83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4755 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4755  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 
269 aa  537  9.999999999999999e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.15503  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5126  peptidoglycan-binding domain 1 protein  51 
 
 
200 aa  186  4e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.283972  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1960  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.76 
 
 
360 aa  94  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0221  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  42.11 
 
 
447 aa  92.4  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0446157  normal  0.633026 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2755  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.58 
 
 
170 aa  85.5  8e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1440  SpoIID/LytB domain-containing protein  34.15 
 
 
762 aa  83.6  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2151  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.52 
 
 
306 aa  79.7  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0511643  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1246  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.42 
 
 
508 aa  77  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3286  NLP/P60 protein  40.97 
 
 
450 aa  77  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3133  NLP/P60 protein  35.81 
 
 
454 aa  75.5  0.0000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000296935  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0968  stage II sporulation D domain-containing protein  40.29 
 
 
462 aa  74.7  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00176967  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1886  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.86 
 
 
635 aa  72.8  0.000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2188  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.05 
 
 
549 aa  72  0.000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5194  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.81 
 
 
306 aa  72  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00951194  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  37.14 
 
 
372 aa  70.1  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0528  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.2 
 
 
334 aa  69.3  0.00000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0960  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.9 
 
 
575 aa  67.4  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.538106  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1166  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.3 
 
 
412 aa  67  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.462294  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.51 
 
 
391 aa  63.9  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2153  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.61 
 
 
319 aa  61.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000738312  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4788  peptidoglycan binding domain-containing protein  40 
 
 
163 aa  60.1  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.907058  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5403  cell wall hydrolase/autolysin  33.78 
 
 
383 aa  58.9  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2152  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.25 
 
 
356 aa  58.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000936807  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2804  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.1 
 
 
364 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0769202  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1831  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.85 
 
 
323 aa  58.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11630  metalloendopeptidase-like membrane protein  34.83 
 
 
323 aa  57.4  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5192  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.78 
 
 
322 aa  55.5  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000000016794  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0267  peptidoglycan binding domain-containing protein  49.15 
 
 
317 aa  55.8  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252847  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4396  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.81 
 
 
313 aa  55.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000949071 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2294  cell wall hydrolase/autolysin  35.66 
 
 
358 aa  55.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09540  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  49.18 
 
 
280 aa  54.7  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623217  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3994  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.77 
 
 
266 aa  54.7  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.552337  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4565  Transglycosylase domain protein  51.79 
 
 
224 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.651995  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0056  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.29 
 
 
160 aa  53.9  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1970  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.24 
 
 
160 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.607803 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0896  Peptidase M23  40.16 
 
 
352 aa  53.1  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1953  cell wall hydrolase, SleB  45 
 
 
234 aa  52.4  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1959  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.87 
 
 
487 aa  52  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315261  normal  0.0108797 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03060  Spore cortex-lytic enzyme SleB  49.21 
 
 
239 aa  50.8  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4538  cell wall hydrolase/autolysin  32.12 
 
 
438 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2150  cell wall hydrolase/autolysin  32.91 
 
 
378 aa  50.1  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7088  cell wall hydrolase/autolysin  33.1 
 
 
379 aa  49.7  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3619  cell wall hydrolase/autolysin  25.35 
 
 
313 aa  49.7  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.802629  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39690  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.17 
 
 
382 aa  49.3  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0945  peptidoglycan-binding domain 1 protein  43.55 
 
 
260 aa  49.3  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.572838  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0199  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.65 
 
 
266 aa  49.3  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691121  normal  0.116846 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  42.86 
 
 
324 aa  48.9  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37540  PG-binding-1 domain-containing protein  43.55 
 
 
276 aa  48.9  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.111379  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  42.19 
 
 
232 aa  48.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7330  cell wall hydrolase/autolysin  33.33 
 
 
409 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.680147  normal  0.468389 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1560  spore cortex-lytic enzyme  45.45 
 
 
225 aa  47.4  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2464  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.07 
 
 
201 aa  47.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000202368  normal  0.0272444 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0756  hypothetical protein  41.94 
 
 
204 aa  48.1  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.444213  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1663  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  38.82 
 
 
283 aa  47.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4855  cell wall hydrolase/autolysin  34.19 
 
 
396 aa  46.6  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4844  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.18 
 
 
266 aa  46.6  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.38175  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5193  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.89 
 
 
356 aa  47  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000362844  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5099  cell wall hydrolase/autolysin  31.76 
 
 
387 aa  46.6  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000380245 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3195  cell wall hydrolase, SleB  44.44 
 
 
234 aa  46.2  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3376  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.06 
 
 
283 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.135987 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1188  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.97 
 
 
321 aa  45.8  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0042  spore cortex-lytic enzyme  47.69 
 
 
228 aa  45.8  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.415977  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0730  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.34 
 
 
1089 aa  45.8  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1518  hypothetical protein  28.75 
 
 
241 aa  45.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4581  cell wall hydrolase/autolysin  31.29 
 
 
392 aa  45.4  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170729 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0330  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  40 
 
 
792 aa  45.4  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3152  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.06 
 
 
288 aa  45.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.396034  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1225  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  41.54 
 
 
234 aa  45.4  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6248  NLP/P60 protein  32.81 
 
 
285 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0809629  normal  0.153407 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1949  cell wall hydrolase, SleB  34.78 
 
 
224 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000201814  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  44.19 
 
 
370 aa  43.9  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1832  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  29.93 
 
 
379 aa  43.9  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4849  spore cortex-lytic enzyme  40.91 
 
 
228 aa  43.9  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1726  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  45.31 
 
 
224 aa  43.5  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0528889  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2457  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.95 
 
 
294 aa  43.1  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.156102  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1435  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.79 
 
 
363 aa  43.1  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  45.31 
 
 
433 aa  43.1  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05880  cell wall hydrolase SleB  37.14 
 
 
229 aa  43.1  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.84059e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04480  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  41.18 
 
 
422 aa  43.1  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.38395  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2734  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.78 
 
 
300 aa  42.7  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.230692  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0039  spore cortex-lytic enzyme  41.94 
 
 
242 aa  42.7  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0607  cell wall hydrolase, SleB  41.94 
 
 
236 aa  42.4  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5086  cell wall hydrolase/autolysin  32.45 
 
 
383 aa  42.4  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>