More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2188 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2188  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  100 
 
 		 549 aa  1109    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3286  NLP/P60 protein  30.28 
 
 		 450 aa  176  7e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3133  NLP/P60 protein  27.87 
 
 		 454 aa  153  7e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000296935  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1886  peptidoglycan binding domain-containing protein  54.92 
 
 		 635 aa  145  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1440  SpoIID/LytB domain-containing protein  29.57 
 
 		 762 aa  110  8.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1246  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.17 
 
 		 508 aa  110  9.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1959  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.67 
 
 		 487 aa  102  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315261  normal  0.0108797 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.22 
 
 		 391 aa  90.1  9e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  30.35 
 
 		 372 aa  89  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  29.13 
 
 		 232 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1816  NLP/P60 protein  38.36 
 
 		 859 aa  84.7  0.000000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2700  NLP/P60 protein  37.6 
 
 		 188 aa  79  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000637216  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1960  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.69 
 
 		 360 aa  77  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0960  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.71 
 
 		 575 aa  76.6  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.538106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0751  NLP/P60 protein  34.13 
 
 		 173 aa  75.5  0.000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  35.54 
 
 		 417 aa  74.7  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1166  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.75 
 
 		 412 aa  74.3  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.462294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2136  NLP/P60 protein  34.58 
 
 		 389 aa  73.2  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000118144  normal  0.895402 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1892  NLP/P60 protein  40.8 
 
 		 319 aa  73.2  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1518  hypothetical protein  35.81 
 
 		 241 aa  73.6  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  35.2 
 
 		 424 aa  72.4  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  35.07 
 
 		 183 aa  72.4  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 452 aa  72  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 341 aa  71.6  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4755  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.4 
 
 		 269 aa  71.6  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.15503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1768  NLP/P60 protein  30.58 
 
 		 325 aa  71.2  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  35.37 
 
 		 255 aa  71.6  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1652  NLP/P60 protein  33.86 
 
 		 178 aa  71.2  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  36.73 
 
 		 340 aa  70.9  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09540  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  31.51 
 
 		 280 aa  70.1  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623217  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1956  NLP/P60 protein  33.59 
 
 		 296 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  35.43 
 
 		 216 aa  69.7  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3237  NLP/P60 protein  39.18 
 
 		 380 aa  68.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00058739  hitchhiker  0.000426733 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  32.03 
 
 		 338 aa  68.9  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2128  NLP/P60 protein  34.38 
 
 		 235 aa  68.6  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00187925  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  39.45 
 
 		 204 aa  68.6  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2028  NLP/P60 protein  33.6 
 
 		 233 aa  68.2  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  34.17 
 
 		 162 aa  67.8  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13270  hypothetical protein  37.62 
 
 		 389 aa  67.4  0.0000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.265233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0385  NLP/P60 protein  35.65 
 
 		 360 aa  67.4  0.0000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  31.78 
 
 		 332 aa  67.4  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  35.09 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7088  cell wall hydrolase/autolysin  31.54 
 
 		 379 aa  67.4  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2153  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.46 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000738312  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0828  NLP/P60 protein  32.31 
 
 		 240 aa  67  0.0000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000898283  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2150  cell wall hydrolase/autolysin  31.72 
 
 		 378 aa  67  0.0000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0781  NLP/P60 protein  34.96 
 
 		 260 aa  67  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110248 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  30.15 
 
 		 438 aa  67  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 378 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  31.88 
 
 		 334 aa  65.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5403  cell wall hydrolase/autolysin  32.39 
 
 		 383 aa  65.9  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3050  NLP/P60 protein  38.54 
 
 		 227 aa  66.2  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0388  NLP/P60  33.6 
 
 		 170 aa  65.5  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.815605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  33.06 
 
 		 224 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5194  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.37 
 
 		 306 aa  65.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00951194  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10024  hypothetical protein  32.69 
 
 		 281 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  31.11 
 
 		 388 aa  65.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  32.41 
 
 		 378 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8103  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  31.37 
 
 		 393 aa  65.1  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1159  NLP/P60 protein  32.31 
 
 		 210 aa  65.5  0.000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.944138  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  32.14 
 
 		 388 aa  65.1  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2446  NLP/P60 protein  32.03 
 
 		 208 aa  65.1  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6069  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.1 
 
 		 395 aa  65.5  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123389 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39690  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.85 
 
 		 382 aa  65.1  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0265  NlpC/P60 family protein  35.9 
 
 		 432 aa  64.7  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.894472  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4581  cell wall hydrolase/autolysin  32.85 
 
 		 392 aa  64.7  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170729 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0837  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.72 
 
 		 395 aa  64.7  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.265707  normal  0.357261 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5099  cell wall hydrolase/autolysin  32.12 
 
 		 387 aa  64.3  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000380245 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0091  NLP/P60  31.5 
 
 		 170 aa  64.7  0.000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1493  NLP/P60 protein  34.45 
 
 		 418 aa  64.3  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000786314  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2195  NLP/P60 protein  30.33 
 
 		 168 aa  64.3  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3648  NLP/P60 protein  28.68 
 
 		 391 aa  64.3  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  32.23 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2017  NLP/P60 protein  30.43 
 
 		 536 aa  64.3  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.474847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7330  cell wall hydrolase/autolysin  34.82 
 
 		 409 aa  63.9  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.680147  normal  0.468389 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3298  NLP/P60 protein  32.67 
 
 		 372 aa  64.3  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.154902 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  33.06 
 
 		 459 aa  63.9  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  32.67 
 
 		 372 aa  63.9  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  32.67 
 
 		 372 aa  63.9  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  34.51 
 
 		 342 aa  63.9  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1250  NLP/P60 protein  31.67 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000552171  normal  0.790948 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  34.51 
 
 		 342 aa  63.5  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2420  NLP/P60 protein  33.06 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4538  cell wall hydrolase/autolysin  34.71 
 
 		 438 aa  63.5  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  33.33 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 150 aa  63.5  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  32.81 
 
 		 150 aa  63.5  0.000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  34.43 
 
 		 208 aa  63.2  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2684  NLP/P60 protein  31.9 
 
 		 232 aa  62.8  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.708971  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1380  NLP/P60 protein  41.11 
 
 		 343 aa  63.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  32.48 
 
 		 234 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0274  SagA protein  35.04 
 
 		 432 aa  63.2  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1435  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.8 
 
 		 363 aa  63.2  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1016  NlpC/P60 family protein  33.06 
 
 		 446 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000775164  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  30.7 
 
 		 337 aa  62  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  28.25 
 
 		 221 aa  62  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4855  cell wall hydrolase/autolysin  31.76 
 
 		 396 aa  62.4  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0747  NLP/P60 protein  34.65 
 
 		 298 aa  62.4  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000792578  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>