173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2153 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2153  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 
319 aa  642    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000738312  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5192  peptidoglycan binding domain-containing protein  71.3 
 
 
322 aa  461  9.999999999999999e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000000016794  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2151  peptidoglycan binding domain-containing protein  53.42 
 
 
306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0511643  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5194  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.75 
 
 
306 aa  119  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00951194  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0968  stage II sporulation D domain-containing protein  49.23 
 
 
462 aa  117  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00176967  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2152  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  42.96 
 
 
356 aa  118  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000936807  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5193  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  40.88 
 
 
356 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000362844  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11630  metalloendopeptidase-like membrane protein  45.38 
 
 
323 aa  105  7e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  46.27 
 
 
372 aa  103  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2464  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.89 
 
 
201 aa  92.4  8e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000202368  normal  0.0272444 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1970  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.44 
 
 
160 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.607803 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1831  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  42.74 
 
 
323 aa  90.5  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  41.26 
 
 
391 aa  90.1  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3182  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  38.81 
 
 
375 aa  87.8  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00209082 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2755  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.88 
 
 
170 aa  81.6  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2804  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.53 
 
 
364 aa  80.1  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0769202  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3994  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.66 
 
 
266 aa  79  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.552337  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1886  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.48 
 
 
635 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0056  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.1 
 
 
160 aa  77  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0528  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.05 
 
 
334 aa  73.6  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0037  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.97 
 
 
332 aa  72.8  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0221  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.1 
 
 
447 aa  72.8  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0446157  normal  0.633026 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2294  cell wall hydrolase/autolysin  35.21 
 
 
358 aa  70.9  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4701  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  28.83 
 
 
329 aa  70.9  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.997176  normal  0.841569 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1832  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.69 
 
 
379 aa  68.9  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5145  Transglycosylase domain protein  28.48 
 
 
317 aa  68.2  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0960  peptidoglycan binding domain-containing protein  32 
 
 
575 aa  68.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.538106  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03950  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  29.03 
 
 
303 aa  68.2  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.759104 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4980  peptidoglycan binding domain-containing protein  53.85 
 
 
128 aa  67.8  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18550  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  56.36 
 
 
225 aa  67.4  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1960  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.97 
 
 
360 aa  67  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2188  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.46 
 
 
549 aa  67  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  56.36 
 
 
2277 aa  66.6  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7330  cell wall hydrolase/autolysin  36.89 
 
 
409 aa  66.2  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.680147  normal  0.468389 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2284  peptidoglycan binding domain-containing protein  49.21 
 
 
198 aa  66.2  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.586079  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1166  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.12 
 
 
412 aa  65.1  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.462294  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3286  NLP/P60 protein  31.63 
 
 
450 aa  64.7  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7088  cell wall hydrolase/autolysin  31.47 
 
 
379 aa  64.3  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0730  peptidoglycan binding domain-containing protein  51.72 
 
 
1089 aa  63.9  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3185  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  29.79 
 
 
193 aa  63.9  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00515387  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0581  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  29.91 
 
 
330 aa  63.5  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000627689  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1518  hypothetical protein  39.45 
 
 
241 aa  62  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4755  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.61 
 
 
269 aa  61.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.15503  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4855  cell wall hydrolase/autolysin  33.33 
 
 
396 aa  61.6  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6248  NLP/P60 protein  52.38 
 
 
285 aa  61.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0809629  normal  0.153407 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0032  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.43 
 
 
323 aa  60.5  0.00000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0729  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  48.39 
 
 
532 aa  59.7  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4396  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.94 
 
 
313 aa  59.3  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000949071 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09540  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  53.97 
 
 
280 aa  59.3  0.00000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623217  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2175  spore cortex-lytic enzyme  33.33 
 
 
270 aa  59.3  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30050  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  29.02 
 
 
246 aa  59.3  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0031896  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1246  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.12 
 
 
508 aa  58.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4538  cell wall hydrolase/autolysin  35.92 
 
 
438 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0896  Peptidase M23  37.1 
 
 
352 aa  58.9  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0085  peptidoglycan binding domain-containing protein  40 
 
 
143 aa  57.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2150  cell wall hydrolase/autolysin  39.22 
 
 
378 aa  57.8  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3619  cell wall hydrolase/autolysin  35.14 
 
 
313 aa  57.8  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.802629  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39690  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.78 
 
 
382 aa  58.2  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1435  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.17 
 
 
363 aa  57.8  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0199  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.94 
 
 
266 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691121  normal  0.116846 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3133  NLP/P60 protein  31.65 
 
 
454 aa  57  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000296935  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03060  Spore cortex-lytic enzyme SleB  49.21 
 
 
239 aa  57  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37540  PG-binding-1 domain-containing protein  41.25 
 
 
276 aa  57  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.111379  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1663  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  33.57 
 
 
283 aa  55.8  0.0000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4581  cell wall hydrolase/autolysin  31.47 
 
 
392 aa  55.8  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170729 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0285  hypothetical protein  44.64 
 
 
292 aa  55.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05880  cell wall hydrolase SleB  41.77 
 
 
229 aa  55.5  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.84059e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.13 
 
 
422 aa  55.5  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2734  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.08 
 
 
300 aa  54.7  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.230692  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1654  peptidoglycan binding domain-containing protein  45 
 
 
974 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00486103  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13950  hydrolase  35.78 
 
 
406 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1443  Zinc D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.46 
 
 
242 aa  55.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5099  cell wall hydrolase/autolysin  32.87 
 
 
387 aa  54.3  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000380245 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1188  peptidoglycan binding domain-containing protein  49.18 
 
 
321 aa  54.3  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2356  glycoside hydrolase family 25  41.51 
 
 
297 aa  54.3  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000423175  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6069  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.7 
 
 
395 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.123389 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0837  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.15 
 
 
395 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.265707  normal  0.357261 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2826  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.73 
 
 
554 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5404  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.25 
 
 
398 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0267  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.65 
 
 
317 aa  53.9  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252847  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5493  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.25 
 
 
398 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal  0.340156 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5780  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.25 
 
 
398 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.103235  normal  0.0225993 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3571  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.1 
 
 
274 aa  53.9  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0042  spore cortex-lytic enzyme  47.62 
 
 
228 aa  53.5  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.415977  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1440  SpoIID/LytB domain-containing protein  30 
 
 
762 aa  53.5  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4234  cell wall hydrolase/autolysin  31.68 
 
 
395 aa  53.5  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4844  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.62 
 
 
266 aa  53.1  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.38175  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2916  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  42.86 
 
 
864 aa  53.1  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.260808  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5403  cell wall hydrolase/autolysin  32.74 
 
 
383 aa  52.8  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2387  gamma-D-glutamyl-{L}-meso-diaminopimelate peptidase I. metallo peptidase. MEROPS family M14C  42.67 
 
 
423 aa  52.4  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3497  peptidoglycan-binding domain 1 protein  41.54 
 
 
182 aa  52.4  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1897  spore cortex-lytic enzyme SleB  39.73 
 
 
247 aa  52  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0572878  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0939  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.58 
 
 
310 aa  52  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1197  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.11 
 
 
667 aa  52.4  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  41.94 
 
 
324 aa  52  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1726  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  48.39 
 
 
224 aa  51.2  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0528889  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1872  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.94 
 
 
268 aa  51.6  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.322765  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3186  hypothetical protein  43.4 
 
 
256 aa  50.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1959  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.99 
 
 
487 aa  50.8  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315261  normal  0.0108797 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  35.71 
 
 
232 aa  51.2  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>