
 
 
327 aa  53.1  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4755  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.87 
 
 
269 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.15503  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1560  spore cortex-lytic enzyme  39.29 
 
 
225 aa  52  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5192  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.62 
 
 
322 aa  52.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000000016794  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2916  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  50.85 
 
 
864 aa  52.4  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.260808  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1812  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.03 
 
 
77 aa  52.4  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00132339  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4768  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  41.43 
 
 
245 aa  52.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1683  OpcA  44.44 
 
 
458 aa  52  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0528  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.27 
 
 
334 aa  51.6  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5194  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.62 
 
 
306 aa  51.6  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00951194  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4701  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.53 
 
 
329 aa  51.2  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.997176  normal  0.841569 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4234  cell wall hydrolase/autolysin  30.89 
 
 
395 aa  50.8  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2153  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.99 
 
 
319 aa  50.8  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000738312  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1092  OpcA protein  48.15 
 
 
457 aa  50.8  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4194  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.19 
 
 
528 aa  50.8  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1953  cell wall hydrolase, SleB  40.79 
 
 
234 aa  50.4  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0039  spore cortex-lytic enzyme  46.03 
 
 
242 aa  50.4  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4421  glycoside hydrolase family protein  43.55 
 
 
243 aa  50.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2415  cell wall hydrolase, SleB  41.18 
 
 
233 aa  49.7  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.528951  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3195  cell wall hydrolase, SleB  41.38 
 
 
234 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1537  general secretion pathway protein-related protein  37.5 
 
 
540 aa  48.9  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259719  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0449  spore cortex-lytic enzyme  42.65 
 
 
267 aa  49.3  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0025  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.73 
 
 
1261 aa  48.5  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861527  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2804  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.82 
 
 
364 aa  48.5  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0769202  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19610  negative regulator of beta-lactamase expression  41.54 
 
 
248 aa  48.9  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00611508 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2193  carboxyl-terminal protease  43.64 
 
 
476 aa  48.5  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000308451  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0992  glycoside hydrolase family 18  47.27 
 
 
426 aa  48.9  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00884991  hitchhiker  0.00000357477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2792  hypothetical protein  40 
 
 
264 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0476  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.32 
 
 
206 aa  48.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0221  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  25.85 
 
 
447 aa  48.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0446157  normal  0.633026 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05880  cell wall hydrolase SleB  34.21 
 
 
229 aa  48.5  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.84059e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1831  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  29.14 
 
 
323 aa  48.5  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1897  spore cortex-lytic enzyme SleB  42.86 
 
 
247 aa  48.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0572878  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5152  peptidoglycan-binding domain 1 protein  42.65 
 
 
358 aa  48.5  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4180  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.86 
 
 
414 aa  48.1  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.988623 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6252  peptidoglycan binding domain-containing protein  22.9 
 
 
386 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0035  spore cortex-lytic enzyme  38.71 
 
 
231 aa  47.4  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2553  spore cortex-lytic enzyme SleB  41.27 
 
 
259 aa  47.8  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0187217  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2467  extracellular solute-binding protein  26.71 
 
 
523 aa  47.8  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000299001 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  34.27 
 
 
372 aa  47.4  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2734  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.79 
 
 
300 aa  47.4  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.230692  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1510  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.51 
 
 
307 aa  47.4  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.360333  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4849  spore cortex-lytic enzyme  39.68 
 
 
228 aa  47  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>