More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1886 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1886  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 		 635 aa  1289    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2188  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  41.71 
 
 		 549 aa  374  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3286  NLP/P60 protein  29.75 
 
 		 450 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3133  NLP/P60 protein  34.56 
 
 		 454 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000296935  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1440  SpoIID/LytB domain-containing protein  32.85 
 
 		 762 aa  146  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1246  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.38 
 
 		 508 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.07 
 
 		 391 aa  108  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1959  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.8 
 
 		 487 aa  107  7e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315261  normal  0.0108797 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  29.81 
 
 		 372 aa  96.3  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1960  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.01 
 
 		 360 aa  91.7  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1166  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.5 
 
 		 412 aa  91.3  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.462294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0960  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.56 
 
 		 575 aa  90.9  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.538106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1816  NLP/P60 protein  38.21 
 
 		 859 aa  82  0.00000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5194  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 306 aa  81.3  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00951194  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  34.78 
 
 		 265 aa  80.9  0.00000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09540  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  32.31 
 
 		 280 aa  79.7  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623217  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2153  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.48 
 
 		 319 aa  79.3  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000738312  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8103  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  37.82 
 
 		 393 aa  78.6  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 257 aa  78.6  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  37.76 
 
 		 340 aa  77.8  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0221  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  27.86 
 
 		 447 aa  77.8  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0446157  normal  0.633026 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1768  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 325 aa  77  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2151  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.8 
 
 		 306 aa  75.9  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0511643  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39690  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.06 
 
 		 382 aa  76.3  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  36.75 
 
 		 417 aa  75.5  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2136  NLP/P60 protein  33.94 
 
 		 389 aa  75.5  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000118144  normal  0.895402 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3648  NLP/P60 protein  37.1 
 
 		 391 aa  75.1  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3050  NLP/P60 protein  39.09 
 
 		 227 aa  74.3  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4538  cell wall hydrolase/autolysin  31.52 
 
 		 438 aa  73.6  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5193  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.98 
 
 		 356 aa  73.6  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000362844  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4755  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.86 
 
 		 269 aa  72.4  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.15503  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  34.13 
 
 		 333 aa  72.8  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1518  hypothetical protein  33.84 
 
 		 241 aa  72  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5192  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.31 
 
 		 322 aa  72  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000000016794  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7088  cell wall hydrolase/autolysin  33.09 
 
 		 379 aa  71.6  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0968  stage II sporulation D domain-containing protein  38.85 
 
 		 462 aa  70.9  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00176967  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7330  cell wall hydrolase/autolysin  32.4 
 
 		 409 aa  70.9  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.680147  normal  0.468389 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2844  NLP/P60 protein  40.19 
 
 		 259 aa  70.1  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  35.21 
 
 		 334 aa  69.7  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 452 aa  70.1  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1159  NLP/P60 protein  34.4 
 
 		 210 aa  69.7  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.944138  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  31.39 
 
 		 340 aa  69.7  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  37.5 
 
 		 366 aa  69.7  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2150  cell wall hydrolase/autolysin  30.41 
 
 		 378 aa  69.7  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  25.5 
 
 		 232 aa  68.9  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0773  NLP/P60 protein  36.19 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0385  NLP/P60 protein  33.64 
 
 		 360 aa  67.8  0.0000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2429  NLP/P60 protein  37.38 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.328079 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3237  NLP/P60 protein  42.11 
 
 		 380 aa  67.4  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00058739  hitchhiker  0.000426733 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  33.1 
 
 		 150 aa  67.4  0.0000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  43.43 
 
 		 348 aa  67  0.0000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0883  NLP/P60 protein  42.53 
 
 		 257 aa  66.6  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.201792 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  34.48 
 
 		 459 aa  65.9  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  32.98 
 
 		 378 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4528  NLP/P60 protein  36.45 
 
 		 370 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  35.42 
 
 		 321 aa  65.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1016  NlpC/P60 family protein  34.19 
 
 		 446 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000775164  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2684  NLP/P60 protein  34.02 
 
 		 232 aa  65.1  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.708971  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  33.61 
 
 		 391 aa  65.5  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4855  cell wall hydrolase/autolysin  35.34 
 
 		 396 aa  65.1  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1554  NLP/P60  33.33 
 
 		 208 aa  65.1  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.68889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10024  hypothetical protein  35.05 
 
 		 281 aa  65.1  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  36.54 
 
 		 306 aa  64.7  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  38.18 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  31.63 
 
 		 378 aa  64.3  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3579  NLP/P60 protein  29.41 
 
 		 323 aa  64.3  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  28.17 
 
 		 162 aa  63.9  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  32.97 
 
 		 372 aa  63.9  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  32.97 
 
 		 372 aa  63.9  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1435  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.71 
 
 		 363 aa  63.9  0.000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2294  cell wall hydrolase/autolysin  35.38 
 
 		 358 aa  63.9  0.000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1657  cell wall-associated hydrolase  30.71 
 
 		 186 aa  63.9  0.000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.388437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  29.84 
 
 		 337 aa  63.9  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2749  NLP/P60 protein  32.14 
 
 		 378 aa  63.9  0.000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  32 
 
 		 424 aa  63.5  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2152  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  38.1 
 
 		 356 aa  63.2  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000936807  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  27.07 
 
 		 235 aa  63.5  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0896  Peptidase M23  34.43 
 
 		 352 aa  63.5  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 319 aa  63.5  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6766  NLP/P60 protein  30.88 
 
 		 350 aa  63.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4570  NLP/P60 protein  39.13 
 
 		 363 aa  63.5  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  28.46 
 
 		 333 aa  63.2  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1812  NLP/P60 family protein  33.06 
 
 		 420 aa  63.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000382267  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1787  NLP/P60 family protein  33.06 
 
 		 420 aa  62.8  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000289825  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1769  NLP/P60 family protein  33.06 
 
 		 420 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000165376  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  33.06 
 
 		 331 aa  62.8  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1952  NLP/P60 family protein  33.06 
 
 		 420 aa  63.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000344583  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0023  NLP/P60 protein  31.25 
 
 		 164 aa  62.8  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371839  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1988  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  33.06 
 
 		 420 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.1332199999999997e-59 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3713  NLP/P60 protein  39.13 
 
 		 348 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0888  NLP/P60 protein  37.62 
 
 		 363 aa  63.2  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2808  NLP/P60 protein  39.13 
 
 		 348 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5350  NLP/P60 protein  39.13 
 
 		 348 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13270  hypothetical protein  38.2 
 
 		 389 aa  62.4  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.265233  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2037  NLP/P60 family protein  33.06 
 
 		 426 aa  62.4  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000532667  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3369  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  33.06 
 
 		 432 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000232864  unclonable  2.00404e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2059  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  33.06 
 
 		 426 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000850665  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 317 aa  62  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5314  putative cell wall endopeptidase, NlpC/P60 family  31.62 
 
 		 473 aa  62.4  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00085857  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0570  NLP/P60 protein  31.62 
 
 		 160 aa  62  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>